MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 37720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009486	CAC	2	6	254310	254315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269411
5502	NC_009486	TC	3	6	254472	254477	0 %	50 %	0 %	50 %	148269411
5503	NC_009486	AAAG	2	8	254613	254620	75 %	0 %	25 %	0 %	148269411
5504	NC_009486	CTC	2	6	254626	254631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269411
5505	NC_009486	TCC	2	6	254641	254646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269411
5506	NC_009486	G	6	6	254864	254869	0 %	0 %	100 %	0 %	148269412
5507	NC_009486	TTC	2	6	254871	254876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269412
5508	NC_009486	GAA	2	6	254909	254914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269412
5509	NC_009486	CTAC	2	8	254930	254937	25 %	25 %	0 %	50 %	148269412
5510	NC_009486	CG	3	6	254945	254950	0 %	0 %	50 %	50 %	148269412
5511	NC_009486	GAA	2	6	254977	254982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269412
5512	NC_009486	TATCA	2	10	255010	255019	40 %	40 %	0 %	20 %	148269412
5513	NC_009486	AG	3	6	255032	255037	50 %	0 %	50 %	0 %	148269412
5514	NC_009486	TCT	2	6	255104	255109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269412
5515	NC_009486	G	7	7	255110	255116	0 %	0 %	100 %	0 %	148269412
5516	NC_009486	ACG	2	6	255191	255196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269413
5517	NC_009486	CTG	2	6	255202	255207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269413
5518	NC_009486	TTC	2	6	255241	255246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269413
5519	NC_009486	GAG	2	6	255247	255252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269413
5520	NC_009486	GGA	2	6	255272	255277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269413
5521	NC_009486	CTG	2	6	255289	255294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269413
5522	NC_009486	GAC	2	6	255331	255336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269413
5523	NC_009486	CTTT	2	8	255375	255382	0 %	75 %	0 %	25 %	148269413
5524	NC_009486	T	7	7	255380	255386	0 %	100 %	0 %	0 %	148269413
5525	NC_009486	TGG	2	6	255416	255421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269413
5526	NC_009486	CTC	2	6	255445	255450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269413
5527	NC_009486	TGA	2	6	255473	255478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269413
5528	NC_009486	GT	3	6	255485	255490	0 %	50 %	50 %	0 %	148269413
5529	NC_009486	GAAA	2	8	255527	255534	75 %	0 %	25 %	0 %	148269413
5530	NC_009486	AGA	2	6	255535	255540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269413
5531	NC_009486	ACG	2	6	255662	255667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269413
5532	NC_009486	TGT	2	6	255675	255680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269413
5533	NC_009486	GAA	2	6	255699	255704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269413
5534	NC_009486	CAG	2	6	255818	255823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269413
5535	NC_009486	AAG	2	6	255824	255829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269413
5536	NC_009486	CTGG	2	8	255837	255844	0 %	25 %	50 %	25 %	148269413
5537	NC_009486	TC	3	6	255874	255879	0 %	50 %	0 %	50 %	148269413
5538	NC_009486	T	6	6	255892	255897	0 %	100 %	0 %	0 %	148269413
5539	NC_009486	GAA	2	6	256023	256028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269413
5540	NC_009486	CCTT	2	8	256076	256083	0 %	50 %	0 %	50 %	148269413
5541	NC_009486	AGA	2	6	256105	256110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269413
5542	NC_009486	TCT	2	6	256140	256145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269413
5543	NC_009486	TTCG	2	8	256198	256205	0 %	50 %	25 %	25 %	148269413
5544	NC_009486	ACC	2	6	256211	256216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269413
5545	NC_009486	TC	3	6	256284	256289	0 %	50 %	0 %	50 %	148269413
5546	NC_009486	AC	3	6	256320	256325	50 %	0 %	0 %	50 %	148269413
5547	NC_009486	CGA	2	6	256368	256373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269413
5548	NC_009486	GAAC	2	8	256581	256588	50 %	0 %	25 %	25 %	148269413
5549	NC_009486	TCG	2	6	256637	256642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269413
5550	NC_009486	AG	3	6	256732	256737	50 %	0 %	50 %	0 %	148269414
5551	NC_009486	AGG	2	6	256805	256810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269414
5552	NC_009486	GCTC	2	8	256969	256976	0 %	25 %	25 %	50 %	148269415
5553	NC_009486	TCC	2	6	256991	256996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269415
5554	NC_009486	CCT	2	6	257014	257019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269415
5555	NC_009486	ACC	2	6	257057	257062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269415
5556	NC_009486	GAT	2	6	257086	257091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269415
5557	NC_009486	GCA	2	6	257169	257174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269415
5558	NC_009486	AGA	2	6	257214	257219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269415
5559	NC_009486	AG	3	6	257269	257274	50 %	0 %	50 %	0 %	148269415
5560	NC_009486	TGA	2	6	257331	257336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269415
5561	NC_009486	AGAA	2	8	257341	257348	75 %	0 %	25 %	0 %	148269415
5562	NC_009486	TTCCT	2	10	257380	257389	0 %	60 %	0 %	40 %	148269415
5563	NC_009486	CTC	2	6	257422	257427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269415
5564	NC_009486	CT	3	6	257435	257440	0 %	50 %	0 %	50 %	148269415
5565	NC_009486	CT	3	6	257469	257474	0 %	50 %	0 %	50 %	148269415
5566	NC_009486	AGA	2	6	257477	257482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269415
5567	NC_009486	TC	3	6	257490	257495	0 %	50 %	0 %	50 %	148269415
5568	NC_009486	T	6	6	257496	257501	0 %	100 %	0 %	0 %	148269415
5569	NC_009486	CTT	2	6	257508	257513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269415
5570	NC_009486	CTT	2	6	257517	257522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269415
5571	NC_009486	CTT	2	6	257551	257556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269415
5572	NC_009486	CTT	2	6	257583	257588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269415
5573	NC_009486	CT	3	6	257633	257638	0 %	50 %	0 %	50 %	148269415
5574	NC_009486	GAAG	2	8	257639	257646	50 %	0 %	50 %	0 %	148269415
5575	NC_009486	CTT	2	6	257653	257658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269415
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5580	NC_009486	CTT	2	6	257849	257854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269415
5581	NC_009486	TGCCT	2	10	257876	257885	0 %	40 %	20 %	40 %	148269415
5582	NC_009486	AAG	2	6	257887	257892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269415
5583	NC_009486	ATCTCG	2	12	257911	257922	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148269416
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5585	NC_009486	CACTCT	2	12	258072	258083	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148269416
5586	NC_009486	CAC	2	6	258084	258089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269416
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5589	NC_009486	ACA	2	6	258199	258204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269416
5590	NC_009486	GTCT	2	8	258239	258246	0 %	50 %	25 %	25 %	148269416
5591	NC_009486	CT	3	6	258251	258256	0 %	50 %	0 %	50 %	148269416
5592	NC_009486	GGC	2	6	258282	258287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148269416
5593	NC_009486	GAAG	2	8	258321	258328	50 %	0 %	50 %	0 %	148269416
5594	NC_009486	TTC	2	6	258331	258336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269416
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5596	NC_009486	CT	3	6	258348	258353	0 %	50 %	0 %	50 %	148269416
5597	NC_009486	TC	3	6	258362	258367	0 %	50 %	0 %	50 %	148269416
5598	NC_009486	TTC	2	6	258387	258392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269416
5599	NC_009486	TCA	2	6	258452	258457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269416
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5601	NC_009486	AGG	2	6	258516	258521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269416
5602	NC_009486	GAGG	2	8	258528	258535	25 %	0 %	75 %	0 %	148269416
5603	NC_009486	CGTG	2	8	258584	258591	0 %	25 %	50 %	25 %	148269416
5604	NC_009486	GAT	2	6	258597	258602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269416
5605	NC_009486	ATC	2	6	258688	258693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269416
5606	NC_009486	TCC	2	6	258871	258876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269417
5607	NC_009486	GTC	2	6	258906	258911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269417
5608	NC_009486	CTT	2	6	259005	259010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269417
5609	NC_009486	CTCAC	2	10	259018	259027	20 %	20 %	0 %	60 %	148269418
5610	NC_009486	GAA	2	6	259240	259245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269418
5611	NC_009486	TGT	2	6	259273	259278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269418
5612	NC_009486	T	6	6	259333	259338	0 %	100 %	0 %	0 %	148269418
5613	NC_009486	CTT	2	6	259378	259383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269418
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5619	NC_009486	TTC	2	6	259651	259656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269419
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5622	NC_009486	CTCTG	2	10	259847	259856	0 %	40 %	20 %	40 %	148269419
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