MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 37720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009486	CCG	2	6	232861	232866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148269387
5002	NC_009486	TCC	2	6	232877	232882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269387
5003	NC_009486	TCG	2	6	232959	232964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269387
5004	NC_009486	CATC	2	8	233063	233070	25 %	25 %	0 %	50 %	148269387
5005	NC_009486	CGT	2	6	233083	233088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269387
5006	NC_009486	CTT	2	6	233102	233107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269387
5007	NC_009486	TCT	2	6	233125	233130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269387
5008	NC_009486	GAA	2	6	233152	233157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269387
5009	NC_009486	TTTC	2	8	233173	233180	0 %	75 %	0 %	25 %	148269387
5010	NC_009486	GAG	2	6	233189	233194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269387
5011	NC_009486	TCT	2	6	233217	233222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269387
5012	NC_009486	CAT	2	6	233273	233278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269387
5013	NC_009486	TGA	2	6	233323	233328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269387
5014	NC_009486	TC	3	6	233569	233574	0 %	50 %	0 %	50 %	148269387
5015	NC_009486	AGG	2	6	233598	233603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269387
5016	NC_009486	ACTTC	2	10	233671	233680	20 %	40 %	0 %	40 %	148269387
5017	NC_009486	AAG	2	6	233687	233692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269387
5018	NC_009486	GGC	2	6	233819	233824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148269387
5019	NC_009486	GTC	2	6	233837	233842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269387
5020	NC_009486	T	6	6	233929	233934	0 %	100 %	0 %	0 %	148269387
5021	NC_009486	TTC	2	6	233987	233992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269388
5022	NC_009486	GAG	2	6	234000	234005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269388
5023	NC_009486	CGT	2	6	234126	234131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269388
5024	NC_009486	GAT	2	6	234135	234140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269388
5025	NC_009486	GCT	2	6	234144	234149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269388
5026	NC_009486	GAT	2	6	234174	234179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269388
5027	NC_009486	CCTT	2	8	234189	234196	0 %	50 %	0 %	50 %	148269388
5028	NC_009486	CTT	2	6	234203	234208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269388
5029	NC_009486	CTT	2	6	234224	234229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269388
5030	NC_009486	CTTCA	2	10	234321	234330	20 %	40 %	0 %	40 %	148269388
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5032	NC_009486	GAT	2	6	234375	234380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269388
5033	NC_009486	GCT	2	6	234391	234396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269388
5034	NC_009486	CT	3	6	234434	234439	0 %	50 %	0 %	50 %	148269388
5035	NC_009486	TCGT	2	8	234442	234449	0 %	50 %	25 %	25 %	148269388
5036	NC_009486	GAT	2	6	234552	234557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269388
5037	NC_009486	GT	3	6	234559	234564	0 %	50 %	50 %	0 %	148269388
5038	NC_009486	AAC	2	6	234597	234602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269388
5039	NC_009486	TCT	2	6	234610	234615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269388
5040	NC_009486	TGA	3	9	234632	234640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269388
5041	NC_009486	TTC	2	6	234643	234648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269388
5042	NC_009486	GAT	2	6	234789	234794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269388
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5044	NC_009486	CTT	2	6	234831	234836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269388
5045	NC_009486	ACT	2	6	234901	234906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269388
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5047	NC_009486	GAT	2	6	234933	234938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269388
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5050	NC_009486	TCT	2	6	235133	235138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269389
5051	NC_009486	CTC	2	6	235203	235208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269389
5052	NC_009486	CT	3	6	235244	235249	0 %	50 %	0 %	50 %	148269389
5053	NC_009486	T	7	7	235263	235269	0 %	100 %	0 %	0 %	148269389
5054	NC_009486	CTC	2	6	235276	235281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269389
5055	NC_009486	CCCA	2	8	235324	235331	25 %	0 %	0 %	75 %	148269389
5056	NC_009486	TCC	2	6	235339	235344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269389
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5058	NC_009486	TTC	2	6	235421	235426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269390
5059	NC_009486	TCA	2	6	235510	235515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269390
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5062	NC_009486	CGA	2	6	235597	235602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269390
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5105	NC_009486	ATA	2	6	237135	237140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148269391
5106	NC_009486	TGT	2	6	237173	237178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269391
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5108	NC_009486	AAAG	2	8	237212	237219	75 %	0 %	25 %	0 %	148269391
5109	NC_009486	CGG	2	6	237223	237228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148269391
5110	NC_009486	TGG	2	6	237232	237237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269391
5111	NC_009486	TAC	2	6	237375	237380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269391
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5114	NC_009486	TTG	2	6	237540	237545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269392
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5117	NC_009486	ACC	2	6	237603	237608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269392
5118	NC_009486	TTC	2	6	237726	237731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269392
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5120	NC_009486	GTA	2	6	237851	237856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269392
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5122	NC_009486	ATC	2	6	237938	237943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269393
5123	NC_009486	TAT	2	6	237991	237996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269393
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5133	NC_009486	TC	3	6	238663	238668	0 %	50 %	0 %	50 %	148269394
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5139	NC_009486	CTTT	2	8	238967	238974	0 %	75 %	0 %	25 %	148269394
5140	NC_009486	TTTC	2	8	238981	238988	0 %	75 %	0 %	25 %	148269394
5141	NC_009486	GCATT	2	10	239033	239042	20 %	40 %	20 %	20 %	148269394
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5151	NC_009486	T	6	6	239355	239360	0 %	100 %	0 %	0 %	148269394
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5153	NC_009486	AGA	2	6	239407	239412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269394
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5155	NC_009486	GTA	2	6	239460	239465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269394
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5225	NC_009486	C	6	6	242620	242625	0 %	0 %	0 %	100 %	148269398
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5231	NC_009486	CTT	2	6	242805	242810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269398
5232	NC_009486	TCT	3	9	242811	242819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269398
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5234	NC_009486	TTCTC	2	10	242876	242885	0 %	60 %	0 %	40 %	148269399
5235	NC_009486	CTG	2	6	242900	242905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269399
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5237	NC_009486	T	6	6	242921	242926	0 %	100 %	0 %	0 %	148269399
5238	NC_009486	TTCTC	2	10	243136	243145	0 %	60 %	0 %	40 %	148269399
5239	NC_009486	TC	4	8	243142	243149	0 %	50 %	0 %	50 %	148269399
5240	NC_009486	GAAA	2	8	243160	243167	75 %	0 %	25 %	0 %	148269399
5241	NC_009486	CAC	2	6	243170	243175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269399
5242	NC_009486	GCT	2	6	243180	243185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269399
5243	NC_009486	AT	3	6	243215	243220	50 %	50 %	0 %	0 %	148269399
5244	NC_009486	GTC	2	6	243242	243247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269399
5245	NC_009486	GTG	2	6	243276	243281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269399
5246	NC_009486	A	6	6	243356	243361	100 %	0 %	0 %	0 %	148269399
5247	NC_009486	TC	4	8	243396	243403	0 %	50 %	0 %	50 %	148269399
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5250	NC_009486	TTC	2	6	243485	243490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269399
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5253	NC_009486	CTG	2	6	243563	243568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269399
5254	NC_009486	TGG	2	6	243586	243591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269399
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5264	NC_009486	AGAA	2	8	243808	243815	75 %	0 %	25 %	0 %	148269400
5265	NC_009486	T	6	6	243834	243839	0 %	100 %	0 %	0 %	148269400
5266	NC_009486	TCTCT	2	10	243854	243863	0 %	60 %	0 %	40 %	148269400
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5351	NC_009486	TTC	2	6	248001	248006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269404
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5353	NC_009486	CT	3	6	248021	248026	0 %	50 %	0 %	50 %	148269404
5354	NC_009486	GAT	2	6	248164	248169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269404
5355	NC_009486	AG	3	6	248187	248192	50 %	0 %	50 %	0 %	148269404
5356	NC_009486	TTC	2	6	248253	248258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269404
5357	NC_009486	CTG	2	6	248279	248284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269404
5358	NC_009486	TCG	2	6	248344	248349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269404
5359	NC_009486	TG	3	6	248367	248372	0 %	50 %	50 %	0 %	148269404
5360	NC_009486	ATC	2	6	248385	248390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269404
5361	NC_009486	A	7	7	248398	248404	100 %	0 %	0 %	0 %	148269404
5362	NC_009486	CGAA	2	8	248522	248529	50 %	0 %	25 %	25 %	148269404
5363	NC_009486	CTTT	2	8	248542	248549	0 %	75 %	0 %	25 %	148269404
5364	NC_009486	TC	3	6	248581	248586	0 %	50 %	0 %	50 %	148269404
5365	NC_009486	TTC	2	6	248589	248594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269404
5366	NC_009486	TCA	2	6	248677	248682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269404
5367	NC_009486	TCA	2	6	248689	248694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269404
5368	NC_009486	TTC	2	6	248730	248735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269404
5369	NC_009486	ATC	2	6	248760	248765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269404
5370	NC_009486	GTT	2	6	248767	248772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269404
5371	NC_009486	CTT	3	9	248813	248821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269404
5372	NC_009486	TTCT	2	8	248826	248833	0 %	75 %	0 %	25 %	148269404
5373	NC_009486	TCCA	2	8	248871	248878	25 %	25 %	0 %	50 %	148269404
5374	NC_009486	TCA	2	6	248983	248988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269404
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5377	NC_009486	T	6	6	249084	249089	0 %	100 %	0 %	0 %	148269404
5378	NC_009486	AATC	2	8	249104	249111	50 %	25 %	0 %	25 %	148269404
5379	NC_009486	TCA	2	6	249137	249142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269404
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5383	NC_009486	CTG	2	6	249206	249211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269404
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5490	NC_009486	GAT	2	6	253878	253883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269410
5491	NC_009486	TCGAT	2	10	253919	253928	20 %	40 %	20 %	20 %	148269410
5492	NC_009486	TCT	2	6	253940	253945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269410
5493	NC_009486	AAT	2	6	253960	253965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148269410
5494	NC_009486	A	6	6	254018	254023	100 %	0 %	0 %	0 %	148269411
5495	NC_009486	CTC	2	6	254029	254034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269411
5496	NC_009486	GAT	2	6	254085	254090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269411
5497	NC_009486	AG	3	6	254099	254104	50 %	0 %	50 %	0 %	148269411
5498	NC_009486	AGA	2	6	254149	254154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269411
5499	NC_009486	CA	3	6	254258	254263	50 %	0 %	0 %	50 %	148269411
5500	NC_009486	CCA	2	6	254301	254306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269411

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