MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008698	ATC	2	6	164845	164850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719106
3002	NC_008698	CCTC	2	8	164869	164876	0 %	25 %	0 %	75 %	119719106
3003	NC_008698	CCTC	2	8	165088	165095	0 %	25 %	0 %	75 %	119719106
3004	NC_008698	TGA	2	6	165125	165130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719106
3005	NC_008698	CAG	2	6	165135	165140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719106
3006	NC_008698	AAT	2	6	165180	165185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719106
3007	NC_008698	AAGT	2	8	165187	165194	50 %	25 %	25 %	0 %	119719106
3008	NC_008698	CCA	2	6	165236	165241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719106
3009	NC_008698	GA	3	6	165286	165291	50 %	0 %	50 %	0 %	119719106
3010	NC_008698	CGT	2	6	165293	165298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719106
3011	NC_008698	ACC	2	6	165307	165312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719106
3012	NC_008698	AG	3	6	165332	165337	50 %	0 %	50 %	0 %	119719106
3013	NC_008698	AACG	2	8	165423	165430	50 %	0 %	25 %	25 %	119719106
3014	NC_008698	GAA	2	6	165477	165482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719106
3015	NC_008698	GC	3	6	165488	165493	0 %	0 %	50 %	50 %	119719106
3016	NC_008698	GA	3	6	165658	165663	50 %	0 %	50 %	0 %	119719106
3017	NC_008698	A	7	7	165697	165703	100 %	0 %	0 %	0 %	119719106
3018	NC_008698	ATT	2	6	165746	165751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719107
3019	NC_008698	GGC	2	6	165799	165804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719107
3020	NC_008698	CG	3	6	165811	165816	0 %	0 %	50 %	50 %	119719107
3021	NC_008698	ACGC	2	8	165869	165876	25 %	0 %	25 %	50 %	119719107
3022	NC_008698	CA	3	6	165906	165911	50 %	0 %	0 %	50 %	119719107
3023	NC_008698	CCT	2	6	166077	166082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719107
3024	NC_008698	CCT	2	6	166119	166124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719107
3025	NC_008698	GCC	2	6	166274	166279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719107
3026	NC_008698	CTC	2	6	166294	166299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719108
3027	NC_008698	CGT	2	6	166362	166367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719108
3028	NC_008698	CTA	2	6	166404	166409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719108
3029	NC_008698	CGC	2	6	166455	166460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719108
3030	NC_008698	TCG	2	6	166581	166586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719108
3031	NC_008698	TCG	2	6	166640	166645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719108
3032	NC_008698	TGGCG	2	10	166699	166708	0 %	20 %	60 %	20 %	119719108
3033	NC_008698	GGT	2	6	166740	166745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719108
3034	NC_008698	GCC	2	6	166771	166776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719108
3035	NC_008698	TTC	2	6	166784	166789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719108
3036	NC_008698	TCC	2	6	166850	166855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719108
3037	NC_008698	CG	3	6	166857	166862	0 %	0 %	50 %	50 %	119719108
3038	NC_008698	GAA	2	6	166870	166875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719108
3039	NC_008698	TC	3	6	166975	166980	0 %	50 %	0 %	50 %	119719108
3040	NC_008698	CCTT	2	8	166997	167004	0 %	50 %	0 %	50 %	119719108
3041	NC_008698	CTT	2	6	167260	167265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719108
3042	NC_008698	GTT	2	6	167344	167349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719108
3043	NC_008698	CCT	2	6	167379	167384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719108
3044	NC_008698	GTA	2	6	167389	167394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719108
3045	NC_008698	TGC	2	6	167450	167455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719108
3046	NC_008698	GC	3	6	167584	167589	0 %	0 %	50 %	50 %	119719108
3047	NC_008698	TCG	2	6	167594	167599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719108
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3049	NC_008698	AGT	2	6	167712	167717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719108
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3051	NC_008698	GCT	2	6	167861	167866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719108
3052	NC_008698	TGT	2	6	167961	167966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719108
3053	NC_008698	CGAGG	2	10	168028	168037	20 %	0 %	60 %	20 %	119719108
3054	NC_008698	GTT	2	6	168073	168078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719108
3055	NC_008698	CGC	2	6	168566	168571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719109
3056	NC_008698	GCC	2	6	168610	168615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719109
3057	NC_008698	CTGG	2	8	168662	168669	0 %	25 %	50 %	25 %	119719109
3058	NC_008698	CGC	2	6	168719	168724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719109
3059	NC_008698	ATG	2	6	168783	168788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719109
3060	NC_008698	CTG	2	6	168795	168800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719109
3061	NC_008698	TG	3	6	168830	168835	0 %	50 %	50 %	0 %	119719109
3062	NC_008698	CGG	2	6	168839	168844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719109
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3064	NC_008698	TGGG	2	8	168954	168961	0 %	25 %	75 %	0 %	119719109
3065	NC_008698	CGA	2	6	169025	169030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719109
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3071	NC_008698	AGTA	2	8	169404	169411	50 %	25 %	25 %	0 %	119719109
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3073	NC_008698	TAC	2	6	169456	169461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719109
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3087	NC_008698	CTC	3	9	170402	170410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719110
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3091	NC_008698	TAT	2	6	170897	170902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719110
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3101	NC_008698	AGAC	2	8	171916	171923	50 %	0 %	25 %	25 %	119719112
3102	NC_008698	CTC	2	6	172059	172064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719112
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3107	NC_008698	AG	3	6	172665	172670	50 %	0 %	50 %	0 %	119719113
3108	NC_008698	CGTA	2	8	172682	172689	25 %	25 %	25 %	25 %	119719113
3109	NC_008698	GCC	2	6	172720	172725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719113
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3111	NC_008698	TGG	2	6	172763	172768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719113
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3119	NC_008698	CGT	2	6	173145	173150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719113
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3121	NC_008698	AC	3	6	173192	173197	50 %	0 %	0 %	50 %	119719113
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3123	NC_008698	TTC	2	6	173299	173304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719113
3124	NC_008698	GAGTAC	2	12	173317	173328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119719113
3125	NC_008698	TACTC	2	10	173345	173354	20 %	40 %	0 %	40 %	119719113
3126	NC_008698	GGA	2	6	173382	173387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719113
3127	NC_008698	GAG	2	6	173404	173409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719113
3128	NC_008698	TTC	2	6	173461	173466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719113
3129	NC_008698	GAG	2	6	173472	173477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719113
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