MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_008698	ACC	2	6	1664445	1664450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720625
31502	NC_008698	GTA	2	6	1664465	1664470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720625
31503	NC_008698	GTA	2	6	1664501	1664506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720625
31504	NC_008698	TTGC	2	8	1664568	1664575	0 %	50 %	25 %	25 %	119720625
31505	NC_008698	AAG	2	6	1664591	1664596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720625
31506	NC_008698	CGA	2	6	1664614	1664619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720625
31507	NC_008698	ATTT	2	8	1664654	1664661	25 %	75 %	0 %	0 %	119720625
31508	NC_008698	TAC	2	6	1664723	1664728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720625
31509	NC_008698	TCT	2	6	1664753	1664758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720625
31510	NC_008698	CCTTC	2	10	1664828	1664837	0 %	40 %	0 %	60 %	119720625
31511	NC_008698	AGA	2	6	1664931	1664936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720625
31512	NC_008698	AGG	2	6	1664943	1664948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720625
31513	NC_008698	CTG	2	6	1664949	1664954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720625
31514	NC_008698	ACC	2	6	1664962	1664967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720625
31515	NC_008698	TTTA	2	8	1665131	1665138	25 %	75 %	0 %	0 %	119720625
31516	NC_008698	TTC	2	6	1665165	1665170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720625
31517	NC_008698	CAT	2	6	1665184	1665189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720625
31518	NC_008698	GAA	3	9	1665191	1665199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720625
31519	NC_008698	GTA	2	6	1665254	1665259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720625
31520	NC_008698	TA	3	6	1665412	1665417	50 %	50 %	0 %	0 %	119720626
31521	NC_008698	T	7	7	1665426	1665432	0 %	100 %	0 %	0 %	119720626
31522	NC_008698	TCT	2	6	1665482	1665487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720626
31523	NC_008698	GTA	2	6	1665648	1665653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720626
31524	NC_008698	TAC	2	6	1665715	1665720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720626
31525	NC_008698	CTT	2	6	1665742	1665747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720626
31526	NC_008698	CTA	2	6	1665774	1665779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720626
31527	NC_008698	CGT	2	6	1665792	1665797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720626
31528	NC_008698	AAT	2	6	1665826	1665831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720626
31529	NC_008698	TCC	2	6	1665968	1665973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720626
31530	NC_008698	CGC	2	6	1666045	1666050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720626
31531	NC_008698	CTG	2	6	1666116	1666121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720626
31532	NC_008698	AGG	2	6	1666148	1666153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720626
31533	NC_008698	CGT	2	6	1666197	1666202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720626
31534	NC_008698	ACT	2	6	1666238	1666243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720626
31535	NC_008698	GCG	2	6	1666338	1666343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720626
31536	NC_008698	CGC	2	6	1666419	1666424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720626
31537	NC_008698	ATT	2	6	1666485	1666490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720627
31538	NC_008698	CAG	2	6	1666498	1666503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720627
31539	NC_008698	AAT	2	6	1666539	1666544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720627
31540	NC_008698	CT	3	6	1666565	1666570	0 %	50 %	0 %	50 %	119720627
31541	NC_008698	GGT	2	6	1666693	1666698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720627
31542	NC_008698	CGG	2	6	1666724	1666729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720627
31543	NC_008698	CTA	2	6	1666961	1666966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720627
31544	NC_008698	ATG	2	6	1667008	1667013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720627
31545	NC_008698	GCC	2	6	1667088	1667093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720627
31546	NC_008698	ACG	2	6	1667152	1667157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720627
31547	NC_008698	TTC	2	6	1667238	1667243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720627
31548	NC_008698	GTT	2	6	1667313	1667318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720627
31549	NC_008698	TCG	2	6	1667375	1667380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720627
31550	NC_008698	ATC	2	6	1667427	1667432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720627
31551	NC_008698	T	7	7	1667531	1667537	0 %	100 %	0 %	0 %	119720627
31552	NC_008698	GTT	2	6	1667575	1667580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720627
31553	NC_008698	AGT	2	6	1667582	1667587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720627
31554	NC_008698	ATT	2	6	1667599	1667604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720627
31555	NC_008698	TTG	2	6	1667660	1667665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720628
31556	NC_008698	AT	3	6	1667691	1667696	50 %	50 %	0 %	0 %	119720628
31557	NC_008698	TC	3	6	1667741	1667746	0 %	50 %	0 %	50 %	119720628
31558	NC_008698	TCT	2	6	1667777	1667782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720628
31559	NC_008698	GCA	2	6	1667795	1667800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720628
31560	NC_008698	GTA	2	6	1667893	1667898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720628
31561	NC_008698	TGC	2	6	1667901	1667906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720628
31562	NC_008698	GC	3	6	1667905	1667910	0 %	0 %	50 %	50 %	119720628
31563	NC_008698	AGT	2	6	1667912	1667917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720628
31564	NC_008698	GTG	2	6	1667962	1667967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720628
31565	NC_008698	CTA	2	6	1668015	1668020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720628
31566	NC_008698	CCTG	2	8	1668045	1668052	0 %	25 %	25 %	50 %	119720628
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31588	NC_008698	GTC	2	6	1669131	1669136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720629
31589	NC_008698	CTC	2	6	1669156	1669161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720629
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31598	NC_008698	GGT	2	6	1669530	1669535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720630
31599	NC_008698	TCTT	2	8	1669560	1669567	0 %	75 %	0 %	25 %	119720630
31600	NC_008698	GTT	2	6	1669573	1669578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720630
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31602	NC_008698	TAT	2	6	1669709	1669714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720630
31603	NC_008698	GAA	2	6	1669811	1669816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720630
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31610	NC_008698	TCT	2	6	1670445	1670450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720630
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