MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_008698	CGC	2	6	1609173	1609178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720564
30503	NC_008698	CTC	2	6	1609245	1609250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720564
30504	NC_008698	CTC	2	6	1609264	1609269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720564
30505	NC_008698	AG	3	6	1609292	1609297	50 %	0 %	50 %	0 %	119720564
30506	NC_008698	CTC	2	6	1609332	1609337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720564
30507	NC_008698	GAG	2	6	1609400	1609405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720564
30508	NC_008698	GCA	2	6	1609454	1609459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720564
30509	NC_008698	CGCC	2	8	1609490	1609497	0 %	0 %	25 %	75 %	119720564
30510	NC_008698	CTTCT	2	10	1609534	1609543	0 %	60 %	0 %	40 %	119720564
30511	NC_008698	CCA	2	6	1609640	1609645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720564
30512	NC_008698	TCG	2	6	1609760	1609765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720565
30513	NC_008698	AG	3	6	1609827	1609832	50 %	0 %	50 %	0 %	119720565
30514	NC_008698	CTC	2	6	1609845	1609850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720565
30515	NC_008698	GA	3	6	1609939	1609944	50 %	0 %	50 %	0 %	119720565
30516	NC_008698	GGA	2	6	1609947	1609952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720565
30517	NC_008698	GCTCT	2	10	1609984	1609993	0 %	40 %	20 %	40 %	119720565
30518	NC_008698	CGA	2	6	1610009	1610014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720565
30519	NC_008698	GGA	3	9	1610037	1610045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720565
30520	NC_008698	TCT	2	6	1610048	1610053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720565
30521	NC_008698	GGT	2	6	1610094	1610099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720565
30522	NC_008698	GGA	2	6	1610142	1610147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720565
30523	NC_008698	CGC	2	6	1610322	1610327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720565
30524	NC_008698	GAG	3	9	1610361	1610369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720565
30525	NC_008698	CCTT	2	8	1610402	1610409	0 %	50 %	0 %	50 %	119720565
30526	NC_008698	TAC	2	6	1610599	1610604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720566
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30528	NC_008698	TCG	2	6	1610723	1610728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720566
30529	NC_008698	GGGT	2	8	1610812	1610819	0 %	25 %	75 %	0 %	119720566
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30532	NC_008698	CGA	2	6	1610886	1610891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720566
30533	NC_008698	GGGCG	2	10	1610892	1610901	0 %	0 %	80 %	20 %	119720566
30534	NC_008698	GCCC	2	8	1611065	1611072	0 %	0 %	25 %	75 %	119720566
30535	NC_008698	AACG	2	8	1611081	1611088	50 %	0 %	25 %	25 %	119720566
30536	NC_008698	T	6	6	1611160	1611165	0 %	100 %	0 %	0 %	119720567
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30539	NC_008698	GAG	2	6	1611375	1611380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
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30542	NC_008698	GTC	2	6	1611504	1611509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720567
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30544	NC_008698	GGC	2	6	1611558	1611563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720567
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30547	NC_008698	CGG	2	6	1611610	1611615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720567
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30551	NC_008698	CGA	2	6	1611764	1611769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720567
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30553	NC_008698	CGT	2	6	1611839	1611844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720567
30554	NC_008698	CGT	2	6	1611899	1611904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720567
30555	NC_008698	AGA	2	6	1611911	1611916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720567
30556	NC_008698	CGA	2	6	1611943	1611948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720567
30557	NC_008698	CCGC	2	8	1611963	1611970	0 %	0 %	25 %	75 %	119720567
30558	NC_008698	CTA	2	6	1612029	1612034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720567
30559	NC_008698	GAG	2	6	1612035	1612040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
30560	NC_008698	AGG	3	9	1612047	1612055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
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30585	NC_008698	ATA	2	6	1613269	1613274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720569
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30588	NC_008698	AGGA	2	8	1613425	1613432	50 %	0 %	50 %	0 %	119720569
30589	NC_008698	CGA	2	6	1613454	1613459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720569
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30601	NC_008698	GA	3	6	1613926	1613931	50 %	0 %	50 %	0 %	119720570
30602	NC_008698	ACG	2	6	1613938	1613943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720570
30603	NC_008698	CCCTGG	2	12	1613945	1613956	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119720570
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30605	NC_008698	GC	3	6	1614017	1614022	0 %	0 %	50 %	50 %	119720570
30606	NC_008698	CA	3	6	1614025	1614030	50 %	0 %	0 %	50 %	119720570
30607	NC_008698	TCC	2	6	1614040	1614045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720570
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30609	NC_008698	CGA	3	9	1614068	1614076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720570
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