MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_008698	TCC	2	6	1535046	1535051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720486
29003	NC_008698	GAGGCC	2	12	1535152	1535163	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119720486
29004	NC_008698	CCT	2	6	1535172	1535177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720486
29005	NC_008698	CTC	2	6	1535257	1535262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720486
29006	NC_008698	C	6	6	1535268	1535273	0 %	0 %	0 %	100 %	119720486
29007	NC_008698	ACC	2	6	1535288	1535293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720486
29008	NC_008698	CCT	2	6	1535361	1535366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720486
29009	NC_008698	GA	3	6	1535375	1535380	50 %	0 %	50 %	0 %	119720486
29010	NC_008698	GTT	2	6	1535550	1535555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720487
29011	NC_008698	CTT	2	6	1535574	1535579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720487
29012	NC_008698	CT	3	6	1535619	1535624	0 %	50 %	0 %	50 %	119720487
29013	NC_008698	CT	4	8	1535643	1535650	0 %	50 %	0 %	50 %	119720487
29014	NC_008698	GCTC	2	8	1535654	1535661	0 %	25 %	25 %	50 %	119720487
29015	NC_008698	TCA	2	6	1535690	1535695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720487
29016	NC_008698	CCT	2	6	1535706	1535711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720487
29017	NC_008698	TTC	2	6	1535733	1535738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720487
29018	NC_008698	CTCC	2	8	1535742	1535749	0 %	25 %	0 %	75 %	119720487
29019	NC_008698	GTA	2	6	1535817	1535822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720487
29020	NC_008698	TAT	2	6	1535835	1535840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720487
29021	NC_008698	CT	3	6	1535861	1535866	0 %	50 %	0 %	50 %	119720487
29022	NC_008698	CTCC	2	8	1535871	1535878	0 %	25 %	0 %	75 %	119720487
29023	NC_008698	GCCT	2	8	1535892	1535899	0 %	25 %	25 %	50 %	119720487
29024	NC_008698	CCT	2	6	1535910	1535915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720487
29025	NC_008698	CTC	2	6	1535931	1535936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720487
29026	NC_008698	AG	3	6	1535981	1535986	50 %	0 %	50 %	0 %	119720487
29027	NC_008698	CACGAC	2	12	1536138	1536149	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	119720487
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29029	NC_008698	GCTC	2	8	1536194	1536201	0 %	25 %	25 %	50 %	119720487
29030	NC_008698	C	6	6	1536307	1536312	0 %	0 %	0 %	100 %	119720487
29031	NC_008698	CTC	2	6	1536337	1536342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720487
29032	NC_008698	CGG	3	9	1536362	1536370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720487
29033	NC_008698	CCCT	2	8	1536379	1536386	0 %	25 %	0 %	75 %	119720487
29034	NC_008698	ACGTAC	2	12	1536394	1536405	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119720487
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29036	NC_008698	CGA	2	6	1536491	1536496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720487
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29038	NC_008698	CT	3	6	1536547	1536552	0 %	50 %	0 %	50 %	119720487
29039	NC_008698	T	6	6	1536695	1536700	0 %	100 %	0 %	0 %	119720488
29040	NC_008698	CGT	2	6	1536712	1536717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720488
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29042	NC_008698	CGC	2	6	1536836	1536841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720488
29043	NC_008698	TCT	2	6	1536871	1536876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720488
29044	NC_008698	GCC	2	6	1536879	1536884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720488
29045	NC_008698	CGA	2	6	1536886	1536891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720488
29046	NC_008698	TAGG	2	8	1536935	1536942	25 %	25 %	50 %	0 %	119720488
29047	NC_008698	ACG	2	6	1536945	1536950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720488
29048	NC_008698	CAC	2	6	1537001	1537006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720488
29049	NC_008698	CGA	2	6	1537024	1537029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720488
29050	NC_008698	GGC	2	6	1537106	1537111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720488
29051	NC_008698	GA	3	6	1537214	1537219	50 %	0 %	50 %	0 %	119720489
29052	NC_008698	TGGG	2	8	1537270	1537277	0 %	25 %	75 %	0 %	119720489
29053	NC_008698	CTT	2	6	1537283	1537288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720489
29054	NC_008698	CG	3	6	1537331	1537336	0 %	0 %	50 %	50 %	119720489
29055	NC_008698	C	6	6	1537345	1537350	0 %	0 %	0 %	100 %	119720489
29056	NC_008698	TCG	2	6	1537465	1537470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720489
29057	NC_008698	CGG	2	6	1537490	1537495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720489
29058	NC_008698	TAG	2	6	1537546	1537551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720489
29059	NC_008698	ATG	2	6	1537560	1537565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720489
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29061	NC_008698	CGC	2	6	1537600	1537605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720489
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29066	NC_008698	CGA	2	6	1537760	1537765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720489
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29102	NC_008698	CGT	2	6	1539900	1539905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720491
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29112	NC_008698	CTC	2	6	1540580	1540585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720492
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29115	NC_008698	CTG	2	6	1540784	1540789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720492
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29468	NC_008698	CGC	2	6	1558385	1558390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720515
29469	NC_008698	AGA	2	6	1558424	1558429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720515
29470	NC_008698	CCGC	2	8	1558444	1558451	0 %	0 %	25 %	75 %	119720515
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29473	NC_008698	CCG	2	6	1558603	1558608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720516
29474	NC_008698	GAC	2	6	1558623	1558628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720516
29475	NC_008698	ACT	2	6	1558708	1558713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720516
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29479	NC_008698	TGA	2	6	1558838	1558843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720516
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29483	NC_008698	CGC	2	6	1558914	1558919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720516
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29490	NC_008698	CCTT	2	8	1559209	1559216	0 %	50 %	0 %	50 %	119720516
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29499	NC_008698	GC	3	6	1559450	1559455	0 %	0 %	50 %	50 %	119720516
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