MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_008698	GTA	2	6	1460411	1460416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720416
27503	NC_008698	ACG	2	6	1460448	1460453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720416
27504	NC_008698	CCT	2	6	1460470	1460475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720416
27505	NC_008698	CGT	2	6	1460483	1460488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720416
27506	NC_008698	AGA	2	6	1460491	1460496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720416
27507	NC_008698	CTC	2	6	1460561	1460566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720416
27508	NC_008698	AGGG	2	8	1460601	1460608	25 %	0 %	75 %	0 %	119720416
27509	NC_008698	AGG	2	6	1460616	1460621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720416
27510	NC_008698	TTATTT	2	12	1460671	1460682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	119720416
27511	NC_008698	CG	3	6	1460689	1460694	0 %	0 %	50 %	50 %	119720416
27512	NC_008698	CTC	2	6	1460915	1460920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720417
27513	NC_008698	GCT	2	6	1460956	1460961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720417
27514	NC_008698	GGC	2	6	1461027	1461032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720417
27515	NC_008698	GAA	2	6	1461068	1461073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720417
27516	NC_008698	CTC	2	6	1461110	1461115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720417
27517	NC_008698	CCTC	2	8	1461118	1461125	0 %	25 %	0 %	75 %	119720417
27518	NC_008698	CTA	2	6	1461648	1461653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720418
27519	NC_008698	ATA	2	6	1461681	1461686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720418
27520	NC_008698	CCG	2	6	1461736	1461741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720418
27521	NC_008698	GGGC	2	8	1461823	1461830	0 %	0 %	75 %	25 %	119720418
27522	NC_008698	CGG	2	6	1461865	1461870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720418
27523	NC_008698	TAC	2	6	1461945	1461950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720418
27524	NC_008698	CGC	2	6	1461986	1461991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720418
27525	NC_008698	ACG	2	6	1462057	1462062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720418
27526	NC_008698	CTA	2	6	1462089	1462094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720418
27527	NC_008698	GCG	2	6	1462113	1462118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720418
27528	NC_008698	GAG	2	6	1462236	1462241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720418
27529	NC_008698	GAA	2	6	1462256	1462261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720418
27530	NC_008698	CCG	2	6	1462297	1462302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720418
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27532	NC_008698	C	6	6	1462372	1462377	0 %	0 %	0 %	100 %	119720418
27533	NC_008698	GC	3	6	1462389	1462394	0 %	0 %	50 %	50 %	119720418
27534	NC_008698	GTGGG	2	10	1462404	1462413	0 %	20 %	80 %	0 %	119720418
27535	NC_008698	TCG	2	6	1462432	1462437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720418
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27537	NC_008698	CGTC	2	8	1462459	1462466	0 %	25 %	25 %	50 %	119720418
27538	NC_008698	AGC	2	6	1462823	1462828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720418
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27540	NC_008698	CG	3	6	1462857	1462862	0 %	0 %	50 %	50 %	119720418
27541	NC_008698	CGG	2	6	1462868	1462873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720418
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27543	NC_008698	CCT	2	6	1463018	1463023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720419
27544	NC_008698	TCC	2	6	1463035	1463040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720419
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27547	NC_008698	CGG	2	6	1463188	1463193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720419
27548	NC_008698	GGCT	2	8	1463200	1463207	0 %	25 %	50 %	25 %	119720419
27549	NC_008698	GGAG	2	8	1463212	1463219	25 %	0 %	75 %	0 %	119720419
27550	NC_008698	CTC	2	6	1463231	1463236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720419
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27552	NC_008698	ACCC	2	8	1463344	1463351	25 %	0 %	0 %	75 %	119720419
27553	NC_008698	CTA	2	6	1463400	1463405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720419
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27555	NC_008698	CGG	2	6	1463506	1463511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720419
27556	NC_008698	GTA	2	6	1463523	1463528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720419
27557	NC_008698	CGC	2	6	1463606	1463611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720419
27558	NC_008698	AGGG	2	8	1463625	1463632	25 %	0 %	75 %	0 %	119720419
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27602	NC_008698	GCCG	2	8	1465577	1465584	0 %	0 %	50 %	50 %	119720423
27603	NC_008698	CTGT	2	8	1465586	1465593	0 %	50 %	25 %	25 %	119720423
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