MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_008698	GACGTA	2	12	1435044	1435055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119720390
27003	NC_008698	TCT	2	6	1435129	1435134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720390
27004	NC_008698	GGA	2	6	1435137	1435142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720390
27005	NC_008698	ACG	2	6	1435213	1435218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720390
27006	NC_008698	TGG	2	6	1435284	1435289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720390
27007	NC_008698	ACA	2	6	1435306	1435311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720390
27008	NC_008698	GAC	2	6	1435356	1435361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720390
27009	NC_008698	GTC	3	9	1435412	1435420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720390
27010	NC_008698	AAT	3	9	1435439	1435447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720390
27011	NC_008698	GGA	2	6	1435483	1435488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720390
27012	NC_008698	CGC	2	6	1435493	1435498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720390
27013	NC_008698	CGT	2	6	1435532	1435537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720390
27014	NC_008698	TGG	2	6	1435716	1435721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720390
27015	NC_008698	GGA	2	6	1435758	1435763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720390
27016	NC_008698	GCT	2	6	1435812	1435817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720390
27017	NC_008698	GGA	2	6	1435836	1435841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720390
27018	NC_008698	ACA	2	6	1435942	1435947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720390
27019	NC_008698	AAG	2	6	1436229	1436234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720390
27020	NC_008698	GGAG	2	8	1436374	1436381	25 %	0 %	75 %	0 %	119720391
27021	NC_008698	GAC	2	6	1436419	1436424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720391
27022	NC_008698	GGA	2	6	1436485	1436490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720391
27023	NC_008698	GAA	2	6	1436500	1436505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720391
27024	NC_008698	ACA	2	6	1436574	1436579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720391
27025	NC_008698	CTG	2	6	1436651	1436656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720391
27026	NC_008698	GCG	2	6	1436697	1436702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720391
27027	NC_008698	CG	3	6	1436725	1436730	0 %	0 %	50 %	50 %	119720391
27028	NC_008698	GTC	2	6	1436735	1436740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720391
27029	NC_008698	TCTA	2	8	1436852	1436859	25 %	50 %	0 %	25 %	119720391
27030	NC_008698	CTA	2	6	1436956	1436961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720391
27031	NC_008698	GAAAG	2	10	1437013	1437022	60 %	0 %	40 %	0 %	119720391
27032	NC_008698	TCG	2	6	1437054	1437059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720391
27033	NC_008698	CG	3	6	1437168	1437173	0 %	0 %	50 %	50 %	119720391
27034	NC_008698	AGG	2	6	1437253	1437258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720391
27035	NC_008698	CCCG	2	8	1437287	1437294	0 %	0 %	25 %	75 %	119720391
27036	NC_008698	GA	3	6	1437315	1437320	50 %	0 %	50 %	0 %	119720391
27037	NC_008698	TCC	2	6	1437417	1437422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720392
27038	NC_008698	AGT	2	6	1437499	1437504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720392
27039	NC_008698	CGA	2	6	1437669	1437674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720392
27040	NC_008698	CCA	2	6	1437680	1437685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720392
27041	NC_008698	GA	3	6	1437767	1437772	50 %	0 %	50 %	0 %	119720392
27042	NC_008698	CTG	2	6	1437863	1437868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720392
27043	NC_008698	GGA	2	6	1437886	1437891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720392
27044	NC_008698	GGC	2	6	1437892	1437897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720392
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27047	NC_008698	TTC	2	6	1437929	1437934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720392
27048	NC_008698	TCT	2	6	1437987	1437992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720392
27049	NC_008698	CTA	2	6	1438043	1438048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720392
27050	NC_008698	CAG	2	6	1438073	1438078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720392
27051	NC_008698	CGA	2	6	1438084	1438089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720392
27052	NC_008698	TCT	2	6	1438119	1438124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720392
27053	NC_008698	GAA	2	6	1438162	1438167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720392
27054	NC_008698	AGA	2	6	1438216	1438221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720392
27055	NC_008698	G	6	6	1438233	1438238	0 %	0 %	100 %	0 %	119720392
27056	NC_008698	CTCG	2	8	1438363	1438370	0 %	25 %	25 %	50 %	119720392
27057	NC_008698	CCT	2	6	1438450	1438455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720392
27058	NC_008698	CGT	2	6	1438477	1438482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720392
27059	NC_008698	ACC	2	6	1438494	1438499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720392
27060	NC_008698	CT	3	6	1438524	1438529	0 %	50 %	0 %	50 %	119720392
27061	NC_008698	ATG	2	6	1438532	1438537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720392
27062	NC_008698	AGGA	2	8	1438586	1438593	50 %	0 %	50 %	0 %	119720392
27063	NC_008698	TAA	2	6	1438629	1438634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720392
27064	NC_008698	CTACG	2	10	1438684	1438693	20 %	20 %	20 %	40 %	119720392
27065	NC_008698	GGA	2	6	1438717	1438722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720392
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27069	NC_008698	CGGC	2	8	1438911	1438918	0 %	0 %	50 %	50 %	119720392
27070	NC_008698	CCG	2	6	1438932	1438937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720392
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27088	NC_008698	CGT	2	6	1439459	1439464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720393
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27101	NC_008698	AT	3	6	1440033	1440038	50 %	50 %	0 %	0 %	119720394
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27114	NC_008698	AGGAG	2	10	1440433	1440442	40 %	0 %	60 %	0 %	119720394
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27467	NC_008698	CGC	2	6	1458547	1458552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720414
27468	NC_008698	CCA	2	6	1458562	1458567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720414
27469	NC_008698	GA	3	6	1458572	1458577	50 %	0 %	50 %	0 %	119720414
27470	NC_008698	ACGC	2	8	1458609	1458616	25 %	0 %	25 %	50 %	119720414
27471	NC_008698	GAC	2	6	1458725	1458730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720414
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27480	NC_008698	CTA	2	6	1459200	1459205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720415
27481	NC_008698	TCC	2	6	1459365	1459370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720416
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27499	NC_008698	CTC	2	6	1460267	1460272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720416
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