MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25003	NC_008698	CGC	2	6	1340324	1340329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720290
25004	NC_008698	GAG	2	6	1340354	1340359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720290
25005	NC_008698	TAGG	2	8	1340369	1340376	25 %	25 %	50 %	0 %	119720290
25006	NC_008698	AGG	2	6	1340415	1340420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720290
25007	NC_008698	C	6	6	1340460	1340465	0 %	0 %	0 %	100 %	119720290
25008	NC_008698	TGT	2	6	1340537	1340542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720290
25009	NC_008698	CGA	2	6	1340548	1340553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720290
25010	NC_008698	GGC	2	6	1340564	1340569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720290
25011	NC_008698	GCG	2	6	1340577	1340582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720290
25012	NC_008698	CCG	2	6	1340623	1340628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720290
25013	NC_008698	TCC	2	6	1340683	1340688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720290
25014	NC_008698	CGC	2	6	1340747	1340752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720290
25015	NC_008698	CGC	2	6	1340765	1340770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720290
25016	NC_008698	CGC	2	6	1340779	1340784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720290
25017	NC_008698	GAACCT	2	12	1340861	1340872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119720290
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25022	NC_008698	GCGGG	2	10	1341156	1341165	0 %	0 %	80 %	20 %	119720291
25023	NC_008698	GA	3	6	1341200	1341205	50 %	0 %	50 %	0 %	119720291
25024	NC_008698	GCTCGT	2	12	1341220	1341231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720291
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25035	NC_008698	CTGG	2	8	1341650	1341657	0 %	25 %	50 %	25 %	119720291
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25042	NC_008698	GAG	2	6	1342201	1342206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720292
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25053	NC_008698	AGTACT	2	12	1343083	1343094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119720293
25054	NC_008698	CTA	2	6	1343108	1343113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720293
25055	NC_008698	TAC	2	6	1343121	1343126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720293
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25062	NC_008698	TG	3	6	1343518	1343523	0 %	50 %	50 %	0 %	119720293
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25463	NC_008698	GAG	2	6	1361376	1361381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720313
25464	NC_008698	GGC	2	6	1361403	1361408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720313
25465	NC_008698	CT	3	6	1361468	1361473	0 %	50 %	0 %	50 %	119720313
25466	NC_008698	CCT	2	6	1361484	1361489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720313
25467	NC_008698	TCC	2	6	1361551	1361556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720313
25468	NC_008698	CGC	2	6	1361613	1361618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720313
25469	NC_008698	CGAG	2	8	1361708	1361715	25 %	0 %	50 %	25 %	119720313
25470	NC_008698	GAAGGT	2	12	1361736	1361747	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	119720313
25471	NC_008698	GGC	2	6	1361755	1361760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720313
25472	NC_008698	GTC	2	6	1361764	1361769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720313
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25475	NC_008698	ATA	2	6	1361875	1361880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720313
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25477	NC_008698	G	6	6	1362268	1362273	0 %	0 %	100 %	0 %	119720313
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25479	NC_008698	GCT	2	6	1362354	1362359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720313
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25481	NC_008698	CTT	2	6	1362471	1362476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720313
25482	NC_008698	GCG	2	6	1362482	1362487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720313
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25486	NC_008698	AC	3	6	1362636	1362641	50 %	0 %	0 %	50 %	119720313
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25488	NC_008698	CCTA	2	8	1363022	1363029	25 %	25 %	0 %	50 %	119720313
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25490	NC_008698	TG	3	6	1363065	1363070	0 %	50 %	50 %	0 %	119720313
25491	NC_008698	ACG	2	6	1363144	1363149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720313
25492	NC_008698	GGT	2	6	1363194	1363199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720313
25493	NC_008698	GTGCC	2	10	1363276	1363285	0 %	20 %	40 %	40 %	119720314
25494	NC_008698	TCT	2	6	1363392	1363397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720314
25495	NC_008698	GAA	2	6	1363414	1363419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720314
25496	NC_008698	CCGG	2	8	1363433	1363440	0 %	0 %	50 %	50 %	119720314
25497	NC_008698	TGCA	2	8	1363487	1363494	25 %	25 %	25 %	25 %	119720314
25498	NC_008698	GTT	2	6	1363562	1363567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720314
25499	NC_008698	TAC	2	6	1363652	1363657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720314
25500	NC_008698	GGCG	2	8	1363747	1363754	0 %	0 %	75 %	25 %	119720314

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