MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_008698	CTC	2	6	1318015	1318020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720266
24503	NC_008698	CCT	2	6	1318036	1318041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720266
24504	NC_008698	GCG	2	6	1318128	1318133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720266
24505	NC_008698	CGCC	2	8	1318152	1318159	0 %	0 %	25 %	75 %	119720266
24506	NC_008698	CTC	2	6	1318186	1318191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720266
24507	NC_008698	CGG	2	6	1318209	1318214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720266
24508	NC_008698	CT	3	6	1318229	1318234	0 %	50 %	0 %	50 %	119720266
24509	NC_008698	CCT	2	6	1318248	1318253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720266
24510	NC_008698	AGCCC	2	10	1318280	1318289	20 %	0 %	20 %	60 %	119720266
24511	NC_008698	CCG	2	6	1318389	1318394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720266
24512	NC_008698	CT	3	6	1318395	1318400	0 %	50 %	0 %	50 %	119720266
24513	NC_008698	ACCC	2	8	1318465	1318472	25 %	0 %	0 %	75 %	119720267
24514	NC_008698	GCC	2	6	1318488	1318493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720267
24515	NC_008698	CCT	2	6	1318539	1318544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720267
24516	NC_008698	CCT	2	6	1318562	1318567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720267
24517	NC_008698	CTTG	2	8	1318611	1318618	0 %	50 %	25 %	25 %	119720267
24518	NC_008698	CGT	2	6	1318700	1318705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720267
24519	NC_008698	CG	3	6	1318729	1318734	0 %	0 %	50 %	50 %	119720267
24520	NC_008698	CTC	2	6	1318779	1318784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720267
24521	NC_008698	CTC	2	6	1318800	1318805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720267
24522	NC_008698	GAG	2	6	1318821	1318826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720267
24523	NC_008698	CCG	2	6	1318858	1318863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720267
24524	NC_008698	GCG	2	6	1318883	1318888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720267
24525	NC_008698	C	6	6	1318921	1318926	0 %	0 %	0 %	100 %	119720267
24526	NC_008698	CCA	2	6	1318973	1318978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720267
24527	NC_008698	ACG	2	6	1319029	1319034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720267
24528	NC_008698	CCCT	2	8	1319058	1319065	0 %	25 %	0 %	75 %	119720267
24529	NC_008698	CCT	2	6	1319067	1319072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720267
24530	NC_008698	GC	3	6	1319116	1319121	0 %	0 %	50 %	50 %	119720267
24531	NC_008698	GCC	2	6	1319164	1319169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720267
24532	NC_008698	CTC	2	6	1319184	1319189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720267
24533	NC_008698	CTC	2	6	1319197	1319202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720267
24534	NC_008698	CGA	2	6	1319244	1319249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720267
24535	NC_008698	CGG	2	6	1319265	1319270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720267
24536	NC_008698	AGC	2	6	1319272	1319277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720267
24537	NC_008698	CCCT	2	8	1319341	1319348	0 %	25 %	0 %	75 %	119720267
24538	NC_008698	GC	3	6	1319355	1319360	0 %	0 %	50 %	50 %	119720267
24539	NC_008698	CGGC	2	8	1319387	1319394	0 %	0 %	50 %	50 %	119720267
24540	NC_008698	CTCTC	2	10	1319397	1319406	0 %	40 %	0 %	60 %	119720267
24541	NC_008698	ACGC	2	8	1319440	1319447	25 %	0 %	25 %	50 %	119720267
24542	NC_008698	CCT	2	6	1319541	1319546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720267
24543	NC_008698	GAG	2	6	1319566	1319571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720268
24544	NC_008698	CGC	2	6	1319668	1319673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720268
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24546	NC_008698	CGA	2	6	1319767	1319772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720268
24547	NC_008698	G	6	6	1319826	1319831	0 %	0 %	100 %	0 %	119720268
24548	NC_008698	CT	3	6	1319843	1319848	0 %	50 %	0 %	50 %	119720268
24549	NC_008698	CTC	2	6	1319891	1319896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720268
24550	NC_008698	C	6	6	1319899	1319904	0 %	0 %	0 %	100 %	119720268
24551	NC_008698	CT	3	6	1319934	1319939	0 %	50 %	0 %	50 %	119720268
24552	NC_008698	GAC	2	6	1320020	1320025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720268
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24554	NC_008698	GTCG	2	8	1320070	1320077	0 %	25 %	50 %	25 %	119720268
24555	NC_008698	CGG	2	6	1320093	1320098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720268
24556	NC_008698	CTT	2	6	1320099	1320104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720268
24557	NC_008698	TCG	2	6	1320110	1320115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720268
24558	NC_008698	C	6	6	1320131	1320136	0 %	0 %	0 %	100 %	119720268
24559	NC_008698	GAC	3	9	1320142	1320150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720268
24560	NC_008698	CGC	2	6	1320198	1320203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720268
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24563	NC_008698	CAC	2	6	1320307	1320312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720268
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24566	NC_008698	ACGCT	2	10	1320438	1320447	20 %	20 %	20 %	40 %	119720268
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24570	NC_008698	GCTA	2	8	1320621	1320628	25 %	25 %	25 %	25 %	119720269
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24572	NC_008698	TGTCGA	2	12	1320806	1320817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119720269
24573	NC_008698	ACC	2	6	1320847	1320852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720269
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24587	NC_008698	CGAG	2	8	1321756	1321763	25 %	0 %	50 %	25 %	119720270
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24601	NC_008698	GCGA	2	8	1322392	1322399	25 %	0 %	50 %	25 %	119720271
24602	NC_008698	TTA	2	6	1322411	1322416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720271
24603	NC_008698	GGA	2	6	1322511	1322516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720271
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24605	NC_008698	AG	3	6	1322640	1322645	50 %	0 %	50 %	0 %	119720271
24606	NC_008698	TCC	2	6	1322662	1322667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720271
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24613	NC_008698	GTC	2	6	1322830	1322835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720271
24614	NC_008698	TGGGAC	2	12	1322893	1322904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119720271
24615	NC_008698	GAG	2	6	1322923	1322928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720271
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24617	NC_008698	CTC	2	6	1322962	1322967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720271
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24733	NC_008698	CG	4	8	1328152	1328159	0 %	0 %	50 %	50 %	119720278
24734	NC_008698	GGC	2	6	1328183	1328188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720278
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