MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_008698	CGA	2	6	1232194	1232199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720196
23003	NC_008698	GTG	2	6	1232213	1232218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720196
23004	NC_008698	CAC	2	6	1232234	1232239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720196
23005	NC_008698	GTC	2	6	1232303	1232308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720196
23006	NC_008698	TGG	2	6	1232349	1232354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720196
23007	NC_008698	GAG	2	6	1232359	1232364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720196
23008	NC_008698	GAC	2	6	1232366	1232371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720196
23009	NC_008698	GGA	2	6	1232382	1232387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720196
23010	NC_008698	CGA	2	6	1232404	1232409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720196
23011	NC_008698	AGGG	2	8	1232417	1232424	25 %	0 %	75 %	0 %	119720196
23012	NC_008698	GGA	2	6	1232434	1232439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720196
23013	NC_008698	CTGA	2	8	1232453	1232460	25 %	25 %	25 %	25 %	119720196
23014	NC_008698	GA	3	6	1232471	1232476	50 %	0 %	50 %	0 %	119720196
23015	NC_008698	GGA	2	6	1232479	1232484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720196
23016	NC_008698	GCC	2	6	1232486	1232491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720196
23017	NC_008698	AGGA	2	8	1232501	1232508	50 %	0 %	50 %	0 %	119720196
23018	NC_008698	AGG	3	9	1232514	1232522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720196
23019	NC_008698	CTC	2	6	1232543	1232548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720196
23020	NC_008698	CCT	2	6	1232617	1232622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720196
23021	NC_008698	CCG	2	6	1232684	1232689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720196
23022	NC_008698	TCC	2	6	1232718	1232723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720196
23023	NC_008698	TCGC	2	8	1232741	1232748	0 %	25 %	25 %	50 %	119720196
23024	NC_008698	GA	3	6	1232750	1232755	50 %	0 %	50 %	0 %	119720196
23025	NC_008698	TGG	2	6	1232808	1232813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720196
23026	NC_008698	GAG	2	6	1232864	1232869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720196
23027	NC_008698	CTG	2	6	1232873	1232878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720196
23028	NC_008698	GCA	2	6	1233021	1233026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720196
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23032	NC_008698	GAGG	2	8	1233181	1233188	25 %	0 %	75 %	0 %	119720196
23033	NC_008698	GAG	2	6	1233292	1233297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720196
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23052	NC_008698	GGAG	2	8	1234014	1234021	25 %	0 %	75 %	0 %	119720196
23053	NC_008698	GGAG	2	8	1234041	1234048	25 %	0 %	75 %	0 %	119720196
23054	NC_008698	GAG	2	6	1234097	1234102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720196
23055	NC_008698	GC	3	6	1234119	1234124	0 %	0 %	50 %	50 %	119720196
23056	NC_008698	CGA	2	6	1234153	1234158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720196
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23059	NC_008698	GTG	2	6	1234231	1234236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720196
23060	NC_008698	AGGCTT	2	12	1234246	1234257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119720197
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23062	NC_008698	TAC	2	6	1234357	1234362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720197
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23065	NC_008698	GCG	2	6	1234439	1234444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720197
23066	NC_008698	CTACCC	2	12	1234518	1234529	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119720197
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23227	NC_008698	TAC	2	6	1241723	1241728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720204
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23230	NC_008698	GTC	2	6	1241997	1242002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720204
23231	NC_008698	CG	3	6	1242055	1242060	0 %	0 %	50 %	50 %	119720204
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23466	NC_008698	C	6	6	1262590	1262595	0 %	0 %	0 %	100 %	119720221
23467	NC_008698	GGC	2	6	1262618	1262623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720221
23468	NC_008698	GCCG	2	8	1262645	1262652	0 %	0 %	50 %	50 %	119720221
23469	NC_008698	GTC	2	6	1262675	1262680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720221
23470	NC_008698	CCCG	2	8	1262681	1262688	0 %	0 %	25 %	75 %	119720221
23471	NC_008698	C	6	6	1262703	1262708	0 %	0 %	0 %	100 %	119720221
23472	NC_008698	CG	3	6	1262720	1262725	0 %	0 %	50 %	50 %	119720221
23473	NC_008698	CGAGC	2	10	1262798	1262807	20 %	0 %	40 %	40 %	119720221
23474	NC_008698	CCG	2	6	1262833	1262838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720221
23475	NC_008698	AGC	2	6	1262913	1262918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720221
23476	NC_008698	GTCCCC	2	12	1262933	1262944	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119720221
23477	NC_008698	CAC	2	6	1262948	1262953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720221
23478	NC_008698	TCC	2	6	1262965	1262970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720221
23479	NC_008698	CTC	2	6	1262996	1263001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720221
23480	NC_008698	GC	3	6	1263011	1263016	0 %	0 %	50 %	50 %	119720221
23481	NC_008698	CGC	2	6	1263077	1263082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720221
23482	NC_008698	AGC	2	6	1263099	1263104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720221
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23485	NC_008698	CG	3	6	1263153	1263158	0 %	0 %	50 %	50 %	119720221
23486	NC_008698	AGT	2	6	1263169	1263174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720221
23487	NC_008698	CTC	2	6	1263260	1263265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720221
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23489	NC_008698	GGAC	2	8	1263301	1263308	25 %	0 %	50 %	25 %	119720221
23490	NC_008698	CGC	2	6	1263320	1263325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720221
23491	NC_008698	GCG	2	6	1263348	1263353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720221
23492	NC_008698	CCT	2	6	1263422	1263427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720221
23493	NC_008698	C	6	6	1263443	1263448	0 %	0 %	0 %	100 %	119720221
23494	NC_008698	CTG	2	6	1263453	1263458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720221
23495	NC_008698	CGGC	2	8	1263475	1263482	0 %	0 %	50 %	50 %	119720221
23496	NC_008698	CGC	2	6	1263487	1263492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720221
23497	NC_008698	GCC	2	6	1263528	1263533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720221
23498	NC_008698	CCT	2	6	1263598	1263603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720221
23499	NC_008698	TCG	2	6	1263651	1263656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720221
23500	NC_008698	GCC	2	6	1263671	1263676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720221

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