MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_008698	CCT	2	6	1158987	1158992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720127
21502	NC_008698	CGA	2	6	1159021	1159026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720127
21503	NC_008698	GC	3	6	1159114	1159119	0 %	0 %	50 %	50 %	119720127
21504	NC_008698	CT	3	6	1159171	1159176	0 %	50 %	0 %	50 %	119720127
21505	NC_008698	AAG	2	6	1159414	1159419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720128
21506	NC_008698	CCT	2	6	1159518	1159523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720128
21507	NC_008698	CT	3	6	1159643	1159648	0 %	50 %	0 %	50 %	119720128
21508	NC_008698	CTG	2	6	1159672	1159677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720128
21509	NC_008698	GTC	2	6	1159690	1159695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720128
21510	NC_008698	AGG	2	6	1159730	1159735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720128
21511	NC_008698	AGC	2	6	1159742	1159747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720128
21512	NC_008698	GAA	2	6	1159767	1159772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720128
21513	NC_008698	GAA	2	6	1159803	1159808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720128
21514	NC_008698	CGA	2	6	1159857	1159862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720128
21515	NC_008698	ACGA	2	8	1159954	1159961	50 %	0 %	25 %	25 %	119720128
21516	NC_008698	ATA	2	6	1159999	1160004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720128
21517	NC_008698	CG	3	6	1160020	1160025	0 %	0 %	50 %	50 %	119720128
21518	NC_008698	GAGC	2	8	1160037	1160044	25 %	0 %	50 %	25 %	119720128
21519	NC_008698	CGGC	2	8	1160060	1160067	0 %	0 %	50 %	50 %	119720128
21520	NC_008698	CTC	2	6	1160116	1160121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720128
21521	NC_008698	TGAC	2	8	1160153	1160160	25 %	25 %	25 %	25 %	119720128
21522	NC_008698	G	6	6	1160186	1160191	0 %	0 %	100 %	0 %	119720128
21523	NC_008698	GGC	2	6	1160199	1160204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720128
21524	NC_008698	TCC	2	6	1160227	1160232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720128
21525	NC_008698	CGA	2	6	1160274	1160279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720128
21526	NC_008698	TTC	2	6	1160284	1160289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720128
21527	NC_008698	GAGG	2	8	1160310	1160317	25 %	0 %	75 %	0 %	119720128
21528	NC_008698	GGA	2	6	1160388	1160393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720129
21529	NC_008698	GTG	2	6	1160483	1160488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720129
21530	NC_008698	ACT	2	6	1160502	1160507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720129
21531	NC_008698	ACG	2	6	1160571	1160576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720129
21532	NC_008698	GGA	2	6	1160581	1160586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720129
21533	NC_008698	GAG	2	6	1160591	1160596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720129
21534	NC_008698	CTG	2	6	1160612	1160617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
21535	NC_008698	GTG	3	9	1160708	1160716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720129
21536	NC_008698	CTC	2	6	1160720	1160725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720129
21537	NC_008698	CTA	2	6	1160750	1160755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720129
21538	NC_008698	GTG	2	6	1160810	1160815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720129
21539	NC_008698	TTC	2	6	1160849	1160854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720129
21540	NC_008698	ATA	2	6	1160873	1160878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720129
21541	NC_008698	TCT	2	6	1160892	1160897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720129
21542	NC_008698	GTC	2	6	1160906	1160911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
21543	NC_008698	TAC	3	9	1160930	1160938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720129
21544	NC_008698	GCG	2	6	1160939	1160944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720129
21545	NC_008698	CTG	2	6	1160975	1160980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
21546	NC_008698	TCT	3	9	1160988	1160996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720129
21547	NC_008698	GAG	2	6	1160999	1161004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720129
21548	NC_008698	GTC	2	6	1161022	1161027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
21549	NC_008698	CGC	2	6	1161061	1161066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720129
21550	NC_008698	TCG	2	6	1161093	1161098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
21551	NC_008698	AGA	2	6	1161099	1161104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720129
21552	NC_008698	G	6	6	1161112	1161117	0 %	0 %	100 %	0 %	119720129
21553	NC_008698	CTGG	2	8	1161201	1161208	0 %	25 %	50 %	25 %	119720130
21554	NC_008698	CAA	2	6	1161261	1161266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720130
21555	NC_008698	GA	3	6	1161360	1161365	50 %	0 %	50 %	0 %	119720130
21556	NC_008698	AGG	2	6	1161382	1161387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720130
21557	NC_008698	CCT	2	6	1161402	1161407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720130
21558	NC_008698	CTTC	2	8	1161485	1161492	0 %	50 %	0 %	50 %	119720130
21559	NC_008698	TCG	2	6	1161512	1161517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720130
21560	NC_008698	CTA	2	6	1161654	1161659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720130
21561	NC_008698	CTT	3	9	1161666	1161674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720130
21562	NC_008698	TCT	2	6	1161683	1161688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720130
21563	NC_008698	GGA	2	6	1161693	1161698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720130
21564	NC_008698	ACA	2	6	1161794	1161799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720130
21565	NC_008698	CTC	2	6	1161832	1161837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720130
21566	NC_008698	C	6	6	1162015	1162020	0 %	0 %	0 %	100 %	119720131
21567	NC_008698	GTCGAC	2	12	1162057	1162068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119720131
21568	NC_008698	TCGAG	2	10	1162070	1162079	20 %	20 %	40 %	20 %	119720131
21569	NC_008698	AG	3	6	1162128	1162133	50 %	0 %	50 %	0 %	119720131
21570	NC_008698	GCC	2	6	1162192	1162197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720131
21571	NC_008698	ACG	2	6	1162205	1162210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
21572	NC_008698	GCGG	2	8	1162246	1162253	0 %	0 %	75 %	25 %	119720131
21573	NC_008698	GTC	3	9	1162450	1162458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720131
21574	NC_008698	TGG	2	6	1162472	1162477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720131
21575	NC_008698	GAG	2	6	1162483	1162488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
21576	NC_008698	ACCT	2	8	1162537	1162544	25 %	25 %	0 %	50 %	119720131
21577	NC_008698	GGT	2	6	1162572	1162577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720131
21578	NC_008698	AGG	2	6	1162580	1162585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
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21580	NC_008698	CGT	2	6	1162611	1162616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720131
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21582	NC_008698	GAG	2	6	1162644	1162649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
21583	NC_008698	TTC	2	6	1162678	1162683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720131
21584	NC_008698	GAG	2	6	1162684	1162689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
21585	NC_008698	TACCCC	2	12	1162705	1162716	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119720131
21586	NC_008698	CGA	2	6	1162737	1162742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
21587	NC_008698	TCG	2	6	1162745	1162750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720131
21588	NC_008698	GGGA	2	8	1162752	1162759	25 %	0 %	75 %	0 %	119720131
21589	NC_008698	ACG	2	6	1162802	1162807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
21590	NC_008698	GAGC	2	8	1162830	1162837	25 %	0 %	50 %	25 %	119720131
21591	NC_008698	CCA	2	6	1162860	1162865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720131
21592	NC_008698	GGA	2	6	1162949	1162954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
21593	NC_008698	GAG	3	9	1162969	1162977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
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21595	NC_008698	CA	3	6	1163087	1163092	50 %	0 %	0 %	50 %	119720131
21596	NC_008698	GAG	2	6	1163143	1163148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
21597	NC_008698	G	6	6	1163159	1163164	0 %	0 %	100 %	0 %	119720131
21598	NC_008698	AAG	2	6	1163167	1163172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720131
21599	NC_008698	TCGAG	2	10	1163177	1163186	20 %	20 %	40 %	20 %	119720131
21600	NC_008698	GAGG	2	8	1163187	1163194	25 %	0 %	75 %	0 %	119720131
21601	NC_008698	GAC	2	6	1163209	1163214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
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21603	NC_008698	TTC	2	6	1163260	1163265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720131
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21605	NC_008698	GAC	2	6	1163368	1163373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
21606	NC_008698	GAG	2	6	1163452	1163457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
21607	NC_008698	TCT	2	6	1163468	1163473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720131
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21609	NC_008698	CCT	2	6	1163516	1163521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720131
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21611	NC_008698	CTA	2	6	1163566	1163571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720131
21612	NC_008698	CGC	2	6	1163610	1163615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720131
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21614	NC_008698	GGC	2	6	1163745	1163750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720131
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21730	NC_008698	GAG	2	6	1169238	1169243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720137
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21965	NC_008698	CAG	2	6	1180242	1180247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720151
21966	NC_008698	CTC	2	6	1180257	1180262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720151
21967	NC_008698	CAG	2	6	1180263	1180268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720151
21968	NC_008698	ACCTCG	2	12	1180324	1180335	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119720151
21969	NC_008698	ACT	2	6	1180381	1180386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720151
21970	NC_008698	CGA	2	6	1180394	1180399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720151
21971	NC_008698	GTA	2	6	1180530	1180535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720151
21972	NC_008698	GA	3	6	1180540	1180545	50 %	0 %	50 %	0 %	119720151
21973	NC_008698	CGA	2	6	1180573	1180578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720151
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21976	NC_008698	ACG	2	6	1180620	1180625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720151
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21978	NC_008698	GC	3	6	1180696	1180701	0 %	0 %	50 %	50 %	119720151
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21990	NC_008698	GC	3	6	1181228	1181233	0 %	0 %	50 %	50 %	119720151
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21994	NC_008698	CGG	2	6	1181374	1181379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720151
21995	NC_008698	CTT	2	6	1181408	1181413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720151
21996	NC_008698	ATA	2	6	1181508	1181513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720151
21997	NC_008698	GCC	2	6	1181547	1181552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720151
21998	NC_008698	CGACG	2	10	1181618	1181627	20 %	0 %	40 %	40 %	119720151
21999	NC_008698	CGA	2	6	1181641	1181646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720151
22000	NC_008698	TAC	2	6	1181667	1181672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720151

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