MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_008698	CGG	2	6	1029945	1029950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719999
19003	NC_008698	CGGC	2	8	1030038	1030045	0 %	0 %	50 %	50 %	119719999
19004	NC_008698	CGAG	2	8	1030080	1030087	25 %	0 %	50 %	25 %	119719999
19005	NC_008698	CTC	2	6	1030138	1030143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719999
19006	NC_008698	GC	3	6	1030166	1030171	0 %	0 %	50 %	50 %	119719999
19007	NC_008698	ACG	2	6	1030172	1030177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719999
19008	NC_008698	ACC	2	6	1030208	1030213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719999
19009	NC_008698	GAA	2	6	1030340	1030345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720000
19010	NC_008698	GTC	2	6	1030380	1030385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720000
19011	NC_008698	CGT	2	6	1030406	1030411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720000
19012	NC_008698	CTA	2	6	1030463	1030468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720000
19013	NC_008698	GGA	2	6	1030538	1030543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720000
19014	NC_008698	CGG	2	6	1030559	1030564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720000
19015	NC_008698	GGC	2	6	1030607	1030612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720000
19016	NC_008698	GA	3	6	1030620	1030625	50 %	0 %	50 %	0 %	119720000
19017	NC_008698	CTC	2	6	1030626	1030631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720000
19018	NC_008698	CGC	2	6	1030649	1030654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720000
19019	NC_008698	AGCCT	2	10	1030768	1030777	20 %	20 %	20 %	40 %	119720000
19020	NC_008698	CGA	2	6	1030787	1030792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720000
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19028	NC_008698	GGTG	2	8	1031297	1031304	0 %	25 %	75 %	0 %	119720000
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19033	NC_008698	CGT	2	6	1031535	1031540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720001
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19056	NC_008698	CGGC	2	8	1032656	1032663	0 %	0 %	50 %	50 %	119720001
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