MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_008698	GC	3	6	881060	881065	0 %	0 %	50 %	50 %	119719840
16003	NC_008698	GGA	2	6	881090	881095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719840
16004	NC_008698	TTG	2	6	881225	881230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719841
16005	NC_008698	CTA	2	6	881252	881257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719841
16006	NC_008698	G	6	6	881310	881315	0 %	0 %	100 %	0 %	119719841
16007	NC_008698	TAAG	2	8	881355	881362	50 %	25 %	25 %	0 %	119719841
16008	NC_008698	GGCT	2	8	881381	881388	0 %	25 %	50 %	25 %	119719841
16009	NC_008698	GTA	2	6	881421	881426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719841
16010	NC_008698	TGAC	2	8	881574	881581	25 %	25 %	25 %	25 %	119719841
16011	NC_008698	GCG	2	6	881586	881591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719841
16012	NC_008698	CAAG	2	8	881629	881636	50 %	0 %	25 %	25 %	119719841
16013	NC_008698	GAG	2	6	881712	881717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719841
16014	NC_008698	CGA	2	6	881887	881892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719841
16015	NC_008698	ATC	2	6	881900	881905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719841
16016	NC_008698	ACA	2	6	881919	881924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719841
16017	NC_008698	TAGAG	2	10	881971	881980	40 %	20 %	40 %	0 %	119719841
16018	NC_008698	AGG	2	6	882063	882068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719841
16019	NC_008698	AGC	2	6	882102	882107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719841
16020	NC_008698	GTA	2	6	882306	882311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719841
16021	NC_008698	GTCCTC	2	12	882425	882436	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119719841
16022	NC_008698	GCG	2	6	882471	882476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719841
16023	NC_008698	ACCTTC	2	12	882503	882514	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119719841
16024	NC_008698	CGA	2	6	882535	882540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719841
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16027	NC_008698	GAT	2	6	882757	882762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719841
16028	NC_008698	GGA	2	6	882769	882774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719841
16029	NC_008698	CGG	2	6	882922	882927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719841
16030	NC_008698	CAG	2	6	882971	882976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719841
16031	NC_008698	GCG	3	9	882983	882991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719841
16032	NC_008698	CTACT	2	10	883031	883040	20 %	40 %	0 %	40 %	119719841
16033	NC_008698	AGG	2	6	883082	883087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719841
16034	NC_008698	CAC	2	6	883126	883131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719841
16035	NC_008698	CGA	2	6	883197	883202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719841
16036	NC_008698	CGT	2	6	883276	883281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719841
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16038	NC_008698	CA	3	6	883391	883396	50 %	0 %	0 %	50 %	119719841
16039	NC_008698	CTA	2	6	883417	883422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719841
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16042	NC_008698	AGC	2	6	883623	883628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719841
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16044	NC_008698	ACC	2	6	883671	883676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719841
16045	NC_008698	CGT	2	6	883690	883695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719841
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16048	NC_008698	CCTA	2	8	883923	883930	25 %	25 %	0 %	50 %	119719841
16049	NC_008698	TGG	2	6	884058	884063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719841
16050	NC_008698	GAG	2	6	884068	884073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719841
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16052	NC_008698	CCG	2	6	884109	884114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719841
16053	NC_008698	GAT	2	6	884128	884133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719841
16054	NC_008698	CTA	2	6	884151	884156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719841
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16056	NC_008698	AG	3	6	884191	884196	50 %	0 %	50 %	0 %	119719841
16057	NC_008698	GC	3	6	884244	884249	0 %	0 %	50 %	50 %	119719841
16058	NC_008698	GCTGG	2	10	884286	884295	0 %	20 %	60 %	20 %	119719841
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16062	NC_008698	TTC	2	6	884432	884437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719841
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16085	NC_008698	GAC	2	6	885503	885508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719842
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16101	NC_008698	T	6	6	886481	886486	0 %	100 %	0 %	0 %	119719843
16102	NC_008698	CTT	2	6	886500	886505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719843
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16111	NC_008698	TC	3	6	886768	886773	0 %	50 %	0 %	50 %	119719843
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