MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008698	GCC	2	6	628840	628845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719589
11002	NC_008698	CGA	2	6	628857	628862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719589
11003	NC_008698	TCCCCG	2	12	628913	628924	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119719589
11004	NC_008698	TAC	2	6	628946	628951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719589
11005	NC_008698	TTCC	2	8	629083	629090	0 %	50 %	0 %	50 %	119719589
11006	NC_008698	GAC	2	6	629236	629241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719589
11007	NC_008698	CAA	2	6	629266	629271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719589
11008	NC_008698	AG	3	6	629275	629280	50 %	0 %	50 %	0 %	119719589
11009	NC_008698	TCC	2	6	629334	629339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719589
11010	NC_008698	TCC	2	6	629361	629366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719589
11011	NC_008698	CCT	2	6	629382	629387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719589
11012	NC_008698	AG	3	6	629406	629411	50 %	0 %	50 %	0 %	119719589
11013	NC_008698	GCGAAA	2	12	629465	629476	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	119719589
11014	NC_008698	AGGC	2	8	629506	629513	25 %	0 %	50 %	25 %	119719589
11015	NC_008698	TTC	2	6	629530	629535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719589
11016	NC_008698	AGG	2	6	629560	629565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719589
11017	NC_008698	GATG	2	8	629622	629629	25 %	25 %	50 %	0 %	119719589
11018	NC_008698	GTT	3	9	629650	629658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719589
11019	NC_008698	TGC	2	6	629661	629666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719589
11020	NC_008698	ATT	2	6	629683	629688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719589
11021	NC_008698	CCA	2	6	629740	629745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719589
11022	NC_008698	AGG	2	6	629876	629881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719589
11023	NC_008698	GAG	2	6	630010	630015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719589
11024	NC_008698	AGG	2	6	630019	630024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719589
11025	NC_008698	GA	3	6	630035	630040	50 %	0 %	50 %	0 %	119719589
11026	NC_008698	ACT	2	6	630154	630159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719590
11027	NC_008698	CTA	2	6	630185	630190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719590
11028	NC_008698	CAC	2	6	630248	630253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719590
11029	NC_008698	CT	3	6	630346	630351	0 %	50 %	0 %	50 %	119719590
11030	NC_008698	CGT	2	6	630395	630400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719590
11031	NC_008698	TCC	2	6	630422	630427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719590
11032	NC_008698	ACC	2	6	630436	630441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719590
11033	NC_008698	CCAC	2	8	630456	630463	25 %	0 %	0 %	75 %	119719590
11034	NC_008698	TCG	2	6	630488	630493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719590
11035	NC_008698	CAA	2	6	630659	630664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719590
11036	NC_008698	CGT	2	6	630674	630679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719590
11037	NC_008698	GCA	2	6	630709	630714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719590
11038	NC_008698	CGC	2	6	630732	630737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719590
11039	NC_008698	GCC	2	6	630746	630751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719590
11040	NC_008698	GAC	2	6	630768	630773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719590
11041	NC_008698	TCG	2	6	630856	630861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719590
11042	NC_008698	GCC	2	6	630883	630888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719590
11043	NC_008698	CT	3	6	630956	630961	0 %	50 %	0 %	50 %	119719590
11044	NC_008698	AT	3	6	630995	631000	50 %	50 %	0 %	0 %	119719590
11045	NC_008698	CT	3	6	631020	631025	0 %	50 %	0 %	50 %	119719590
11046	NC_008698	GC	3	6	631039	631044	0 %	0 %	50 %	50 %	119719590
11047	NC_008698	CAC	2	6	631268	631273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719591
11048	NC_008698	AC	3	6	631349	631354	50 %	0 %	0 %	50 %	119719591
11049	NC_008698	CTA	2	6	631363	631368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719591
11050	NC_008698	GCG	2	6	631374	631379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719591
11051	NC_008698	CCTA	2	8	631482	631489	25 %	25 %	0 %	50 %	119719591
11052	NC_008698	TGG	2	6	631554	631559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719591
11053	NC_008698	GGA	2	6	631588	631593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719591
11054	NC_008698	GC	3	6	631667	631672	0 %	0 %	50 %	50 %	119719591
11055	NC_008698	ACG	2	6	631695	631700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719591
11056	NC_008698	CTT	2	6	631705	631710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719591
11057	NC_008698	AG	3	6	631741	631746	50 %	0 %	50 %	0 %	119719591
11058	NC_008698	AGCT	2	8	631826	631833	25 %	25 %	25 %	25 %	119719592
11059	NC_008698	AGG	2	6	631853	631858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719592
11060	NC_008698	CT	3	6	631860	631865	0 %	50 %	0 %	50 %	119719592
11061	NC_008698	GCG	2	6	631927	631932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719592
11062	NC_008698	GTC	2	6	631939	631944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719592
11063	NC_008698	GTC	2	6	631963	631968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719592
11064	NC_008698	ACT	2	6	631970	631975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719592
11065	NC_008698	GCT	2	6	632016	632021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719592
11066	NC_008698	GAA	2	6	632181	632186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719592
11067	NC_008698	GCG	2	6	632219	632224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719592
11068	NC_008698	CAG	2	6	632330	632335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719592
11069	NC_008698	AG	3	6	632360	632365	50 %	0 %	50 %	0 %	119719592
11070	NC_008698	ACGC	2	8	632417	632424	25 %	0 %	25 %	50 %	119719592
11071	NC_008698	GAA	2	6	632434	632439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719592
11072	NC_008698	TCTA	2	8	632447	632454	25 %	50 %	0 %	25 %	119719592
11073	NC_008698	GGA	2	6	632573	632578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719593
11074	NC_008698	ACG	2	6	632665	632670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719593
11075	NC_008698	GCG	2	6	632706	632711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719593
11076	NC_008698	AGGG	2	8	632864	632871	25 %	0 %	75 %	0 %	119719593
11077	NC_008698	G	6	6	632869	632874	0 %	0 %	100 %	0 %	119719593
11078	NC_008698	AAG	3	9	632928	632936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719593
11079	NC_008698	AGAGT	2	10	632937	632946	40 %	20 %	40 %	0 %	119719593
11080	NC_008698	TC	3	6	633026	633031	0 %	50 %	0 %	50 %	119719594
11081	NC_008698	GGGAA	2	10	633068	633077	40 %	0 %	60 %	0 %	119719594
11082	NC_008698	GAG	2	6	633164	633169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719594
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11084	NC_008698	GAG	2	6	633203	633208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719594
11085	NC_008698	ACT	2	6	633211	633216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719594
11086	NC_008698	TAG	2	6	633261	633266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719594
11087	NC_008698	TCC	2	6	633289	633294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719594
11088	NC_008698	GAA	2	6	633332	633337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719594
11089	NC_008698	ATC	2	6	633338	633343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719594
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11091	NC_008698	GCT	2	6	633484	633489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719595
11092	NC_008698	TAC	2	6	633500	633505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719595
11093	NC_008698	GCTC	2	8	633543	633550	0 %	25 %	25 %	50 %	119719595
11094	NC_008698	GAC	2	6	633551	633556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719595
11095	NC_008698	TATC	2	8	633573	633580	25 %	50 %	0 %	25 %	119719595
11096	NC_008698	GGAG	2	8	633616	633623	25 %	0 %	75 %	0 %	119719595
11097	NC_008698	TGGT	2	8	633638	633645	0 %	50 %	50 %	0 %	119719595
11098	NC_008698	T	6	6	633698	633703	0 %	100 %	0 %	0 %	119719595
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11101	NC_008698	TGC	2	6	633948	633953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719595
11102	NC_008698	GAA	2	6	633967	633972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719595
11103	NC_008698	ACT	2	6	633984	633989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719595
11104	NC_008698	CACG	2	8	634024	634031	25 %	0 %	25 %	50 %	119719595
11105	NC_008698	GAT	2	6	634042	634047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719595
11106	NC_008698	AGG	2	6	634065	634070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719595
11107	NC_008698	AGG	2	6	634121	634126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719595
11108	NC_008698	AG	3	6	634144	634149	50 %	0 %	50 %	0 %	119719595
11109	NC_008698	GA	3	6	634199	634204	50 %	0 %	50 %	0 %	119719595
11110	NC_008698	GC	3	6	634255	634260	0 %	0 %	50 %	50 %	119719595
11111	NC_008698	GAA	2	6	634276	634281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719595
11112	NC_008698	CAA	2	6	634315	634320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719595
11113	NC_008698	AG	3	6	634339	634344	50 %	0 %	50 %	0 %	119719595
11114	NC_008698	CTA	3	9	634354	634362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719595
11115	NC_008698	AG	3	6	634401	634406	50 %	0 %	50 %	0 %	119719595
11116	NC_008698	ACG	2	6	634437	634442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719595
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11119	NC_008698	GTC	2	6	634535	634540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719595
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11121	NC_008698	CAT	2	6	634617	634622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719595
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