MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_008698	CAC	2	6	599569	599574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719557
10503	NC_008698	TGC	2	6	599612	599617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719557
10504	NC_008698	AGT	2	6	599621	599626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719557
10505	NC_008698	GAA	2	6	599636	599641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719557
10506	NC_008698	CAAG	2	8	599733	599740	50 %	0 %	25 %	25 %	119719558
10507	NC_008698	AGC	2	6	599756	599761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719558
10508	NC_008698	AGA	2	6	599814	599819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719558
10509	NC_008698	GA	3	6	599966	599971	50 %	0 %	50 %	0 %	119719558
10510	NC_008698	CTT	2	6	599981	599986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719558
10511	NC_008698	CGT	2	6	600427	600432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719559
10512	NC_008698	GTC	2	6	600494	600499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719559
10513	NC_008698	CTT	2	6	600508	600513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719559
10514	NC_008698	CGTT	2	8	600571	600578	0 %	50 %	25 %	25 %	119719559
10515	NC_008698	TCC	2	6	600675	600680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719559
10516	NC_008698	T	7	7	600681	600687	0 %	100 %	0 %	0 %	119719559
10517	NC_008698	GT	3	6	600708	600713	0 %	50 %	50 %	0 %	119719559
10518	NC_008698	CTT	2	6	600767	600772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719559
10519	NC_008698	GCA	2	6	600802	600807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719559
10520	NC_008698	CCG	2	6	600837	600842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719559
10521	NC_008698	CA	3	6	600843	600848	50 %	0 %	0 %	50 %	119719559
10522	NC_008698	TC	3	6	600898	600903	0 %	50 %	0 %	50 %	119719559
10523	NC_008698	GAC	2	6	600957	600962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719559
10524	NC_008698	CT	3	6	601119	601124	0 %	50 %	0 %	50 %	119719560
10525	NC_008698	AGCG	2	8	601207	601214	25 %	0 %	50 %	25 %	119719560
10526	NC_008698	AGA	2	6	601278	601283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719560
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10528	NC_008698	CT	3	6	601300	601305	0 %	50 %	0 %	50 %	119719560
10529	NC_008698	CGA	2	6	601324	601329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719560
10530	NC_008698	TGA	2	6	601430	601435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719560
10531	NC_008698	CGT	2	6	601442	601447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719561
10532	NC_008698	GAG	2	6	601455	601460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719561
10533	NC_008698	GC	3	6	601494	601499	0 %	0 %	50 %	50 %	119719561
10534	NC_008698	CGT	2	6	601541	601546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719561
10535	NC_008698	CAC	2	6	601687	601692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719561
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10537	NC_008698	CAG	2	6	601765	601770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719561
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10539	NC_008698	GAG	2	6	601925	601930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719561
10540	NC_008698	GA	4	8	601959	601966	50 %	0 %	50 %	0 %	119719561
10541	NC_008698	AGA	2	6	602045	602050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719561
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10543	NC_008698	G	6	6	602257	602262	0 %	0 %	100 %	0 %	119719562
10544	NC_008698	AGA	2	6	602299	602304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719562
10545	NC_008698	AG	3	6	602326	602331	50 %	0 %	50 %	0 %	119719562
10546	NC_008698	GGA	2	6	602384	602389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719562
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10551	NC_008698	CGT	2	6	602571	602576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719562
10552	NC_008698	CGA	2	6	602712	602717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719562
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10554	NC_008698	GAG	2	6	602854	602859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719562
10555	NC_008698	GA	3	6	602887	602892	50 %	0 %	50 %	0 %	119719562
10556	NC_008698	AGGA	2	8	602923	602930	50 %	0 %	50 %	0 %	119719562
10557	NC_008698	CTA	2	6	602950	602955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719562
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10564	NC_008698	CGG	2	6	603398	603403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719562
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10569	NC_008698	AG	3	6	603769	603774	50 %	0 %	50 %	0 %	119719562
10570	NC_008698	GAAG	2	8	603892	603899	50 %	0 %	50 %	0 %	119719562
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10573	NC_008698	AG	3	6	604024	604029	50 %	0 %	50 %	0 %	119719562
10574	NC_008698	GAG	2	6	604062	604067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719562
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10580	NC_008698	TA	3	6	604473	604478	50 %	50 %	0 %	0 %	119719563
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10583	NC_008698	AGG	2	6	604614	604619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719563
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10585	NC_008698	AGCA	2	8	604678	604685	50 %	0 %	25 %	25 %	119719563
10586	NC_008698	ATGCAG	2	12	604710	604721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119719563
10587	NC_008698	GAA	2	6	604724	604729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719563
10588	NC_008698	ACC	2	6	604782	604787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719563
10589	NC_008698	CGG	2	6	604942	604947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719564
10590	NC_008698	C	6	6	604962	604967	0 %	0 %	0 %	100 %	119719564
10591	NC_008698	T	6	6	605067	605072	0 %	100 %	0 %	0 %	119719564
10592	NC_008698	CGGCGC	2	12	605095	605106	0 %	0 %	50 %	50 %	119719564
10593	NC_008698	CTA	2	6	605158	605163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719564
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10596	NC_008698	CT	5	10	605441	605450	0 %	50 %	0 %	50 %	119719564
10597	NC_008698	ACT	2	6	605451	605456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719564
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10600	NC_008698	GGGA	2	8	605560	605567	25 %	0 %	75 %	0 %	119719564
10601	NC_008698	GAAT	2	8	605584	605591	50 %	25 %	25 %	0 %	119719564
10602	NC_008698	ACT	2	6	605660	605665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719564
10603	NC_008698	CGA	2	6	605710	605715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719564
10604	NC_008698	TCC	2	6	605868	605873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719565
10605	NC_008698	T	6	6	605876	605881	0 %	100 %	0 %	0 %	119719565
10606	NC_008698	TCTACC	2	12	605988	605999	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	119719565
10607	NC_008698	CT	3	6	606082	606087	0 %	50 %	0 %	50 %	119719565
10608	NC_008698	CTC	2	6	606092	606097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719565
10609	NC_008698	TCT	2	6	606102	606107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719565
10610	NC_008698	ACT	2	6	606145	606150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719566
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10612	NC_008698	AGTTC	2	10	606261	606270	20 %	40 %	20 %	20 %	119719566
10613	NC_008698	CCT	2	6	606279	606284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719566
10614	NC_008698	CT	3	6	606283	606288	0 %	50 %	0 %	50 %	119719566
10615	NC_008698	GAG	2	6	606376	606381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719566
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10618	NC_008698	AC	3	6	607107	607112	50 %	0 %	0 %	50 %	119719567
10619	NC_008698	ACAGG	2	10	607167	607176	40 %	0 %	40 %	20 %	119719567
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10982	NC_008698	GTA	2	6	628267	628272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719589
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