MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_008698	AAT	2	6	572163	572168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719527
10003	NC_008698	AAT	2	6	572178	572183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719527
10004	NC_008698	AGC	2	6	572191	572196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719527
10005	NC_008698	GAC	2	6	572227	572232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719527
10006	NC_008698	CCG	2	6	572272	572277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719527
10007	NC_008698	GAG	3	9	572323	572331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719527
10008	NC_008698	AGC	2	6	572337	572342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719527
10009	NC_008698	GAG	2	6	572356	572361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719527
10010	NC_008698	AGC	2	6	572377	572382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719527
10011	NC_008698	AAGC	2	8	572409	572416	50 %	0 %	25 %	25 %	119719528
10012	NC_008698	GGCGT	2	10	572438	572447	0 %	20 %	60 %	20 %	119719528
10013	NC_008698	CTT	2	6	572484	572489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719528
10014	NC_008698	TAA	2	6	572496	572501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719528
10015	NC_008698	TTC	2	6	572523	572528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719528
10016	NC_008698	CAA	2	6	572529	572534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719528
10017	NC_008698	CT	3	6	572573	572578	0 %	50 %	0 %	50 %	119719528
10018	NC_008698	CTC	2	6	572642	572647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719528
10019	NC_008698	CTT	2	6	572650	572655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719528
10020	NC_008698	TAT	2	6	572803	572808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719528
10021	NC_008698	CTC	2	6	572869	572874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719528
10022	NC_008698	GTC	2	6	572911	572916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719528
10023	NC_008698	CAT	2	6	573013	573018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719528
10024	NC_008698	CCT	2	6	573048	573053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719528
10025	NC_008698	GCT	2	6	573107	573112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719528
10026	NC_008698	ATCG	2	8	573184	573191	25 %	25 %	25 %	25 %	119719528
10027	NC_008698	CT	3	6	573260	573265	0 %	50 %	0 %	50 %	119719528
10028	NC_008698	ACG	2	6	573272	573277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719528
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10030	NC_008698	T	6	6	573375	573380	0 %	100 %	0 %	0 %	119719528
10031	NC_008698	TTC	2	6	573496	573501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719528
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10033	NC_008698	CCT	2	6	573514	573519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719528
10034	NC_008698	CTC	2	6	573540	573545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719528
10035	NC_008698	CTA	2	6	573594	573599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719528
10036	NC_008698	TCCTC	2	10	573607	573616	0 %	40 %	0 %	60 %	119719528
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10039	NC_008698	TTC	2	6	573794	573799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719529
10040	NC_008698	CTT	3	9	573846	573854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719529
10041	NC_008698	AGG	2	6	573859	573864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719529
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10043	NC_008698	TCC	2	6	573994	573999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719529
10044	NC_008698	TC	3	6	574035	574040	0 %	50 %	0 %	50 %	119719529
10045	NC_008698	GTA	2	6	574212	574217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719529
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10050	NC_008698	CGT	3	9	574497	574505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719529
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10052	NC_008698	TCC	2	6	574515	574520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719529
10053	NC_008698	CTCG	2	8	574731	574738	0 %	25 %	25 %	50 %	119719529
10054	NC_008698	CATG	2	8	574850	574857	25 %	25 %	25 %	25 %	119719529
10055	NC_008698	CGC	2	6	574860	574865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719529
10056	NC_008698	TCG	2	6	575069	575074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719530
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10058	NC_008698	CTTT	2	8	575095	575102	0 %	75 %	0 %	25 %	119719530
10059	NC_008698	CGT	2	6	575211	575216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719530
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10061	NC_008698	ATG	2	6	575297	575302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719530
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10086	NC_008698	AGCA	2	8	576867	576874	50 %	0 %	25 %	25 %	119719532
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10088	NC_008698	AG	3	6	577255	577260	50 %	0 %	50 %	0 %	119719532
10089	NC_008698	TAC	2	6	577288	577293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719532
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10091	NC_008698	AAAG	2	8	577335	577342	75 %	0 %	25 %	0 %	119719532
10092	NC_008698	TA	3	6	577351	577356	50 %	50 %	0 %	0 %	119719532
10093	NC_008698	GGC	2	6	577434	577439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719533
10094	NC_008698	CGCC	2	8	577471	577478	0 %	0 %	25 %	75 %	119719533
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10105	NC_008698	GTGG	2	8	578075	578082	0 %	25 %	75 %	0 %	119719533
10106	NC_008698	G	6	6	578180	578185	0 %	0 %	100 %	0 %	119719533
10107	NC_008698	GTC	2	6	578198	578203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719533
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10110	NC_008698	GTA	2	6	578449	578454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719534
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10119	NC_008698	CGA	2	6	579024	579029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719534
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10121	NC_008698	TAC	2	6	579066	579071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719534
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