MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 33781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_008698	CG	3	6	28254	28259	0 %	0 %	50 %	50 %	119718957
503	NC_008698	GTG	2	6	28264	28269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119718957
504	NC_008698	GAA	2	6	28306	28311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718957
505	NC_008698	GAG	2	6	28327	28332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718957
506	NC_008698	ACG	2	6	28469	28474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718957
507	NC_008698	TCG	2	6	28524	28529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718957
508	NC_008698	GAA	2	6	28702	28707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718958
509	NC_008698	ACG	2	6	28710	28715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718958
510	NC_008698	CCG	2	6	28749	28754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718958
511	NC_008698	GC	3	6	28766	28771	0 %	0 %	50 %	50 %	119718958
512	NC_008698	GGA	2	6	28808	28813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718958
513	NC_008698	CTC	2	6	28820	28825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718958
514	NC_008698	GGC	2	6	28865	28870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718958
515	NC_008698	CGA	2	6	28930	28935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718958
516	NC_008698	GAG	2	6	28949	28954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718958
517	NC_008698	TCG	2	6	28968	28973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718958
518	NC_008698	GA	3	6	29058	29063	50 %	0 %	50 %	0 %	119718958
519	NC_008698	G	6	6	29079	29084	0 %	0 %	100 %	0 %	119718958
520	NC_008698	G	6	6	29148	29153	0 %	0 %	100 %	0 %	119718958
521	NC_008698	CA	3	6	29154	29159	50 %	0 %	0 %	50 %	119718958
522	NC_008698	CAT	2	6	29170	29175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718958
523	NC_008698	GAA	2	6	29234	29239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718958
524	NC_008698	CTA	2	6	29246	29251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718958
525	NC_008698	CCG	2	6	29301	29306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718958
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527	NC_008698	TCG	2	6	29337	29342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718958
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530	NC_008698	GCAG	2	8	29542	29549	25 %	0 %	50 %	25 %	119718958
531	NC_008698	GCC	2	6	29576	29581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718958
532	NC_008698	GAA	3	9	29665	29673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119718958
533	NC_008698	G	6	6	29681	29686	0 %	0 %	100 %	0 %	119718958
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541	NC_008698	CTC	2	6	29914	29919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718959
542	NC_008698	CGG	2	6	29962	29967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718959
543	NC_008698	ATC	2	6	29975	29980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718959
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549	NC_008698	TCG	2	6	30254	30259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718959
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551	NC_008698	GC	3	6	30325	30330	0 %	0 %	50 %	50 %	119718959
552	NC_008698	ACG	2	6	30416	30421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718959
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554	NC_008698	G	6	6	30428	30433	0 %	0 %	100 %	0 %	119718959
555	NC_008698	TAG	2	6	30434	30439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119718959
556	NC_008698	CT	3	6	30453	30458	0 %	50 %	0 %	50 %	119718959
557	NC_008698	GA	3	6	30560	30565	50 %	0 %	50 %	0 %	119718959
558	NC_008698	CTT	2	6	30568	30573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718959
559	NC_008698	TTC	2	6	30641	30646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119718959
560	NC_008698	CCT	2	6	30688	30693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718959
561	NC_008698	GCC	2	6	30749	30754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718959
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573	NC_008698	CGT	2	6	31242	31247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718960
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584	NC_008698	GTC	3	9	31798	31806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718960
585	NC_008698	ACG	2	6	31812	31817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718960
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592	NC_008698	GC	4	8	32277	32284	0 %	0 %	50 %	50 %	119718961
593	NC_008698	CCT	2	6	32347	32352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119718961
594	NC_008698	TAC	2	6	32376	32381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718961
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597	NC_008698	CG	3	6	32541	32546	0 %	0 %	50 %	50 %	119718961
598	NC_008698	CCG	2	6	32611	32616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718961
599	NC_008698	TCA	2	6	32629	32634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119718961
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601	NC_008698	CGA	3	9	32813	32821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718961
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609	NC_008698	CACGTT	2	12	33080	33091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119718961
610	NC_008698	TA	3	6	33108	33113	50 %	50 %	0 %	0 %	119718961
611	NC_008698	AGC	2	6	33133	33138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718961
612	NC_008698	CGT	2	6	33149	33154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119718961
613	NC_008698	GCC	2	6	33195	33200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119718961
614	NC_008698	CGG	2	6	33233	33238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119718961
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617	NC_008698	GA	3	6	33330	33335	50 %	0 %	50 %	0 %	119718962
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619	NC_008698	G	6	6	33567	33572	0 %	0 %	100 %	0 %	119718962
620	NC_008698	TGGCGA	2	12	33573	33584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119718962
621	NC_008698	GAG	2	6	33593	33598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119718962
622	NC_008698	TGGG	2	8	33647	33654	0 %	25 %	75 %	0 %	119718962
623	NC_008698	CGA	2	6	33658	33663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119718962
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625	NC_008698	AG	3	6	33707	33712	50 %	0 %	50 %	0 %	119718962
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