MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 104348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008312	CTG	2	6	124	129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473943
2	NC_008312	AAT	2	6	141	146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473943
3	NC_008312	TA	3	6	201	206	50 %	50 %	0 %	0 %	113473943
4	NC_008312	ATTT	2	8	255	262	25 %	75 %	0 %	0 %	113473943
5	NC_008312	ACT	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473943
6	NC_008312	T	6	6	269	274	0 %	100 %	0 %	0 %	113473943
7	NC_008312	TAG	2	6	284	289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473943
8	NC_008312	A	6	6	290	295	100 %	0 %	0 %	0 %	113473943
9	NC_008312	AT	3	6	392	397	50 %	50 %	0 %	0 %	113473943
10	NC_008312	GTA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473943
11	NC_008312	AAT	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473943
12	NC_008312	CTT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473943
13	NC_008312	TGG	2	6	500	505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113473943
14	NC_008312	TGATT	2	10	611	620	20 %	60 %	20 %	0 %	113473943
15	NC_008312	GCT	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473943
16	NC_008312	AGC	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113473943
17	NC_008312	TAG	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473943
18	NC_008312	AGG	2	6	727	732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113473943
19	NC_008312	T	6	6	735	740	0 %	100 %	0 %	0 %	113473943
20	NC_008312	AGT	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473943
21	NC_008312	A	6	6	908	913	100 %	0 %	0 %	0 %	113473943
22	NC_008312	AT	3	6	956	961	50 %	50 %	0 %	0 %	113473943
23	NC_008312	GGAG	2	8	995	1002	25 %	0 %	75 %	0 %	113473943
24	NC_008312	GTT	2	6	1014	1019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113473943
25	NC_008312	TATTTC	2	12	1025	1036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	113473943
26	NC_008312	TTA	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473943
27	NC_008312	GTT	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113473943
28	NC_008312	ACA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113473943
29	NC_008312	GGA	2	6	1269	1274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113473943
30	NC_008312	ACCAC	2	10	1279	1288	40 %	0 %	0 %	60 %	113473943
31	NC_008312	AATT	2	8	1373	1380	50 %	50 %	0 %	0 %	113473943
32	NC_008312	GTC	2	6	1387	1392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473943
33	NC_008312	TTAG	2	8	1394	1401	25 %	50 %	25 %	0 %	113473943
34	NC_008312	AAT	2	6	1500	1505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473944
35	NC_008312	TGA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473944
36	NC_008312	CTA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473944
37	NC_008312	TAA	2	6	1653	1658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473944
38	NC_008312	T	7	7	1660	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	113473944
39	NC_008312	TGG	2	6	9487	9492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113473945
40	NC_008312	TTG	3	9	9509	9517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113473945
41	NC_008312	CAA	2	6	9747	9752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113473945
42	NC_008312	AGG	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113473946
43	NC_008312	GAA	2	6	10386	10391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473946
44	NC_008312	AGA	2	6	10412	10417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473946
45	NC_008312	AG	3	6	10449	10454	50 %	0 %	50 %	0 %	113473946
46	NC_008312	TTC	2	6	10487	10492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473946
47	NC_008312	TGA	2	6	10508	10513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473946
48	NC_008312	AGC	2	6	10540	10545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113473946
49	NC_008312	CAA	2	6	10587	10592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113473946
50	NC_008312	A	7	7	10634	10640	100 %	0 %	0 %	0 %	113473946
51	NC_008312	AAT	2	6	10686	10691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473946
52	NC_008312	GCA	2	6	10779	10784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113473946
53	NC_008312	TGA	2	6	10796	10801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473946
54	NC_008312	AGA	2	6	10805	10810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473946
55	NC_008312	TTGA	2	8	10833	10840	25 %	50 %	25 %	0 %	113473946
56	NC_008312	AGT	2	6	10904	10909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473946
57	NC_008312	GGA	2	6	10923	10928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113473946
58	NC_008312	TCT	2	6	11834	11839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473947
59	NC_008312	TGAGA	2	10	11843	11852	40 %	20 %	40 %	0 %	113473947
60	NC_008312	T	8	8	11854	11861	0 %	100 %	0 %	0 %	113473947
61	NC_008312	CTT	2	6	11876	11881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473947
62	NC_008312	TGA	2	6	11947	11952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473947
63	NC_008312	TGG	2	6	12069	12074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113473947
64	NC_008312	CCTC	2	8	12087	12094	0 %	25 %	0 %	75 %	113473947
65	NC_008312	T	6	6	12288	12293	0 %	100 %	0 %	0 %	113473947
66	NC_008312	TAC	2	6	12327	12332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473947
67	NC_008312	TAG	2	6	12939	12944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473948
68	NC_008312	TTA	2	6	12946	12951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
69	NC_008312	CAA	2	6	12974	12979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113473948
70	NC_008312	TAA	2	6	13002	13007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473948
71	NC_008312	AAAT	2	8	13019	13026	75 %	25 %	0 %	0 %	113473948
72	NC_008312	TGA	2	6	13029	13034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473948
73	NC_008312	GCT	2	6	13039	13044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473948
74	NC_008312	GTTC	2	8	13093	13100	0 %	50 %	25 %	25 %	113473948
75	NC_008312	A	6	6	13124	13129	100 %	0 %	0 %	0 %	113473948
76	NC_008312	A	6	6	13139	13144	100 %	0 %	0 %	0 %	113473948
77	NC_008312	TTTAT	2	10	13208	13217	20 %	80 %	0 %	0 %	113473948
78	NC_008312	ACT	2	6	13228	13233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473948
79	NC_008312	GAA	2	6	13291	13296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473948
80	NC_008312	ACAA	2	8	13308	13315	75 %	0 %	0 %	25 %	113473948
81	NC_008312	AATT	2	8	13319	13326	50 %	50 %	0 %	0 %	113473948
82	NC_008312	TAA	2	6	13335	13340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473948
83	NC_008312	AT	3	6	13439	13444	50 %	50 %	0 %	0 %	113473948
84	NC_008312	GAA	2	6	13516	13521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473948
85	NC_008312	TCA	2	6	13522	13527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473948
86	NC_008312	TGG	2	6	13550	13555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113473948
87	NC_008312	ATT	2	6	13591	13596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
88	NC_008312	AT	3	6	13608	13613	50 %	50 %	0 %	0 %	113473948
89	NC_008312	TTTA	2	8	13654	13661	25 %	75 %	0 %	0 %	113473948
90	NC_008312	AGA	2	6	13695	13700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473948
91	NC_008312	TGA	2	6	13719	13724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473948
92	NC_008312	TAC	2	6	13735	13740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473948
93	NC_008312	ATT	2	6	13804	13809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
94	NC_008312	TAT	2	6	13812	13817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
95	NC_008312	AAG	2	6	13847	13852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473948
96	NC_008312	CTT	2	6	13925	13930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473948
97	NC_008312	ATT	2	6	13948	13953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
98	NC_008312	AAG	2	6	14023	14028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473948
99	NC_008312	ATTA	2	8	14031	14038	50 %	50 %	0 %	0 %	113473948
100	NC_008312	TCC	2	6	14073	14078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113473948
101	NC_008312	AATG	2	8	14085	14092	50 %	25 %	25 %	0 %	113473948
102	NC_008312	CTT	2	6	14098	14103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473948
103	NC_008312	AGT	2	6	14149	14154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473948
104	NC_008312	ATG	3	9	14159	14167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473948
105	NC_008312	A	6	6	14168	14173	100 %	0 %	0 %	0 %	113473948
106	NC_008312	CAA	2	6	14265	14270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113473948
107	NC_008312	ATTAGT	2	12	14308	14319	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	113473948
108	NC_008312	T	7	7	14364	14370	0 %	100 %	0 %	0 %	113473948
109	NC_008312	GA	3	6	14382	14387	50 %	0 %	50 %	0 %	113473948
110	NC_008312	GAAA	2	8	14390	14397	75 %	0 %	25 %	0 %	113473948
111	NC_008312	AT	3	6	14406	14411	50 %	50 %	0 %	0 %	113473948
112	NC_008312	TTA	2	6	14462	14467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
113	NC_008312	AGA	2	6	14475	14480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473948
114	NC_008312	ATT	2	6	14634	14639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
115	NC_008312	TTA	2	6	14640	14645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
116	NC_008312	ATA	2	6	14648	14653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473948
117	NC_008312	ATT	2	6	14730	14735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
118	NC_008312	TA	3	6	14750	14755	50 %	50 %	0 %	0 %	113473948
119	NC_008312	TTC	2	6	14756	14761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473948
120	NC_008312	ATT	3	9	14790	14798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
121	NC_008312	ATT	2	6	14877	14882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
122	NC_008312	AT	3	6	14888	14893	50 %	50 %	0 %	0 %	113473948
123	NC_008312	CT	3	6	14982	14987	0 %	50 %	0 %	50 %	113473948
124	NC_008312	TAT	2	6	14996	15001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
125	NC_008312	ATT	3	9	15058	15066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
126	NC_008312	A	8	8	15091	15098	100 %	0 %	0 %	0 %	113473948
127	NC_008312	TAA	2	6	15099	15104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473948
128	NC_008312	TAA	2	6	15191	15196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473948
129	NC_008312	ATA	2	6	15203	15208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473948
130	NC_008312	ATT	2	6	15209	15214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473948
131	NC_008312	T	6	6	15291	15296	0 %	100 %	0 %	0 %	113473948
132	NC_008312	CAA	2	6	15340	15345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113473948
133	NC_008312	CTA	2	6	15377	15382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473948
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260	NC_008312	AAAG	2	8	21657	21664	75 %	0 %	25 %	0 %	113473950
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262	NC_008312	CTA	3	9	21698	21706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473950
263	NC_008312	T	6	6	21770	21775	0 %	100 %	0 %	0 %	113473950
264	NC_008312	TAT	2	6	21809	21814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473950
265	NC_008312	CTT	2	6	21875	21880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473950
266	NC_008312	C	6	6	21988	21993	0 %	0 %	0 %	100 %	113473950
267	NC_008312	AAT	2	6	22044	22049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473950
268	NC_008312	GGC	2	6	22377	22382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113473950
269	NC_008312	ACC	2	6	22401	22406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113473950
270	NC_008312	GA	3	6	22730	22735	50 %	0 %	50 %	0 %	113473951
271	NC_008312	CTGA	2	8	22874	22881	25 %	25 %	25 %	25 %	113473951
272	NC_008312	CAAGT	2	10	22893	22902	40 %	20 %	20 %	20 %	113473951
273	NC_008312	T	6	6	22940	22945	0 %	100 %	0 %	0 %	113473951
274	NC_008312	ATTT	2	8	22967	22974	25 %	75 %	0 %	0 %	113473951
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277	NC_008312	TTA	2	6	24065	24070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473952
278	NC_008312	TCT	2	6	24082	24087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473952
279	NC_008312	ATTA	2	8	24141	24148	50 %	50 %	0 %	0 %	113473952
280	NC_008312	T	6	6	24172	24177	0 %	100 %	0 %	0 %	113473952
281	NC_008312	TCA	2	6	24184	24189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473952
282	NC_008312	CCT	2	6	24206	24211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113473952
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284	NC_008312	ACC	2	6	24240	24245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113473952
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286	NC_008312	GTTT	2	8	24283	24290	0 %	75 %	25 %	0 %	113473952
287	NC_008312	ATTA	2	8	24990	24997	50 %	50 %	0 %	0 %	113473953
288	NC_008312	GGGC	2	8	25015	25022	0 %	0 %	75 %	25 %	113473953
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291	NC_008312	TAA	2	6	25082	25087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473953
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294	NC_008312	T	7	7	25181	25187	0 %	100 %	0 %	0 %	113473953
295	NC_008312	CTT	3	9	25464	25472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473954
296	NC_008312	T	6	6	25471	25476	0 %	100 %	0 %	0 %	113473954
297	NC_008312	AATC	2	8	25566	25573	50 %	25 %	0 %	25 %	113473954
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301	NC_008312	TGG	2	6	25726	25731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113473954
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304	NC_008312	CATACC	2	12	25843	25854	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	113473954
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315	NC_008312	CAT	2	6	26719	26724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473954
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334	NC_008312	ATT	2	6	27493	27498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473954
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373	NC_008312	TCT	2	6	30595	30600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473955
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378	NC_008312	TTC	3	9	31647	31655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473956
379	NC_008312	TTG	2	6	31741	31746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113473956
380	NC_008312	TAA	2	6	31772	31777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473956
381	NC_008312	ATA	2	6	31854	31859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473956
382	NC_008312	GTCT	2	8	31861	31868	0 %	50 %	25 %	25 %	113473956
383	NC_008312	AGA	2	6	31945	31950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113473956
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385	NC_008312	TTTCT	2	10	32027	32036	0 %	80 %	0 %	20 %	113473956
386	NC_008312	CTA	2	6	32045	32050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473956
387	NC_008312	TCA	2	6	32053	32058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473956
388	NC_008312	T	7	7	32074	32080	0 %	100 %	0 %	0 %	113473956
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