MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiomicrospira crunogena XCL-2 chromosome

Total Repeats: 41956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_007520	TCA	2	6	852166	852171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78485122
15002	NC_007520	AATGT	2	10	852204	852213	40 %	40 %	20 %	0 %	78485122
15003	NC_007520	TCGATT	2	12	852258	852269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	78485122
15004	NC_007520	T	6	6	852268	852273	0 %	100 %	0 %	0 %	78485122
15005	NC_007520	ATT	2	6	852306	852311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78485122
15006	NC_007520	AAAC	2	8	852343	852350	75 %	0 %	0 %	25 %	78485122
15007	NC_007520	TGA	2	6	852421	852426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78485122
15008	NC_007520	TTC	2	6	852428	852433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78485122
15009	NC_007520	CAT	2	6	852439	852444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78485122
15010	NC_007520	ACGA	2	8	852495	852502	50 %	0 %	25 %	25 %	78485122
15011	NC_007520	T	6	6	852569	852574	0 %	100 %	0 %	0 %	78485122
15012	NC_007520	CAA	2	6	852592	852597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78485122
15013	NC_007520	T	6	6	852611	852616	0 %	100 %	0 %	0 %	78485122
15014	NC_007520	TCCA	2	8	852641	852648	25 %	25 %	0 %	50 %	78485122
15015	NC_007520	TGT	2	6	852795	852800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78485122
15016	NC_007520	ATG	2	6	852831	852836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78485122
15017	NC_007520	T	6	6	852851	852856	0 %	100 %	0 %	0 %	78485122
15018	NC_007520	TAA	2	6	852935	852940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78485122
15019	NC_007520	T	6	6	853288	853293	0 %	100 %	0 %	0 %	78485123
15020	NC_007520	CGT	2	6	853303	853308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78485123
15021	NC_007520	GTTTG	2	10	853331	853340	0 %	60 %	40 %	0 %	78485123
15022	NC_007520	T	6	6	853343	853348	0 %	100 %	0 %	0 %	78485123
15023	NC_007520	TGA	2	6	853452	853457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78485123
15024	NC_007520	GCT	2	6	853594	853599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78485124
15025	NC_007520	CGA	2	6	853616	853621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78485124
15026	NC_007520	GTTT	2	8	853662	853669	0 %	75 %	25 %	0 %	78485124
15027	NC_007520	TTC	2	6	853718	853723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78485124
15028	NC_007520	GAT	2	6	853737	853742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78485124
15029	NC_007520	CAA	2	6	853801	853806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78485124
15030	NC_007520	CAC	2	6	853951	853956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78485124
15031	NC_007520	TTCG	2	8	854048	854055	0 %	50 %	25 %	25 %	78485124
15032	NC_007520	GGC	3	9	854083	854091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78485124
15033	NC_007520	GA	3	6	854148	854153	50 %	0 %	50 %	0 %	78485124
15034	NC_007520	TGA	2	6	854184	854189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78485124
15035	NC_007520	GGT	2	6	854257	854262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78485124
15036	NC_007520	ATGA	2	8	854401	854408	50 %	25 %	25 %	0 %	78485124
15037	NC_007520	TAAA	2	8	854484	854491	75 %	25 %	0 %	0 %	78485124
15038	NC_007520	CAT	2	6	854545	854550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78485124
15039	NC_007520	CCG	2	6	854570	854575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78485124
15040	NC_007520	TTGC	2	8	854602	854609	0 %	50 %	25 %	25 %	78485124
15041	NC_007520	CTTG	2	8	854675	854682	0 %	50 %	25 %	25 %	78485124
15042	NC_007520	AGGTA	2	10	854725	854734	40 %	20 %	40 %	0 %	78485124
15043	NC_007520	TCCCGG	2	12	854748	854759	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78485124
15044	NC_007520	TGC	2	6	854764	854769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78485124
15045	NC_007520	TTG	2	6	854842	854847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78485124
15046	NC_007520	ATAG	2	8	854897	854904	50 %	25 %	25 %	0 %	78485124
15047	NC_007520	T	6	6	855281	855286	0 %	100 %	0 %	0 %	78485125
15048	NC_007520	T	7	7	855361	855367	0 %	100 %	0 %	0 %	78485125
15049	NC_007520	CTG	3	9	855372	855380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78485125
15050	NC_007520	T	6	6	855401	855406	0 %	100 %	0 %	0 %	78485125
15051	NC_007520	GTC	2	6	855419	855424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78485125
15052	NC_007520	CTT	2	6	855426	855431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78485125
15053	NC_007520	AAGTG	2	10	855523	855532	40 %	20 %	40 %	0 %	78485125
15054	NC_007520	GCAT	2	8	855603	855610	25 %	25 %	25 %	25 %	78485125
15055	NC_007520	AAGCT	2	10	855649	855658	40 %	20 %	20 %	20 %	78485125
15056	NC_007520	ATC	2	6	855666	855671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78485125
15057	NC_007520	AAG	2	6	855687	855692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78485125
15058	NC_007520	AAT	2	6	855708	855713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78485125
15059	NC_007520	GTTG	2	8	855772	855779	0 %	50 %	50 %	0 %	78485126
15060	NC_007520	AGCGT	2	10	855794	855803	20 %	20 %	40 %	20 %	78485126
15061	NC_007520	GCC	2	6	855830	855835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78485126
15062	NC_007520	GCCA	2	8	855872	855879	25 %	0 %	25 %	50 %	78485126
15063	NC_007520	AATG	2	8	855882	855889	50 %	25 %	25 %	0 %	78485126
15064	NC_007520	CAAA	2	8	856112	856119	75 %	0 %	0 %	25 %	78485126
15065	NC_007520	ATC	2	6	856127	856132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78485126
15066	NC_007520	GGCG	2	8	856168	856175	0 %	0 %	75 %	25 %	78485126
15067	NC_007520	CAAC	2	8	856239	856246	50 %	0 %	0 %	50 %	78485126
15068	NC_007520	TG	3	6	856292	856297	0 %	50 %	50 %	0 %	78485126
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15071	NC_007520	TAAT	2	8	856572	856579	50 %	50 %	0 %	0 %	78485127
15072	NC_007520	AGGA	2	8	856660	856667	50 %	0 %	50 %	0 %	78485127
15073	NC_007520	A	6	6	856667	856672	100 %	0 %	0 %	0 %	78485127
15074	NC_007520	CGC	2	6	856890	856895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78485127
15075	NC_007520	CAGC	2	8	856941	856948	25 %	0 %	25 %	50 %	78485127
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15079	NC_007520	TGA	2	6	857106	857111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78485127
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15081	NC_007520	TTG	2	6	857122	857127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78485127
15082	NC_007520	GCCA	2	8	857236	857243	25 %	0 %	25 %	50 %	78485127
15083	NC_007520	CAT	2	6	857256	857261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78485127
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15087	NC_007520	A	6	6	857588	857593	100 %	0 %	0 %	0 %	78485128
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15091	NC_007520	TTG	2	6	857850	857855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78485128
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15095	NC_007520	CGC	2	6	858091	858096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78485128
15096	NC_007520	TTC	2	6	858169	858174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78485128
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15099	NC_007520	CAT	2	6	858495	858500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78485128
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15105	NC_007520	TTA	2	6	859130	859135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118139513
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15107	NC_007520	ACC	2	6	859205	859210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118139513
15108	NC_007520	TTG	2	6	859219	859224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118139513
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15110	NC_007520	AAAT	2	8	859391	859398	75 %	25 %	0 %	0 %	118139513
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15121	NC_007520	T	6	6	860054	860059	0 %	100 %	0 %	0 %	78485130
15122	NC_007520	TCA	2	6	860116	860121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78485130
15123	NC_007520	GTT	2	6	860319	860324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78485130
15124	NC_007520	TTG	2	6	860454	860459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78485130
15125	NC_007520	TGA	2	6	860509	860514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78485130
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15127	NC_007520	GCA	2	6	860540	860545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78485130
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15129	NC_007520	ACA	2	6	860566	860571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78485130
15130	NC_007520	TGA	2	6	860579	860584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78485130
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15357	NC_007520	GCGGAT	2	12	874384	874395	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78485147
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15362	NC_007520	TCAAG	2	10	874702	874711	40 %	20 %	20 %	20 %	78485147
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15364	NC_007520	TACG	2	8	874725	874732	25 %	25 %	25 %	25 %	78485147
15365	NC_007520	GGA	2	6	874747	874752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78485147
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