MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 chromosome

Total Repeats: 72041

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007404	GCT	2	6	54733	54738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316069
1502	NC_007404	GCC	2	6	54761	54766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316069
1503	NC_007404	CGC	2	6	54787	54792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316069
1504	NC_007404	AAGA	2	8	54815	54822	75 %	0 %	25 %	0 %	74316069
1505	NC_007404	TCA	2	6	55134	55139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316070
1506	NC_007404	GCG	2	6	55146	55151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316070
1507	NC_007404	TGG	2	6	55167	55172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	74316070
1508	NC_007404	GAG	2	6	55214	55219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	74316070
1509	NC_007404	GGC	2	6	55228	55233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316070
1510	NC_007404	CGG	2	6	55237	55242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316070
1511	NC_007404	GCT	2	6	55252	55257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316070
1512	NC_007404	CTCG	2	8	55282	55289	0 %	25 %	25 %	50 %	74316070
1513	NC_007404	CAG	2	6	55346	55351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316070
1514	NC_007404	CTT	2	6	55447	55452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	74316070
1515	NC_007404	CG	3	6	55453	55458	0 %	0 %	50 %	50 %	74316070
1516	NC_007404	GCG	2	6	55581	55586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316070
1517	NC_007404	ACT	2	6	55596	55601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	74316070
1518	NC_007404	CGA	2	6	55603	55608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316070
1519	NC_007404	TCG	2	6	55840	55845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1520	NC_007404	CGT	2	6	55863	55868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1521	NC_007404	GC	3	6	55869	55874	0 %	0 %	50 %	50 %	74316071
1522	NC_007404	CG	4	8	55889	55896	0 %	0 %	50 %	50 %	74316071
1523	NC_007404	GGC	2	6	55934	55939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316071
1524	NC_007404	CAG	2	6	55950	55955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1525	NC_007404	GC	4	8	55972	55979	0 %	0 %	50 %	50 %	74316071
1526	NC_007404	CGT	2	6	56000	56005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1527	NC_007404	AGC	2	6	56017	56022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1528	NC_007404	GTC	2	6	56052	56057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1529	NC_007404	CG	3	6	56087	56092	0 %	0 %	50 %	50 %	74316071
1530	NC_007404	GGCGTC	2	12	56115	56126	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	74316071
1531	NC_007404	GCG	2	6	56179	56184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316071
1532	NC_007404	CGT	2	6	56186	56191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1533	NC_007404	CGC	2	6	56216	56221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316071
1534	NC_007404	GCC	3	9	56254	56262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316071
1535	NC_007404	GCG	2	6	56333	56338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316071
1536	NC_007404	TCGC	2	8	56353	56360	0 %	25 %	25 %	50 %	74316071
1537	NC_007404	GCA	2	6	56375	56380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1538	NC_007404	AGC	2	6	56407	56412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1539	NC_007404	GTC	2	6	56511	56516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1540	NC_007404	GC	4	8	56588	56595	0 %	0 %	50 %	50 %	74316071
1541	NC_007404	AGC	2	6	56620	56625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316071
1542	NC_007404	GAC	2	6	56703	56708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316071
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1544	NC_007404	CGC	2	6	56792	56797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316072
1545	NC_007404	CG	3	6	56837	56842	0 %	0 %	50 %	50 %	74316072
1546	NC_007404	CGAC	2	8	56854	56861	25 %	0 %	25 %	50 %	74316072
1547	NC_007404	GC	3	6	56883	56888	0 %	0 %	50 %	50 %	74316072
1548	NC_007404	GCC	2	6	56906	56911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316072
1549	NC_007404	CGGC	2	8	56965	56972	0 %	0 %	50 %	50 %	74316072
1550	NC_007404	ACG	2	6	57039	57044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316072
1551	NC_007404	GCC	2	6	57055	57060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316072
1552	NC_007404	CGC	2	6	57069	57074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316072
1553	NC_007404	CGA	2	6	57104	57109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316072
1554	NC_007404	CCG	2	6	57190	57195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316072
1555	NC_007404	GAA	2	6	57202	57207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	74316072
1556	NC_007404	TCCA	2	8	57294	57301	25 %	25 %	0 %	50 %	74316072
1557	NC_007404	A	8	8	57366	57373	100 %	0 %	0 %	0 %	74316072
1558	NC_007404	AGCT	2	8	57424	57431	25 %	25 %	25 %	25 %	74316072
1559	NC_007404	TAGCA	2	10	57437	57446	40 %	20 %	20 %	20 %	74316072
1560	NC_007404	GCCC	2	8	57525	57532	0 %	0 %	25 %	75 %	74316073
1561	NC_007404	GGC	2	6	57573	57578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316073
1562	NC_007404	TCG	2	6	57581	57586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316073
1563	NC_007404	CG	3	6	57591	57596	0 %	0 %	50 %	50 %	74316073
1564	NC_007404	CGG	2	6	57605	57610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316073
1565	NC_007404	CGG	2	6	57627	57632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316073
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1567	NC_007404	GCCG	2	8	57663	57670	0 %	0 %	50 %	50 %	74316073
1568	NC_007404	CG	3	6	57692	57697	0 %	0 %	50 %	50 %	74316073
1569	NC_007404	CGC	2	6	57708	57713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316073
1570	NC_007404	GCA	2	6	57723	57728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316073
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1572	NC_007404	CGGC	2	8	57833	57840	0 %	0 %	50 %	50 %	74316073
1573	NC_007404	G	6	6	57885	57890	0 %	0 %	100 %	0 %	74316073
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1589	NC_007404	CG	4	8	58586	58593	0 %	0 %	50 %	50 %	74316074
1590	NC_007404	GGCTTC	2	12	58614	58625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316074
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1597	NC_007404	GTC	2	6	58884	58889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316074
1598	NC_007404	CG	4	8	58897	58904	0 %	0 %	50 %	50 %	74316074
1599	NC_007404	GCC	2	6	58959	58964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	74316074
1600	NC_007404	CTG	2	6	58998	59003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316074
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1604	NC_007404	GGTCG	2	10	59175	59184	0 %	20 %	60 %	20 %	74316074
1605	NC_007404	GCCG	2	8	59196	59203	0 %	0 %	50 %	50 %	74316074
1606	NC_007404	CG	3	6	59202	59207	0 %	0 %	50 %	50 %	74316074
1607	NC_007404	GC	3	6	59220	59225	0 %	0 %	50 %	50 %	74316074
1608	NC_007404	TCG	2	6	59236	59241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316074
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1610	NC_007404	CGT	2	6	59264	59269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	74316074
1611	NC_007404	AGCGA	2	10	59325	59334	40 %	0 %	40 %	20 %	74316074
1612	NC_007404	GAC	2	6	59394	59399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316074
1613	NC_007404	CG	5	10	59420	59429	0 %	0 %	50 %	50 %	74316074
1614	NC_007404	TGT	2	6	59476	59481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	74316074
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1621	NC_007404	CAG	2	6	60071	60076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	74316075
1622	NC_007404	CGG	2	6	60094	60099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316075
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1625	NC_007404	CGG	3	9	60173	60181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	74316075
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1628	NC_007404	GACCGG	2	12	60374	60385	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	74316075
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