MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobifida fusca YX chromosome

Total Repeats: 79916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007333	ACA	3	9	253	261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72160407
2	NC_007333	TCC	2	6	266	271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160407
3	NC_007333	CGC	2	6	335	340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
4	NC_007333	TCA	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72160407
5	NC_007333	CCG	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
6	NC_007333	GCC	2	6	461	466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
7	NC_007333	CAG	2	6	497	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
8	NC_007333	GCA	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
9	NC_007333	CAG	2	6	588	593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
10	NC_007333	TGC	2	6	598	603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160407
11	NC_007333	CTG	2	6	690	695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160407
12	NC_007333	CTC	2	6	713	718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160407
13	NC_007333	CCAAC	2	10	815	824	40 %	0 %	0 %	60 %	72160407
14	NC_007333	CGC	2	6	835	840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
15	NC_007333	GGC	2	6	852	857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160407
16	NC_007333	ACG	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
17	NC_007333	CGG	2	6	893	898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160407
18	NC_007333	AGC	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
19	NC_007333	CCG	2	6	939	944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
20	NC_007333	G	6	6	961	966	0 %	0 %	100 %	0 %	72160407
21	NC_007333	GGC	2	6	990	995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160407
22	NC_007333	GCC	2	6	1065	1070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
23	NC_007333	CGG	2	6	1124	1129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160407
24	NC_007333	GC	3	6	1195	1200	0 %	0 %	50 %	50 %	72160407
25	NC_007333	TCA	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72160407
26	NC_007333	CCG	3	9	1277	1285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
27	NC_007333	TCC	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160407
28	NC_007333	CGA	2	6	1313	1318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
29	NC_007333	AGG	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160407
30	NC_007333	TTC	2	6	1359	1364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72160407
31	NC_007333	CAA	2	6	1391	1396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72160407
32	NC_007333	GCC	2	6	1421	1426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
33	NC_007333	AGC	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
34	NC_007333	GGA	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160407
35	NC_007333	GAA	2	6	1532	1537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72160407
36	NC_007333	GCC	2	6	1539	1544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
37	NC_007333	AGG	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160407
38	NC_007333	CCA	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160407
39	NC_007333	GTCG	2	8	1667	1674	0 %	25 %	50 %	25 %	72160407
40	NC_007333	TGC	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160407
41	NC_007333	ACG	2	6	1717	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
42	NC_007333	GCC	2	6	1740	1745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160407
43	NC_007333	CG	3	6	1829	1834	0 %	0 %	50 %	50 %	72160407
44	NC_007333	GACC	2	8	1865	1872	25 %	0 %	25 %	50 %	72160407
45	NC_007333	GCA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
46	NC_007333	TCGG	2	8	1900	1907	0 %	25 %	50 %	25 %	72160407
47	NC_007333	ACCAC	2	10	1909	1918	40 %	0 %	0 %	60 %	72160407
48	NC_007333	CGCT	2	8	1944	1951	0 %	25 %	25 %	50 %	72160407
49	NC_007333	GCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160407
50	NC_007333	AGC	2	6	2008	2013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160407
51	NC_007333	CAC	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160407
52	NC_007333	ACC	3	9	2026	2034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160407
53	NC_007333	GTCC	2	8	2866	2873	0 %	25 %	25 %	50 %	161723112
54	NC_007333	TGC	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723112
55	NC_007333	CGA	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723112
56	NC_007333	GGAC	2	8	2919	2926	25 %	0 %	50 %	25 %	161723112
57	NC_007333	CGA	2	6	2994	2999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723112
58	NC_007333	GCT	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723112
59	NC_007333	TCC	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161723112
60	NC_007333	GTC	3	9	3094	3102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723112
61	NC_007333	CCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	0 %	75 %	161723112
62	NC_007333	GGA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161723112
63	NC_007333	GCT	2	6	3208	3213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723112
64	NC_007333	CGC	2	6	3234	3239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723112
65	NC_007333	CGA	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723112
66	NC_007333	ACCG	2	8	3316	3323	25 %	0 %	25 %	50 %	161723112
67	NC_007333	CGG	2	6	3432	3437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723112
68	NC_007333	CGG	2	6	3474	3479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723112
69	NC_007333	GGC	3	9	3502	3510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723112
70	NC_007333	CAC	3	9	3516	3524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161723112
71	NC_007333	CTC	2	6	3562	3567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161723112
72	NC_007333	AGA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723112
73	NC_007333	CGC	2	6	3656	3661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723112
74	NC_007333	GAA	2	6	3712	3717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161723112
75	NC_007333	GGA	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161723112
76	NC_007333	CGA	2	6	3756	3761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723112
77	NC_007333	CCA	2	6	3848	3853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161723112
78	NC_007333	CAT	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161723112
79	NC_007333	GAC	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723112
80	NC_007333	ACCC	2	8	3942	3949	25 %	0 %	0 %	75 %	161723112
81	NC_007333	GGC	2	6	4035	4040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160409
82	NC_007333	ACG	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160409
83	NC_007333	GCCG	2	8	4175	4182	0 %	0 %	50 %	50 %	72160409
84	NC_007333	CCT	2	6	4220	4225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160409
85	NC_007333	CGA	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160409
86	NC_007333	GGC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160409
87	NC_007333	GAC	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160409
88	NC_007333	CGA	2	6	4289	4294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160409
89	NC_007333	CGCC	2	8	4298	4305	0 %	0 %	25 %	75 %	72160409
90	NC_007333	GCG	2	6	4336	4341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160409
91	NC_007333	CAT	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72160409
92	NC_007333	CGG	2	6	4379	4384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160409
93	NC_007333	ATG	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72160409
94	NC_007333	GCC	2	6	4557	4562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160409
95	NC_007333	GTG	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160409
96	NC_007333	GCT	2	6	4631	4636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160409
97	NC_007333	CTG	2	6	4641	4646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160409
98	NC_007333	GAA	2	6	4659	4664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72160409
99	NC_007333	GCC	2	6	4731	4736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160409
100	NC_007333	GCCC	2	8	4751	4758	0 %	0 %	25 %	75 %	72160409
101	NC_007333	CCG	2	6	4768	4773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160409
102	NC_007333	AGG	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160409
103	NC_007333	CGC	2	6	4829	4834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160409
104	NC_007333	CGG	2	6	4850	4855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160409
105	NC_007333	GTC	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160409
106	NC_007333	AAG	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72160409
107	NC_007333	CTGGAG	2	12	5042	5053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	72160410
108	NC_007333	GGGCA	2	10	5084	5093	20 %	0 %	60 %	20 %	72160410
109	NC_007333	AGC	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160410
110	NC_007333	ACG	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160410
111	NC_007333	CCG	2	6	5170	5175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160410
112	NC_007333	CG	3	6	5198	5203	0 %	0 %	50 %	50 %	72160410
113	NC_007333	GGGC	2	8	5255	5262	0 %	0 %	75 %	25 %	72160410
114	NC_007333	CGCC	2	8	5269	5276	0 %	0 %	25 %	75 %	72160410
115	NC_007333	TCC	2	6	5319	5324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160410
116	NC_007333	GCC	2	6	5382	5387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160410
117	NC_007333	CGA	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160410
118	NC_007333	GCT	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160410
119	NC_007333	CCGC	2	8	5409	5416	0 %	0 %	25 %	75 %	72160410
120	NC_007333	C	6	6	5418	5423	0 %	0 %	0 %	100 %	72160410
121	NC_007333	CTC	2	6	5477	5482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160410
122	NC_007333	GCC	2	6	5492	5497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160410
123	NC_007333	CCA	2	6	5506	5511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160410
124	NC_007333	GGC	2	6	5516	5521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160410
125	NC_007333	CTC	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160410
126	NC_007333	GCT	2	6	5682	5687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160410
127	NC_007333	GAG	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160410
128	NC_007333	ACC	2	6	5711	5716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160410
129	NC_007333	GC	3	6	5743	5748	0 %	0 %	50 %	50 %	72160410
130	NC_007333	CTG	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160410
131	NC_007333	CGCC	2	8	5761	5768	0 %	0 %	25 %	75 %	72160410
132	NC_007333	CGA	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160410
133	NC_007333	GCG	2	6	5779	5784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160410
134	NC_007333	TCG	2	6	5796	5801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160410
135	NC_007333	CGA	2	6	5812	5817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160410
136	NC_007333	GCCA	2	8	5842	5849	25 %	0 %	25 %	50 %	72160410
137	NC_007333	GCCA	2	8	5858	5865	25 %	0 %	25 %	50 %	72160410
138	NC_007333	CGA	2	6	5932	5937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160410
139	NC_007333	TCC	3	9	5943	5951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160410
140	NC_007333	CGA	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160410
141	NC_007333	GCG	3	9	5983	5991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160410
142	NC_007333	CGCCT	2	10	5993	6002	0 %	20 %	20 %	60 %	72160410
143	NC_007333	CGA	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160410
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145	NC_007333	CCCCG	2	10	6125	6134	0 %	0 %	20 %	80 %	72160411
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149	NC_007333	GCC	2	6	6252	6257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160411
150	NC_007333	C	6	6	6256	6261	0 %	0 %	0 %	100 %	72160411
151	NC_007333	AGGAC	2	10	6263	6272	40 %	0 %	40 %	20 %	72160411
152	NC_007333	CGG	2	6	6380	6385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160411
153	NC_007333	TCG	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160411
154	NC_007333	TCG	3	9	6466	6474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160411
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158	NC_007333	AGG	2	6	6980	6985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160412
159	NC_007333	ACG	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160412
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161	NC_007333	CAC	2	6	7097	7102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160412
162	NC_007333	CGG	2	6	7186	7191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160412
163	NC_007333	ACGG	2	8	7209	7216	25 %	0 %	50 %	25 %	72160412
164	NC_007333	AAG	2	6	7247	7252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72160412
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169	NC_007333	TCGAAG	2	12	7377	7388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	72160412
170	NC_007333	CCG	2	6	7390	7395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160412
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172	NC_007333	CGA	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160412
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174	NC_007333	CGG	2	6	7550	7555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160412
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176	NC_007333	TCG	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160412
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200	NC_007333	GCCGAC	2	12	8489	8500	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	72160412
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231	NC_007333	CGGC	2	8	9792	9799	0 %	0 %	50 %	50 %	72160413
232	NC_007333	TCG	2	6	9806	9811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160413
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246	NC_007333	CGA	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
247	NC_007333	GC	4	8	10294	10301	0 %	0 %	50 %	50 %	72160413
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249	NC_007333	ACG	2	6	10364	10369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
250	NC_007333	ATC	2	6	10432	10437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72160413
251	NC_007333	CGA	2	6	10440	10445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
252	NC_007333	TCG	2	6	10457	10462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160413
253	NC_007333	CCG	2	6	10479	10484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160413
254	NC_007333	GGA	2	6	10521	10526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160413
255	NC_007333	GTC	2	6	10549	10554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160413
256	NC_007333	GGC	2	6	10567	10572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160413
257	NC_007333	GCG	2	6	10616	10621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160413
258	NC_007333	GCG	2	6	10634	10639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160413
259	NC_007333	GAC	2	6	10654	10659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
260	NC_007333	CTT	2	6	10671	10676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72160413
261	NC_007333	GAC	2	6	10680	10685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
262	NC_007333	CA	3	6	10686	10691	50 %	0 %	0 %	50 %	72160413
263	NC_007333	TTC	2	6	10705	10710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72160413
264	NC_007333	CAA	2	6	10713	10718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	72160413
265	NC_007333	CCA	2	6	10779	10784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160413
266	NC_007333	TCC	2	6	10805	10810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160413
267	NC_007333	GAG	2	6	10816	10821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160413
268	NC_007333	ACG	2	6	10850	10855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
269	NC_007333	GAA	2	6	10896	10901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72160413
270	NC_007333	CCGC	2	8	10925	10932	0 %	0 %	25 %	75 %	72160413
271	NC_007333	TCC	2	6	10933	10938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160413
272	NC_007333	CAT	2	6	10941	10946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72160413
273	NC_007333	GAC	2	6	10966	10971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
274	NC_007333	CGC	2	6	10980	10985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160413
275	NC_007333	CGA	2	6	11004	11009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
276	NC_007333	CTG	3	9	11011	11019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160413
277	NC_007333	CAG	2	6	11022	11027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160413
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288	NC_007333	CGAGAC	2	12	11842	11853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160414
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291	NC_007333	G	6	6	11980	11985	0 %	0 %	100 %	0 %	72160414
292	NC_007333	GCA	2	6	11996	12001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160414
293	NC_007333	TGA	2	6	12099	12104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72160414
294	NC_007333	TCA	2	6	12114	12119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72160414
295	NC_007333	TCA	2	6	12135	12140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72160414
296	NC_007333	GT	3	6	12189	12194	0 %	50 %	50 %	0 %	72160414
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299	NC_007333	TCA	2	6	12336	12341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72160414
300	NC_007333	GGC	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160414
301	NC_007333	GAGT	2	8	12425	12432	25 %	25 %	50 %	0 %	72160414
302	NC_007333	GAG	2	6	13787	13792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160415
303	NC_007333	GAA	2	6	13812	13817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72160415
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389	NC_007333	GCT	2	6	17083	17088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160418
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