MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobifida fusca YX chromosome

Total Repeats: 79916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007333	CCG	2	6	161703	161708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160541
3502	NC_007333	CTT	2	6	161725	161730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72160541
3503	NC_007333	TGC	2	6	161754	161759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160541
3504	NC_007333	GGA	2	6	161768	161773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160541
3505	NC_007333	GTCC	2	8	161783	161790	0 %	25 %	25 %	50 %	72160541
3506	NC_007333	TCG	2	6	161886	161891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160541
3507	NC_007333	GCGCT	2	10	161943	161952	0 %	20 %	40 %	40 %	72160541
3508	NC_007333	TGG	2	6	161992	161997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160541
3509	NC_007333	TGACCG	2	12	162120	162131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	72160542
3510	NC_007333	TTC	2	6	162143	162148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72160542
3511	NC_007333	GGA	2	6	162200	162205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160542
3512	NC_007333	ACC	2	6	162248	162253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160542
3513	NC_007333	TC	3	6	162294	162299	0 %	50 %	0 %	50 %	72160542
3514	NC_007333	CGA	2	6	162372	162377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160542
3515	NC_007333	CTC	2	6	162409	162414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160542
3516	NC_007333	GA	3	6	162488	162493	50 %	0 %	50 %	0 %	72160542
3517	NC_007333	CGA	2	6	162537	162542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160542
3518	NC_007333	GAG	2	6	162553	162558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160542
3519	NC_007333	GTGC	2	8	162612	162619	0 %	25 %	50 %	25 %	72160542
3520	NC_007333	GGC	2	6	162628	162633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160542
3521	NC_007333	TGC	2	6	163070	163075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160543
3522	NC_007333	CGGGGT	2	12	163083	163094	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	72160543
3523	NC_007333	CGC	2	6	163096	163101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160543
3524	NC_007333	TGGAC	2	10	163127	163136	20 %	20 %	40 %	20 %	72160543
3525	NC_007333	GGT	2	6	163158	163163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160543
3526	NC_007333	ACC	2	6	163189	163194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160543
3527	NC_007333	CTG	2	6	163195	163200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160543
3528	NC_007333	CGC	2	6	163206	163211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160543
3529	NC_007333	CACCC	2	10	163222	163231	20 %	0 %	0 %	80 %	72160543
3530	NC_007333	GAT	2	6	163293	163298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72160543
3531	NC_007333	GCC	2	6	163321	163326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160543
3532	NC_007333	GAC	2	6	163336	163341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160543
3533	NC_007333	GTG	2	6	163357	163362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160543
3534	NC_007333	GCC	2	6	163369	163374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160543
3535	NC_007333	CTG	2	6	163438	163443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160543
3536	NC_007333	TGC	2	6	163457	163462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160543
3537	NC_007333	GCT	3	9	163548	163556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160543
3538	NC_007333	GC	3	6	163589	163594	0 %	0 %	50 %	50 %	72160543
3539	NC_007333	GGA	2	6	163596	163601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160543
3540	NC_007333	GCC	2	6	163610	163615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160543
3541	NC_007333	CCA	2	6	163665	163670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160543
3542	NC_007333	GAG	2	6	163675	163680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160543
3543	NC_007333	C	6	6	163684	163689	0 %	0 %	0 %	100 %	72160543
3544	NC_007333	CTG	3	9	163705	163713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160543
3545	NC_007333	GGT	2	6	163725	163730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160543
3546	NC_007333	TGA	2	6	163754	163759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72160543
3547	NC_007333	CCG	2	6	163760	163765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160543
3548	NC_007333	ACC	2	6	163766	163771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160543
3549	NC_007333	CAC	2	6	163776	163781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160543
3550	NC_007333	CGT	2	6	163835	163840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160543
3551	NC_007333	CGT	2	6	163978	163983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3552	NC_007333	TGC	2	6	163987	163992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3553	NC_007333	TGG	2	6	164022	164027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160544
3554	NC_007333	GCT	2	6	164056	164061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3555	NC_007333	GCTG	2	8	164155	164162	0 %	25 %	50 %	25 %	72160544
3556	NC_007333	GC	3	6	164167	164172	0 %	0 %	50 %	50 %	72160544
3557	NC_007333	TGC	2	6	164178	164183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3558	NC_007333	CGG	2	6	164188	164193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160544
3559	NC_007333	CGG	2	6	164218	164223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160544
3560	NC_007333	CTG	2	6	164228	164233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3561	NC_007333	GC	3	6	164292	164297	0 %	0 %	50 %	50 %	72160544
3562	NC_007333	ATT	2	6	164300	164305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72160544
3563	NC_007333	GC	3	6	164322	164327	0 %	0 %	50 %	50 %	72160544
3564	NC_007333	CGT	2	6	164339	164344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3565	NC_007333	GCCC	2	8	164348	164355	0 %	0 %	25 %	75 %	72160544
3566	NC_007333	CGG	2	6	164359	164364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160544
3567	NC_007333	GCT	2	6	164368	164373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3568	NC_007333	GGGC	2	8	164391	164398	0 %	0 %	75 %	25 %	72160544
3569	NC_007333	CGG	2	6	164404	164409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160544
3570	NC_007333	CGC	2	6	164419	164424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160544
3571	NC_007333	GAA	2	6	164494	164499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72160544
3572	NC_007333	G	6	6	164565	164570	0 %	0 %	100 %	0 %	72160544
3573	NC_007333	G	6	6	164603	164608	0 %	0 %	100 %	0 %	72160544
3574	NC_007333	GCC	2	6	164628	164633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160544
3575	NC_007333	GC	3	6	164653	164658	0 %	0 %	50 %	50 %	72160544
3576	NC_007333	TCG	2	6	164664	164669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3577	NC_007333	GCA	2	6	164684	164689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3578	NC_007333	TGC	2	6	164700	164705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160544
3579	NC_007333	GTCA	2	8	164716	164723	25 %	25 %	25 %	25 %	72160545
3580	NC_007333	CGA	2	6	164759	164764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160545
3581	NC_007333	CGT	2	6	164828	164833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160545
3582	NC_007333	GCC	2	6	164852	164857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160545
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3586	NC_007333	CGTTCC	2	12	165025	165036	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	72160545
3587	NC_007333	CGG	2	6	165050	165055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160545
3588	NC_007333	CAG	2	6	165108	165113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160545
3589	NC_007333	CAC	2	6	165120	165125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160545
3590	NC_007333	CGAG	2	8	165169	165176	25 %	0 %	50 %	25 %	72160545
3591	NC_007333	CGG	2	6	165214	165219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160545
3592	NC_007333	CGC	2	6	165241	165246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160545
3593	NC_007333	GGGC	2	8	165636	165643	0 %	0 %	75 %	25 %	72160546
3594	NC_007333	GGTG	2	8	165649	165656	0 %	25 %	75 %	0 %	72160546
3595	NC_007333	CGGT	2	8	165678	165685	0 %	25 %	50 %	25 %	72160546
3596	NC_007333	ACG	2	6	165762	165767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160546
3597	NC_007333	TGG	2	6	165786	165791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160546
3598	NC_007333	CGT	2	6	165805	165810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160546
3599	NC_007333	GGA	2	6	165811	165816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72160546
3600	NC_007333	GAT	2	6	165836	165841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72160546
3601	NC_007333	TCG	2	6	165843	165848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160546
3602	NC_007333	AGTCC	2	10	165919	165928	20 %	20 %	20 %	40 %	72160546
3603	NC_007333	GCG	2	6	165933	165938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160546
3604	NC_007333	GTC	2	6	165950	165955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160546
3605	NC_007333	GGGTC	2	10	166003	166012	0 %	20 %	60 %	20 %	72160546
3606	NC_007333	CGG	2	6	166078	166083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160546
3607	NC_007333	CCGC	2	8	166086	166093	0 %	0 %	25 %	75 %	72160546
3608	NC_007333	CGG	2	6	166140	166145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160546
3609	NC_007333	CGC	2	6	166249	166254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160546
3610	NC_007333	AGT	2	6	166317	166322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72160546
3611	NC_007333	GCG	2	6	166354	166359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160546
3612	NC_007333	CGA	3	9	166378	166386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160546
3613	NC_007333	CGG	2	6	166412	166417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160546
3614	NC_007333	CGG	2	6	166438	166443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160546
3615	NC_007333	TCC	2	6	166494	166499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160546
3616	NC_007333	GTC	2	6	166724	166729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160547
3617	NC_007333	TCG	2	6	166764	166769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160547
3618	NC_007333	TGA	2	6	166816	166821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72160547
3619	NC_007333	CGT	2	6	166840	166845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160547
3620	NC_007333	CAG	2	6	166943	166948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160547
3621	NC_007333	TCG	2	6	167073	167078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160547
3622	NC_007333	CGG	2	6	167130	167135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72160547
3623	NC_007333	CTT	2	6	167192	167197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72160547
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3626	NC_007333	TGC	2	6	167332	167337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160547
3627	NC_007333	GCT	2	6	167338	167343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160547
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3643	NC_007333	GGT	2	6	168688	168693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160548
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3989	NC_007333	GCC	2	6	184604	184609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160563
3990	NC_007333	TCG	2	6	184647	184652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72160563
3991	NC_007333	CCT	2	6	184707	184712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72160563
3992	NC_007333	GAC	2	6	184962	184967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72160564
3993	NC_007333	AG	3	6	185010	185015	50 %	0 %	50 %	0 %	72160564
3994	NC_007333	GCC	2	6	185047	185052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160564
3995	NC_007333	GGAG	2	8	185115	185122	25 %	0 %	75 %	0 %	72160564
3996	NC_007333	CGC	2	6	185160	185165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160564
3997	NC_007333	GCC	2	6	185202	185207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72160564
3998	NC_007333	TGG	2	6	185227	185232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72160564
3999	NC_007333	ACC	2	6	185270	185275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72160564
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