MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus kodakarensis KOD1 chromosome

Total Repeats: 37442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_006624	AAG	2	6	107743	107748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640069
2002	NC_006624	ACC	2	6	107799	107804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640069
2003	NC_006624	CCA	2	6	107808	107813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640069
2004	NC_006624	CAA	2	6	107868	107873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640069
2005	NC_006624	CTC	2	6	107893	107898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640069
2006	NC_006624	CAC	2	6	107941	107946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640069
2007	NC_006624	CGA	2	6	108105	108110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640069
2008	NC_006624	GGCT	2	8	108186	108193	0 %	25 %	50 %	25 %	57640069
2009	NC_006624	ACG	2	6	108220	108225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640069
2010	NC_006624	GAC	2	6	108261	108266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640069
2011	NC_006624	GTT	2	6	108289	108294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640069
2012	NC_006624	GTCC	2	8	108382	108389	0 %	25 %	25 %	50 %	57640069
2013	NC_006624	GTG	2	6	108441	108446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640069
2014	NC_006624	CGG	2	6	108555	108560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640070
2015	NC_006624	TGA	2	6	108572	108577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640070
2016	NC_006624	CCT	2	6	108578	108583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640070
2017	NC_006624	CTC	2	6	108591	108596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640070
2018	NC_006624	GCC	2	6	108708	108713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640070
2019	NC_006624	TCC	3	9	108718	108726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640070
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2021	NC_006624	CGGG	2	8	108785	108792	0 %	0 %	75 %	25 %	57640070
2022	NC_006624	CTT	2	6	108825	108830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640070
2023	NC_006624	GCC	2	6	109012	109017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640070
2024	NC_006624	GGC	2	6	109032	109037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640070
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2027	NC_006624	CCT	2	6	109101	109106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640071
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2029	NC_006624	GAC	3	9	109345	109353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640071
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2031	NC_006624	GTAG	2	8	109393	109400	25 %	25 %	50 %	0 %	57640071
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2033	NC_006624	TG	3	6	109612	109617	0 %	50 %	50 %	0 %	57640071
2034	NC_006624	CGA	2	6	109644	109649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640071
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2036	NC_006624	CCGATG	2	12	109724	109735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	57640071
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2041	NC_006624	CGG	2	6	109891	109896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640071
2042	NC_006624	CGG	2	6	109900	109905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640071
2043	NC_006624	GA	3	6	109914	109919	50 %	0 %	50 %	0 %	57640071
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2053	NC_006624	TCT	2	6	110349	110354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640071
2054	NC_006624	TCG	2	6	110406	110411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640071
2055	NC_006624	CTT	2	6	110416	110421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640071
2056	NC_006624	AAC	2	6	110476	110481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640071
2057	NC_006624	TGG	2	6	110505	110510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640071
2058	NC_006624	CG	3	6	110634	110639	0 %	0 %	50 %	50 %	57640071
2059	NC_006624	GTC	2	6	110674	110679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640071
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2061	NC_006624	CCGA	2	8	110717	110724	25 %	0 %	25 %	50 %	57640071
2062	NC_006624	CTT	2	6	110863	110868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640071
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2065	NC_006624	TCTG	2	8	111142	111149	0 %	50 %	25 %	25 %	57640072
2066	NC_006624	CAG	2	6	111201	111206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640072
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2089	NC_006624	GCC	2	6	112108	112113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640074
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2093	NC_006624	GAT	2	6	112274	112279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640074
2094	NC_006624	GCC	2	6	112280	112285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640074
2095	NC_006624	CCTG	2	8	112303	112310	0 %	25 %	25 %	50 %	57640074
2096	NC_006624	CTT	3	9	112330	112338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640074
2097	NC_006624	TTCC	2	8	112500	112507	0 %	50 %	0 %	50 %	57640074
2098	NC_006624	TGA	2	6	112554	112559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640074
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2105	NC_006624	TAT	2	6	112774	112779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640074
2106	NC_006624	GAT	2	6	112810	112815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640074
2107	NC_006624	AAC	2	6	112873	112878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640074
2108	NC_006624	CTT	2	6	112921	112926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640074
2109	NC_006624	GAA	2	6	113002	113007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640074
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2115	NC_006624	CA	3	6	113361	113366	50 %	0 %	0 %	50 %	57640075
2116	NC_006624	AG	3	6	113384	113389	50 %	0 %	50 %	0 %	57640075
2117	NC_006624	AGA	2	6	113408	113413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640075
2118	NC_006624	CGA	2	6	113429	113434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640075
2119	NC_006624	CGA	2	6	113519	113524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640075
2120	NC_006624	AGC	2	6	113595	113600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640075
2121	NC_006624	ATG	2	6	113640	113645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640075
2122	NC_006624	GAG	2	6	113754	113759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640075
2123	NC_006624	CTC	2	6	113778	113783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640075
2124	NC_006624	TCA	2	6	113803	113808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640075
2125	NC_006624	CATA	2	8	113887	113894	50 %	25 %	0 %	25 %	57640075
2126	NC_006624	GAA	2	6	113959	113964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640075
2127	NC_006624	AGCG	2	8	113978	113985	25 %	0 %	50 %	25 %	57640075
2128	NC_006624	GGA	2	6	114001	114006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640075
2129	NC_006624	TGA	2	6	114031	114036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640075
2130	NC_006624	AAG	2	6	114262	114267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640075
2131	NC_006624	TGG	2	6	114303	114308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640075
2132	NC_006624	GAA	2	6	114353	114358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640075
2133	NC_006624	TCG	2	6	114367	114372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640075
2134	NC_006624	CCTGG	2	10	114530	114539	0 %	20 %	40 %	40 %	57640075
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2136	NC_006624	AAG	2	6	114731	114736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640076
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2140	NC_006624	GAG	2	6	114862	114867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640076
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2142	NC_006624	CTC	2	6	115154	115159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640076
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2144	NC_006624	CTC	2	6	115214	115219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640076
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2148	NC_006624	TCG	2	6	115296	115301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640076
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2153	NC_006624	ATA	2	6	115502	115507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640077
2154	NC_006624	ACG	2	6	115515	115520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640077
2155	NC_006624	AG	3	6	115689	115694	50 %	0 %	50 %	0 %	57640077
2156	NC_006624	AGC	2	6	115701	115706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640077
2157	NC_006624	GGT	2	6	115739	115744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640077
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2160	NC_006624	CGT	2	6	115807	115812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640077
2161	NC_006624	CGC	3	9	115846	115854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640077
2162	NC_006624	AT	3	6	115905	115910	50 %	50 %	0 %	0 %	57640077
2163	NC_006624	TC	3	6	115975	115980	0 %	50 %	0 %	50 %	57640077
2164	NC_006624	ACA	2	6	116016	116021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640077
2165	NC_006624	TGT	2	6	116107	116112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640077
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2183	NC_006624	CTCC	2	8	117170	117177	0 %	25 %	0 %	75 %	57640079
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2185	NC_006624	GCTC	2	8	117230	117237	0 %	25 %	25 %	50 %	57640079
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2189	NC_006624	CCTGC	2	10	117424	117433	0 %	20 %	20 %	60 %	57640079
2190	NC_006624	AG	3	6	117444	117449	50 %	0 %	50 %	0 %	57640079
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2196	NC_006624	GTA	2	6	117868	117873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640080
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2202	NC_006624	TAT	2	6	118096	118101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640080
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2213	NC_006624	AGTC	2	8	118747	118754	25 %	25 %	25 %	25 %	57640081
2214	NC_006624	AAG	2	6	118757	118762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640081
2215	NC_006624	CTT	2	6	118862	118867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640081
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2222	NC_006624	CTT	2	6	119151	119156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640082
2223	NC_006624	AGT	2	6	119252	119257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640082
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2227	NC_006624	TCA	2	6	119458	119463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640082
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2229	NC_006624	CCA	2	6	119600	119605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640082
2230	NC_006624	CCG	2	6	119665	119670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640082
2231	NC_006624	TCGGGT	2	12	119687	119698	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	57640082
2232	NC_006624	CTC	2	6	119739	119744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640082
2233	NC_006624	TCCA	2	8	119769	119776	25 %	25 %	0 %	50 %	57640082
2234	NC_006624	TATG	2	8	120013	120020	25 %	50 %	25 %	0 %	57640083
2235	NC_006624	TGGT	2	8	120112	120119	0 %	50 %	50 %	0 %	57640083
2236	NC_006624	TGA	2	6	120164	120169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640083
2237	NC_006624	GA	3	6	120180	120185	50 %	0 %	50 %	0 %	57640083
2238	NC_006624	TCA	2	6	120268	120273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640083
2239	NC_006624	GAC	2	6	120281	120286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640083
2240	NC_006624	AG	3	6	120346	120351	50 %	0 %	50 %	0 %	57640083
2241	NC_006624	ACC	2	6	120421	120426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	57640083
2242	NC_006624	GAAAA	2	10	120469	120478	80 %	0 %	20 %	0 %	57640083
2243	NC_006624	GAC	3	9	120497	120505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640084
2244	NC_006624	GCG	2	6	120513	120518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640084
2245	NC_006624	CTT	2	6	120595	120600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640084
2246	NC_006624	CTT	2	6	120628	120633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640084
2247	NC_006624	GTT	2	6	120677	120682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640084
2248	NC_006624	GCG	2	6	120705	120710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640084
2249	NC_006624	TCG	2	6	120729	120734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640084
2250	NC_006624	CGT	2	6	120781	120786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640084
2251	NC_006624	TCCA	2	8	120795	120802	25 %	25 %	0 %	50 %	57640084
2252	NC_006624	GCT	2	6	120824	120829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640084
2253	NC_006624	GAG	2	6	120866	120871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640084
2254	NC_006624	TCCC	2	8	120898	120905	0 %	25 %	0 %	75 %	57640084
2255	NC_006624	CT	3	6	120931	120936	0 %	50 %	0 %	50 %	57640084
2256	NC_006624	AAGG	2	8	121482	121489	50 %	0 %	50 %	0 %	57640085
2257	NC_006624	CTA	2	6	121493	121498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640085
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2259	NC_006624	GCG	2	6	121693	121698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57640085
2260	NC_006624	CTC	2	6	121740	121745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640085
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2262	NC_006624	A	6	6	122033	122038	100 %	0 %	0 %	0 %	57640086
2263	NC_006624	TCG	2	6	122116	122121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640086
2264	NC_006624	TGCT	2	8	122164	122171	0 %	50 %	25 %	25 %	57640086
2265	NC_006624	AG	3	6	122189	122194	50 %	0 %	50 %	0 %	57640086
2266	NC_006624	AG	3	6	122204	122209	50 %	0 %	50 %	0 %	57640086
2267	NC_006624	TCG	2	6	122299	122304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640086
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2270	NC_006624	TGG	2	6	122368	122373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640086
2271	NC_006624	CTG	2	6	122400	122405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640086
2272	NC_006624	AGG	2	6	122428	122433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640086
2273	NC_006624	GTGA	2	8	122434	122441	25 %	25 %	50 %	0 %	57640086
2274	NC_006624	ATT	2	6	122478	122483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57640087
2275	NC_006624	CTC	2	6	122485	122490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640087
2276	NC_006624	CTG	2	6	122572	122577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640087
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2278	NC_006624	TGG	2	6	122660	122665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640087
2279	NC_006624	CTG	2	6	122713	122718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640088
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2283	NC_006624	GAAG	2	8	122922	122929	50 %	0 %	50 %	0 %	57640088
2284	NC_006624	TTC	2	6	122988	122993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640088
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2303	NC_006624	CGA	2	6	123766	123771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640089
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2322	NC_006624	GTG	2	6	124772	124777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640090
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2328	NC_006624	CCT	2	6	125114	125119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640090
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2335	NC_006624	AAC	2	6	125543	125548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640090
2336	NC_006624	CCTC	2	8	125590	125597	0 %	25 %	0 %	75 %	57640090
2337	NC_006624	TCG	2	6	125634	125639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640090
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2339	NC_006624	TGA	2	6	125680	125685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640090
2340	NC_006624	CAGGG	2	10	125974	125983	20 %	0 %	60 %	20 %	57640090
2341	NC_006624	TCT	2	6	126160	126165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640090
2342	NC_006624	TTG	3	9	126330	126338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57640091
2343	NC_006624	AGA	2	6	126349	126354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640091
2344	NC_006624	GAG	2	6	126447	126452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640091
2345	NC_006624	TATG	2	8	126536	126543	25 %	50 %	25 %	0 %	57640091
2346	NC_006624	C	6	6	126629	126634	0 %	0 %	0 %	100 %	57640091
2347	NC_006624	TTC	2	6	126658	126663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640091
2348	NC_006624	TAC	2	6	126702	126707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640091
2349	NC_006624	AAT	2	6	126731	126736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640091
2350	NC_006624	CGA	2	6	126769	126774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640091
2351	NC_006624	TAAC	2	8	126841	126848	50 %	25 %	0 %	25 %	57640091
2352	NC_006624	CAT	2	6	126929	126934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57640091
2353	NC_006624	AGG	2	6	126937	126942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640091
2354	NC_006624	ATA	2	6	127008	127013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57640091
2355	NC_006624	GAC	2	6	127115	127120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640091
2356	NC_006624	TGG	2	6	127141	127146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640091
2357	NC_006624	GT	3	6	127162	127167	0 %	50 %	50 %	0 %	57640091
2358	NC_006624	GGAT	2	8	127170	127177	25 %	25 %	50 %	0 %	57640091
2359	NC_006624	AGG	2	6	127198	127203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640091
2360	NC_006624	ATG	2	6	127206	127211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57640091
2361	NC_006624	CCT	2	6	127274	127279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640091
2362	NC_006624	CTT	2	6	127282	127287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57640091
2363	NC_006624	GCT	2	6	127290	127295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640091
2364	NC_006624	CTC	2	6	127311	127316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640091
2365	NC_006624	CT	3	6	127337	127342	0 %	50 %	0 %	50 %	57640091
2366	NC_006624	AGA	2	6	127352	127357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57640091
2367	NC_006624	GCT	2	6	127368	127373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640091
2368	NC_006624	ATTG	2	8	127376	127383	25 %	50 %	25 %	0 %	57640091
2369	NC_006624	GGGAA	2	10	127384	127393	40 %	0 %	60 %	0 %	57640091
2370	NC_006624	GGA	2	6	127397	127402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640091
2371	NC_006624	GTC	2	6	127418	127423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640091
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2475	NC_006624	CA	3	6	133994	133999	50 %	0 %	0 %	50 %	57640096
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2492	NC_006624	GTGA	2	8	135015	135022	25 %	25 %	50 %	0 %	57640098
2493	NC_006624	CAGG	2	8	135044	135051	25 %	0 %	50 %	25 %	57640098
2494	NC_006624	CGT	2	6	135059	135064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57640098
2495	NC_006624	CGC	2	6	135206	135211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57640098
2496	NC_006624	GGA	2	6	135242	135247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57640098
2497	NC_006624	GAC	2	6	135252	135257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57640098
2498	NC_006624	CCT	2	6	135322	135327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57640098
2499	NC_006624	TGG	2	6	135334	135339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57640098
2500	NC_006624	CAA	2	6	135367	135372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57640098

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