MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_006462	GAA	2	6	118193	118198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978311
3002	NC_006462	CCG	2	6	118243	118248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978311
3003	NC_006462	GCC	2	6	118286	118291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978311
3004	NC_006462	CGG	2	6	118315	118320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978311
3005	NC_006462	G	6	6	118467	118472	0 %	0 %	100 %	0 %	55978312
3006	NC_006462	TCT	2	6	118491	118496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978312
3007	NC_006462	CCT	2	6	118503	118508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978312
3008	NC_006462	AAG	2	6	118576	118581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978312
3009	NC_006462	CCG	2	6	118633	118638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978312
3010	NC_006462	CAC	2	6	118750	118755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978312
3011	NC_006462	GGC	2	6	118777	118782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978312
3012	NC_006462	CCT	2	6	118788	118793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978312
3013	NC_006462	CTT	2	6	118809	118814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978312
3014	NC_006462	TCC	2	6	118847	118852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978312
3015	NC_006462	CAG	2	6	118855	118860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978312
3016	NC_006462	CAC	2	6	118909	118914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978312
3017	NC_006462	CGC	2	6	119000	119005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978312
3018	NC_006462	TCCCA	2	10	119039	119048	20 %	20 %	0 %	60 %	55978312
3019	NC_006462	GCC	2	6	119234	119239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978312
3020	NC_006462	CGTC	2	8	119250	119257	0 %	25 %	25 %	50 %	55978312
3021	NC_006462	GCC	2	6	119315	119320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978312
3022	NC_006462	CTGA	2	8	119326	119333	25 %	25 %	25 %	25 %	55978312
3023	NC_006462	CGG	2	6	119337	119342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978312
3024	NC_006462	CCA	2	6	119373	119378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978312
3025	NC_006462	GGC	2	6	119379	119384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978312
3026	NC_006462	GGT	2	6	119461	119466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978312
3027	NC_006462	GTA	2	6	119482	119487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978312
3028	NC_006462	AAG	2	6	119516	119521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978312
3029	NC_006462	CCT	2	6	119623	119628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978312
3030	NC_006462	C	6	6	119643	119648	0 %	0 %	0 %	100 %	55978312
3031	NC_006462	GAC	2	6	119726	119731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978313
3032	NC_006462	CCCGG	2	10	119762	119771	0 %	0 %	40 %	60 %	55978313
3033	NC_006462	CTC	2	6	119787	119792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978313
3034	NC_006462	CGA	2	6	119804	119809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978313
3035	NC_006462	CCA	2	6	119903	119908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978313
3036	NC_006462	TCC	2	6	119917	119922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978313
3037	NC_006462	TGG	2	6	119935	119940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978313
3038	NC_006462	TAC	2	6	119967	119972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978313
3039	NC_006462	GGA	2	6	120044	120049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978313
3040	NC_006462	ATGG	2	8	120477	120484	25 %	25 %	50 %	0 %	55978314
3041	NC_006462	GCG	2	6	120582	120587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978314
3042	NC_006462	GCG	3	9	120593	120601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978314
3043	NC_006462	GCC	2	6	120679	120684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978314
3044	NC_006462	AGG	2	6	120691	120696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978314
3045	NC_006462	GGT	2	6	120723	120728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978314
3046	NC_006462	TGG	2	6	120734	120739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978314
3047	NC_006462	TGGG	2	8	120781	120788	0 %	25 %	75 %	0 %	55978314
3048	NC_006462	G	6	6	120786	120791	0 %	0 %	100 %	0 %	55978314
3049	NC_006462	GCG	2	6	120809	120814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978314
3050	NC_006462	CCT	2	6	120831	120836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978314
3051	NC_006462	CTG	2	6	120858	120863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978314
3052	NC_006462	TTC	2	6	120898	120903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978314
3053	NC_006462	GGCG	2	8	120921	120928	0 %	0 %	75 %	25 %	55978314
3054	NC_006462	TCT	2	6	120948	120953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978314
3055	NC_006462	CCT	2	6	120957	120962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978314
3056	NC_006462	GGC	2	6	120984	120989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978314
3057	NC_006462	GGC	3	9	120996	121004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978314
3058	NC_006462	CCT	2	6	121008	121013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978314
3059	NC_006462	CTC	2	6	121020	121025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978314
3060	NC_006462	GGCG	2	8	121065	121072	0 %	0 %	75 %	25 %	55978315
3061	NC_006462	GGC	2	6	121092	121097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978315
3062	NC_006462	G	6	6	121112	121117	0 %	0 %	100 %	0 %	55978315
3063	NC_006462	GGT	2	6	121125	121130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978315
3064	NC_006462	G	6	6	121144	121149	0 %	0 %	100 %	0 %	55978315
3065	NC_006462	CCCCA	2	10	121156	121165	20 %	0 %	0 %	80 %	55978315
3066	NC_006462	GAG	2	6	121171	121176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978315
3067	NC_006462	CCT	2	6	121251	121256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978315
3068	NC_006462	CTT	2	6	121263	121268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978315
3069	NC_006462	CGAG	2	8	121286	121293	25 %	0 %	50 %	25 %	55978315
3070	NC_006462	TCT	2	6	121337	121342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978315
3071	NC_006462	GGA	2	6	121350	121355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978315
3072	NC_006462	C	6	6	121394	121399	0 %	0 %	0 %	100 %	55978315
3073	NC_006462	CCA	2	6	121418	121423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978315
3074	NC_006462	CAC	2	6	121437	121442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978315
3075	NC_006462	CCG	2	6	121451	121456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978315
3076	NC_006462	ACC	2	6	121463	121468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978315
3077	NC_006462	ACT	2	6	121472	121477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978315
3078	NC_006462	CGCC	2	8	121479	121486	0 %	0 %	25 %	75 %	55978315
3079	NC_006462	CCA	2	6	121799	121804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978316
3080	NC_006462	CCA	2	6	121852	121857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978316
3081	NC_006462	G	6	6	121884	121889	0 %	0 %	100 %	0 %	55978316
3082	NC_006462	CTT	2	6	122000	122005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978317
3083	NC_006462	GGT	2	6	122027	122032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978317
3084	NC_006462	CCA	2	6	122054	122059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978317
3085	NC_006462	GAG	2	6	122085	122090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978317
3086	NC_006462	AGG	2	6	122110	122115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978317
3087	NC_006462	AGG	2	6	122146	122151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978317
3088	NC_006462	CGC	2	6	122190	122195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978317
3089	NC_006462	GAG	2	6	122223	122228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978317
3090	NC_006462	GGTA	2	8	122254	122261	25 %	25 %	50 %	0 %	55978317
3091	NC_006462	C	6	6	122269	122274	0 %	0 %	0 %	100 %	55978317
3092	NC_006462	AGGG	3	12	122294	122305	25 %	0 %	75 %	0 %	55978317
3093	NC_006462	CCA	3	9	122545	122553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978318
3094	NC_006462	CGT	2	6	122575	122580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978318
3095	NC_006462	AGG	3	9	122601	122609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978318
3096	NC_006462	GCG	2	6	122664	122669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978318
3097	NC_006462	CCT	2	6	122701	122706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978318
3098	NC_006462	CCA	2	6	122758	122763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978318
3099	NC_006462	GAG	2	6	122772	122777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978318
3100	NC_006462	CCT	2	6	122815	122820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978318
3101	NC_006462	CTC	2	6	122831	122836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978318
3102	NC_006462	GAGCCC	2	12	122920	122931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55978319
3103	NC_006462	GCG	2	6	122956	122961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978319
3104	NC_006462	CCT	2	6	122967	122972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978319
3105	NC_006462	CCGGG	2	10	122977	122986	0 %	0 %	60 %	40 %	55978319
3106	NC_006462	CTC	2	6	123019	123024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978319
3107	NC_006462	G	6	6	123042	123047	0 %	0 %	100 %	0 %	55978319
3108	NC_006462	CCT	3	9	123048	123056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978319
3109	NC_006462	GAG	2	6	123061	123066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978319
3110	NC_006462	GGA	2	6	123081	123086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978319
3111	NC_006462	CCT	3	9	123135	123143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978319
3112	NC_006462	GCA	2	6	123168	123173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978319
3113	NC_006462	GCG	2	6	123436	123441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978320
3114	NC_006462	CTC	2	6	123494	123499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978320
3115	NC_006462	GGA	2	6	123502	123507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978320
3116	NC_006462	TTC	2	6	123516	123521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978320
3117	NC_006462	TCG	2	6	123534	123539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978320
3118	NC_006462	CTC	2	6	123587	123592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978320
3119	NC_006462	GGGGC	2	10	123630	123639	0 %	0 %	80 %	20 %	55978320
3120	NC_006462	GCC	2	6	123701	123706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978320
3121	NC_006462	CCT	2	6	123751	123756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978320
3122	NC_006462	CTC	3	9	123758	123766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978320
3123	NC_006462	ACG	2	6	123786	123791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978320
3124	NC_006462	TTC	2	6	123863	123868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978320
3125	NC_006462	GCC	3	9	123908	123916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978320
3126	NC_006462	TGG	2	6	123945	123950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978320
3127	NC_006462	GCGG	2	8	124009	124016	0 %	0 %	75 %	25 %	55978320
3128	NC_006462	CTC	2	6	124034	124039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978320
3129	NC_006462	GGGC	2	8	124059	124066	0 %	0 %	75 %	25 %	55978320
3130	NC_006462	G	7	7	124075	124081	0 %	0 %	100 %	0 %	55978320
3131	NC_006462	GCT	2	6	124099	124104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978320
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3133	NC_006462	TGG	3	9	124295	124303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978321
3134	NC_006462	GCC	2	6	124305	124310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978321
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3137	NC_006462	GGA	2	6	124410	124415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978321
3138	NC_006462	GGTGGA	2	12	124416	124427	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55978321
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3140	NC_006462	CTC	2	6	124483	124488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978321
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3142	NC_006462	CTC	2	6	124795	124800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978322
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3154	NC_006462	CCT	2	6	125289	125294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978322
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3242	NC_006462	G	6	6	128668	128673	0 %	0 %	100 %	0 %	55978325
3243	NC_006462	G	7	7	128722	128728	0 %	0 %	100 %	0 %	55978325
3244	NC_006462	CTT	2	6	128807	128812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978325
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3247	NC_006462	G	6	6	128916	128921	0 %	0 %	100 %	0 %	55978325
3248	NC_006462	CAG	2	6	128933	128938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978325
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