MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 plasmid pTT27

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006462	CCACC	2	10	57473	57482	20 %	0 %	0 %	80 %	55978249
1502	NC_006462	GTG	3	9	57483	57491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978249
1503	NC_006462	GAGGC	2	10	57549	57558	20 %	0 %	60 %	20 %	55978249
1504	NC_006462	GGA	2	6	57575	57580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1505	NC_006462	TGGGGA	2	12	57616	57627	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55978249
1506	NC_006462	CGCC	2	8	57647	57654	0 %	0 %	25 %	75 %	55978249
1507	NC_006462	CCT	2	6	57665	57670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1508	NC_006462	GGC	2	6	57698	57703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978249
1509	NC_006462	AGG	2	6	57706	57711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978249
1510	NC_006462	CCT	2	6	57716	57721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978249
1511	NC_006462	GGCGG	2	10	57725	57734	0 %	0 %	80 %	20 %	55978249
1512	NC_006462	CGG	2	6	57746	57751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978249
1513	NC_006462	GGCCT	2	10	57873	57882	0 %	20 %	40 %	40 %	55978250
1514	NC_006462	CCT	3	9	57898	57906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978250
1515	NC_006462	TCA	2	6	57910	57915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55978250
1516	NC_006462	AGG	2	6	58017	58022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1517	NC_006462	TGC	2	6	58044	58049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978250
1518	NC_006462	CAC	2	6	58184	58189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978250
1519	NC_006462	CCT	2	6	58240	58245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978250
1520	NC_006462	AGG	2	6	58317	58322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1521	NC_006462	C	6	6	58370	58375	0 %	0 %	0 %	100 %	55978250
1522	NC_006462	GAG	2	6	58406	58411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1523	NC_006462	GAG	2	6	58442	58447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1524	NC_006462	CCG	2	6	58462	58467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978250
1525	NC_006462	CGT	2	6	58495	58500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978250
1526	NC_006462	GGC	2	6	58562	58567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978250
1527	NC_006462	GCG	2	6	58628	58633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978250
1528	NC_006462	CTC	2	6	58703	58708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978250
1529	NC_006462	CAC	2	6	58718	58723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978250
1530	NC_006462	GGC	2	6	58736	58741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978250
1531	NC_006462	GGC	2	6	58745	58750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978250
1532	NC_006462	GAA	2	6	58787	58792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978250
1533	NC_006462	C	6	6	58803	58808	0 %	0 %	0 %	100 %	55978250
1534	NC_006462	TCCTC	2	10	58849	58858	0 %	40 %	0 %	60 %	55978250
1535	NC_006462	GGT	4	12	58913	58924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978250
1536	NC_006462	GAA	2	6	58964	58969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978250
1537	NC_006462	G	6	6	58978	58983	0 %	0 %	100 %	0 %	55978250
1538	NC_006462	C	6	6	59006	59011	0 %	0 %	0 %	100 %	55978250
1539	NC_006462	TGA	2	6	59092	59097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978250
1540	NC_006462	GAG	2	6	59117	59122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1541	NC_006462	CCT	2	6	59150	59155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978250
1542	NC_006462	TCC	2	6	59184	59189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978250
1543	NC_006462	CGT	2	6	59200	59205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978250
1544	NC_006462	AGACGA	2	12	59206	59217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	55978250
1545	NC_006462	AAGG	2	8	59241	59248	50 %	0 %	50 %	0 %	55978250
1546	NC_006462	AGG	2	6	59286	59291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978250
1547	NC_006462	GAA	2	6	59522	59527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978251
1548	NC_006462	CCT	2	6	59545	59550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1549	NC_006462	CCT	2	6	59578	59583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1550	NC_006462	TGG	2	6	59673	59678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978251
1551	NC_006462	GAA	2	6	59767	59772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978251
1552	NC_006462	TCC	2	6	59781	59786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1553	NC_006462	C	6	6	59837	59842	0 %	0 %	0 %	100 %	55978251
1554	NC_006462	AGG	3	9	59943	59951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978251
1555	NC_006462	GAAG	2	8	59958	59965	50 %	0 %	50 %	0 %	55978251
1556	NC_006462	TCC	2	6	60000	60005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1557	NC_006462	ACC	2	6	60018	60023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978251
1558	NC_006462	AGG	2	6	60069	60074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978251
1559	NC_006462	GCC	2	6	60077	60082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978251
1560	NC_006462	CCG	2	6	60132	60137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978251
1561	NC_006462	CCG	2	6	60160	60165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978251
1562	NC_006462	CCA	2	6	60184	60189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978251
1563	NC_006462	AGG	2	6	60210	60215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978251
1564	NC_006462	AGG	2	6	60219	60224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978251
1565	NC_006462	TCC	3	9	60246	60254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1566	NC_006462	GAA	2	6	60298	60303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55978251
1567	NC_006462	CTC	2	6	60371	60376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1568	NC_006462	GGGA	2	8	60415	60422	25 %	0 %	75 %	0 %	55978251
1569	NC_006462	CCG	2	6	60485	60490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978251
1570	NC_006462	GC	3	6	60642	60647	0 %	0 %	50 %	50 %	55978251
1571	NC_006462	GCCG	2	8	60676	60683	0 %	0 %	50 %	50 %	55978251
1572	NC_006462	CCG	2	6	60707	60712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978251
1573	NC_006462	CGC	2	6	60714	60719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978251
1574	NC_006462	CAAGG	2	10	60726	60735	40 %	0 %	40 %	20 %	55978251
1575	NC_006462	CTC	2	6	60752	60757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1576	NC_006462	C	6	6	60857	60862	0 %	0 %	0 %	100 %	55978251
1577	NC_006462	GGC	2	6	60877	60882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978251
1578	NC_006462	AGG	2	6	60903	60908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978251
1579	NC_006462	GCC	2	6	60914	60919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978251
1580	NC_006462	AGG	2	6	61080	61085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978251
1581	NC_006462	C	7	7	61123	61129	0 %	0 %	0 %	100 %	55978251
1582	NC_006462	CTCC	2	8	61160	61167	0 %	25 %	0 %	75 %	55978251
1583	NC_006462	CGCTC	2	10	61252	61261	0 %	20 %	20 %	60 %	55978251
1584	NC_006462	CCT	2	6	61286	61291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1585	NC_006462	AGG	2	6	61375	61380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978251
1586	NC_006462	C	6	6	61410	61415	0 %	0 %	0 %	100 %	55978251
1587	NC_006462	CGG	2	6	61419	61424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978251
1588	NC_006462	CCT	2	6	61450	61455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978251
1589	NC_006462	GGA	2	6	61464	61469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978251
1590	NC_006462	ACC	2	6	61479	61484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978251
1591	NC_006462	GGT	2	6	61564	61569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978251
1592	NC_006462	GGC	2	6	61783	61788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978252
1593	NC_006462	GAT	2	6	61807	61812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978252
1594	NC_006462	GGT	2	6	61849	61854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978252
1595	NC_006462	TCT	3	9	61860	61868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55978252
1596	NC_006462	GAC	2	6	61871	61876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55978252
1597	NC_006462	TGC	2	6	61887	61892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978252
1598	NC_006462	TCC	2	6	61947	61952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978252
1599	NC_006462	ATG	2	6	61955	61960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55978252
1600	NC_006462	C	6	6	62061	62066	0 %	0 %	0 %	100 %	55978252
1601	NC_006462	GTG	2	6	62069	62074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55978252
1602	NC_006462	TCG	2	6	62262	62267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978253
1603	NC_006462	GTCC	2	8	62324	62331	0 %	25 %	25 %	50 %	55978253
1604	NC_006462	CCT	2	6	62332	62337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978253
1605	NC_006462	CCT	2	6	62341	62346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978253
1606	NC_006462	GGCC	2	8	62376	62383	0 %	0 %	50 %	50 %	55978253
1607	NC_006462	TCC	2	6	62391	62396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978253
1608	NC_006462	CAC	2	6	62405	62410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978253
1609	NC_006462	GTTCAC	2	12	62471	62482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	55978253
1610	NC_006462	GGA	2	6	62503	62508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978253
1611	NC_006462	GGA	2	6	62524	62529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978253
1612	NC_006462	CGG	2	6	62590	62595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978253
1613	NC_006462	CCG	2	6	62737	62742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978253
1614	NC_006462	G	6	6	62773	62778	0 %	0 %	100 %	0 %	55978253
1615	NC_006462	G	6	6	62785	62790	0 %	0 %	100 %	0 %	55978253
1616	NC_006462	GGC	2	6	62864	62869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978253
1617	NC_006462	GGC	2	6	62894	62899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978253
1618	NC_006462	CGT	3	9	62935	62943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55978253
1619	NC_006462	TCC	2	6	63057	63062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978254
1620	NC_006462	GGTCC	2	10	63080	63089	0 %	20 %	40 %	40 %	55978254
1621	NC_006462	C	6	6	63124	63129	0 %	0 %	0 %	100 %	55978254
1622	NC_006462	CCGT	2	8	63159	63166	0 %	25 %	25 %	50 %	55978254
1623	NC_006462	CAGGTG	2	12	63173	63184	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55978254
1624	NC_006462	GCG	2	6	63246	63251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55978254
1625	NC_006462	AGG	2	6	63336	63341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55978254
1626	NC_006462	CGC	2	6	63363	63368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978254
1627	NC_006462	ACC	2	6	63369	63374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55978254
1628	NC_006462	CCT	2	6	63415	63420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978254
1629	NC_006462	CCG	2	6	63478	63483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55978254
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1753	NC_006462	CCCT	2	8	68762	68769	0 %	25 %	0 %	75 %	55978260
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1755	NC_006462	CTC	2	6	68822	68827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55978260
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