MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_006461	CCA	2	6	1546925	1546930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981602
40003	NC_006461	AGG	2	6	1546951	1546956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981602
40004	NC_006461	TCA	2	6	1546970	1546975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981602
40005	NC_006461	GGC	2	6	1546992	1546997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981602
40006	NC_006461	CCA	2	6	1547021	1547026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981602
40007	NC_006461	GGCCC	2	10	1547040	1547049	0 %	0 %	40 %	60 %	55981602
40008	NC_006461	TGG	2	6	1547081	1547086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981602
40009	NC_006461	CCA	2	6	1547117	1547122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981602
40010	NC_006461	CAC	2	6	1547169	1547174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981602
40011	NC_006461	GAG	2	6	1547232	1547237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981602
40012	NC_006461	AG	3	6	1547236	1547241	50 %	0 %	50 %	0 %	55981602
40013	NC_006461	GGA	2	6	1547297	1547302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981602
40014	NC_006461	TCC	2	6	1547362	1547367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981602
40015	NC_006461	CCCG	2	8	1547385	1547392	0 %	0 %	25 %	75 %	55981602
40016	NC_006461	AGG	3	9	1547449	1547457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981602
40017	NC_006461	GAA	2	6	1547466	1547471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981602
40018	NC_006461	GA	3	6	1547497	1547502	50 %	0 %	50 %	0 %	55981602
40019	NC_006461	CGG	2	6	1547540	1547545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981602
40020	NC_006461	CCA	2	6	1547567	1547572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981602
40021	NC_006461	CCG	3	9	1547642	1547650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981602
40022	NC_006461	CGC	2	6	1547681	1547686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981602
40023	NC_006461	CGG	2	6	1547771	1547776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981602
40024	NC_006461	GCC	2	6	1547792	1547797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981602
40025	NC_006461	AGG	2	6	1547833	1547838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981602
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40027	NC_006461	ATC	2	6	1547875	1547880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981602
40028	NC_006461	TGG	2	6	1547992	1547997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981603
40029	NC_006461	CTT	2	6	1548023	1548028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981603
40030	NC_006461	GTAGCC	2	12	1548077	1548088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55981603
40031	NC_006461	CAC	2	6	1548131	1548136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981603
40032	NC_006461	CTC	2	6	1548176	1548181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981603
40033	NC_006461	GC	3	6	1548198	1548203	0 %	0 %	50 %	50 %	55981603
40034	NC_006461	AGA	2	6	1548205	1548210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981603
40035	NC_006461	GCT	2	6	1548211	1548216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981603
40036	NC_006461	TCG	2	6	1548270	1548275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981603
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40038	NC_006461	GTT	2	6	1548308	1548313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55981603
40039	NC_006461	TGG	2	6	1548319	1548324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981603
40040	NC_006461	ATG	2	6	1548330	1548335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981603
40041	NC_006461	TCC	2	6	1548375	1548380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981603
40042	NC_006461	TCG	2	6	1548450	1548455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981603
40043	NC_006461	GTT	2	6	1548479	1548484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55981603
40044	NC_006461	TCT	2	6	1548505	1548510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981603
40045	NC_006461	GAA	2	6	1548524	1548529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981603
40046	NC_006461	CTG	2	6	1548530	1548535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981603
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40049	NC_006461	GGA	2	6	1548616	1548621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981603
40050	NC_006461	TCC	2	6	1548637	1548642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981603
40051	NC_006461	AGG	2	6	1548657	1548662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981603
40052	NC_006461	CTT	2	6	1548671	1548676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981603
40053	NC_006461	CTT	2	6	1548692	1548697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981603
40054	NC_006461	AAG	2	6	1548765	1548770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981603
40055	NC_006461	GGA	2	6	1548802	1548807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981603
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40057	NC_006461	TTG	2	6	1548870	1548875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55981603
40058	NC_006461	GC	3	6	1548933	1548938	0 %	0 %	50 %	50 %	55981603
40059	NC_006461	GCC	2	6	1549004	1549009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981603
40060	NC_006461	CCA	2	6	1549018	1549023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981603
40061	NC_006461	GGAG	2	8	1549024	1549031	25 %	0 %	75 %	0 %	55981603
40062	NC_006461	ACC	2	6	1549056	1549061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981603
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40064	NC_006461	GCTTGA	2	12	1549150	1549161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55981603
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40066	NC_006461	GAA	2	6	1549220	1549225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981603
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40069	NC_006461	GTA	3	9	1549358	1549366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55981603
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40084	NC_006461	CCG	2	6	1550368	1550373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981604
40085	NC_006461	G	6	6	1550377	1550382	0 %	0 %	100 %	0 %	55981604
40086	NC_006461	CCA	2	6	1550410	1550415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981604
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40089	NC_006461	GGCT	2	8	1550543	1550550	0 %	25 %	50 %	25 %	55981605
40090	NC_006461	CACCTC	2	12	1550606	1550617	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55981605
40091	NC_006461	CGC	2	6	1550621	1550626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981605
40092	NC_006461	CACC	2	8	1550655	1550662	25 %	0 %	0 %	75 %	55981605
40093	NC_006461	CTC	2	6	1550663	1550668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981605
40094	NC_006461	TCCC	2	8	1550694	1550701	0 %	25 %	0 %	75 %	55981605
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40099	NC_006461	GGGCCT	2	12	1550860	1550871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55981605
40100	NC_006461	CCT	3	9	1550880	1550888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981605
40101	NC_006461	CTC	4	12	1550894	1550905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981605
40102	NC_006461	GAA	2	6	1550921	1550926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981605
40103	NC_006461	CGG	2	6	1550942	1550947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981605
40104	NC_006461	GCG	2	6	1550948	1550953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981605
40105	NC_006461	AGCG	2	8	1551014	1551021	25 %	0 %	50 %	25 %	55981605
40106	NC_006461	GGAGGG	2	12	1551052	1551063	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	55981605
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40108	NC_006461	C	7	7	1551079	1551085	0 %	0 %	0 %	100 %	55981605
40109	NC_006461	TGG	2	6	1551087	1551092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981605
40110	NC_006461	CGC	2	6	1551106	1551111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981605
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40112	NC_006461	GGA	2	6	1551145	1551150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981605
40113	NC_006461	GGT	2	6	1551157	1551162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981605
40114	NC_006461	G	7	7	1551191	1551197	0 %	0 %	100 %	0 %	55981605
40115	NC_006461	GGC	2	6	1551241	1551246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981605
40116	NC_006461	GC	3	6	1551356	1551361	0 %	0 %	50 %	50 %	55981605
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40118	NC_006461	CACCG	2	10	1551401	1551410	20 %	0 %	20 %	60 %	55981605
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40120	NC_006461	GAC	2	6	1551455	1551460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981605
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40233	NC_006461	CGCC	2	8	1555154	1555161	0 %	0 %	25 %	75 %	55981609
40234	NC_006461	CGA	2	6	1555199	1555204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981609
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40238	NC_006461	CTG	2	6	1555323	1555328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981609
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40357	NC_006461	C	6	6	1560057	1560062	0 %	0 %	0 %	100 %	55981614
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40373	NC_006461	C	6	6	1560675	1560680	0 %	0 %	0 %	100 %	55981614
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40476	NC_006461	TCCA	2	8	1565219	1565226	25 %	25 %	0 %	50 %	55981619
40477	NC_006461	AAG	2	6	1565239	1565244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981619
40478	NC_006461	AGG	2	6	1565276	1565281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
40479	NC_006461	GAG	2	6	1565293	1565298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
40480	NC_006461	ACC	2	6	1565327	1565332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981619
40481	NC_006461	CCA	2	6	1565337	1565342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981619
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40490	NC_006461	AGG	2	6	1565609	1565614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
40491	NC_006461	GAG	2	6	1565617	1565622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981619
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