MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006461	CCTCCA	2	12	137097	137108	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980109
3502	NC_006461	CTC	2	6	137188	137193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980109
3503	NC_006461	G	6	6	137226	137231	0 %	0 %	100 %	0 %	55980109
3504	NC_006461	GAG	2	6	137302	137307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980109
3505	NC_006461	GGT	2	6	137352	137357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980109
3506	NC_006461	G	6	6	137376	137381	0 %	0 %	100 %	0 %	55980109
3507	NC_006461	GGC	2	6	137436	137441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980109
3508	NC_006461	GGT	2	6	137454	137459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980109
3509	NC_006461	CTC	2	6	137482	137487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980109
3510	NC_006461	GGC	2	6	137551	137556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980109
3511	NC_006461	CAT	2	6	137565	137570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980109
3512	NC_006461	ACCT	2	8	137593	137600	25 %	25 %	0 %	50 %	55980109
3513	NC_006461	GGC	3	9	137604	137612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980109
3514	NC_006461	ACC	2	6	137654	137659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980109
3515	NC_006461	GGT	2	6	137847	137852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980109
3516	NC_006461	GGC	2	6	137951	137956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980109
3517	NC_006461	CGGG	2	8	137989	137996	0 %	0 %	75 %	25 %	55980109
3518	NC_006461	TGG	3	9	138005	138013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980109
3519	NC_006461	AGG	2	6	138185	138190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980110
3520	NC_006461	GAA	2	6	138211	138216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980110
3521	NC_006461	GGCG	2	8	138315	138322	0 %	0 %	75 %	25 %	55980110
3522	NC_006461	AAGGCC	2	12	138329	138340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980110
3523	NC_006461	TCC	3	9	138341	138349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980110
3524	NC_006461	TCCCCC	2	12	138353	138364	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	55980110
3525	NC_006461	GGA	2	6	138456	138461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980110
3526	NC_006461	CCA	2	6	138531	138536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980110
3527	NC_006461	CTC	2	6	138583	138588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980110
3528	NC_006461	GCG	2	6	138793	138798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980111
3529	NC_006461	CCCT	2	8	138809	138816	0 %	25 %	0 %	75 %	55980111
3530	NC_006461	GCC	2	6	138833	138838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980111
3531	NC_006461	AGG	2	6	138852	138857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
3532	NC_006461	CCGC	2	8	138858	138865	0 %	0 %	25 %	75 %	55980111
3533	NC_006461	GGA	2	6	138931	138936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
3534	NC_006461	CCG	2	6	138942	138947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980111
3535	NC_006461	GGA	2	6	138976	138981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
3536	NC_006461	GAA	2	6	138988	138993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980111
3537	NC_006461	ACC	2	6	139008	139013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980111
3538	NC_006461	CTC	2	6	139019	139024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980111
3539	NC_006461	GAA	2	6	139042	139047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980111
3540	NC_006461	CCGGGG	2	12	139068	139079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980111
3541	NC_006461	AGGTGG	2	12	139152	139163	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980111
3542	NC_006461	CCT	2	6	139237	139242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980111
3543	NC_006461	GCC	3	9	139299	139307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980111
3544	NC_006461	CCT	2	6	139311	139316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980111
3545	NC_006461	GAG	2	6	139349	139354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
3546	NC_006461	GGT	2	6	139360	139365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980111
3547	NC_006461	GAG	2	6	139376	139381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
3548	NC_006461	CGG	2	6	139443	139448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980111
3549	NC_006461	GGT	2	6	139453	139458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980111
3550	NC_006461	GAA	2	6	139567	139572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980111
3551	NC_006461	GGA	2	6	139576	139581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
3552	NC_006461	ACC	2	6	139671	139676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980111
3553	NC_006461	GGGC	2	8	139740	139747	0 %	0 %	75 %	25 %	55980111
3554	NC_006461	GCC	3	9	139764	139772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980111
3555	NC_006461	GGA	2	6	139780	139785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980111
3556	NC_006461	TCC	2	6	139816	139821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3557	NC_006461	GGT	2	6	139880	139885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980112
3558	NC_006461	TCAGGG	2	12	139919	139930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980112
3559	NC_006461	TCC	2	6	139951	139956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3560	NC_006461	TGA	2	6	139967	139972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980112
3561	NC_006461	CCT	2	6	139985	139990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3562	NC_006461	GTC	2	6	140010	140015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980112
3563	NC_006461	GC	3	6	140031	140036	0 %	0 %	50 %	50 %	55980112
3564	NC_006461	CAT	2	6	140079	140084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980112
3565	NC_006461	GGC	2	6	140134	140139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980112
3566	NC_006461	GAG	3	9	140148	140156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980112
3567	NC_006461	CCCG	2	8	140188	140195	0 %	0 %	25 %	75 %	55980112
3568	NC_006461	TGG	2	6	140257	140262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980112
3569	NC_006461	CCT	2	6	140315	140320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3570	NC_006461	CCA	2	6	140330	140335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980112
3571	NC_006461	CCT	2	6	140381	140386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980112
3572	NC_006461	CT	3	6	140422	140427	0 %	50 %	0 %	50 %	55980112
3573	NC_006461	TCC	2	6	140517	140522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980113
3574	NC_006461	C	7	7	140542	140548	0 %	0 %	0 %	100 %	55980113
3575	NC_006461	GGC	2	6	140566	140571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980113
3576	NC_006461	CCCTC	2	10	140604	140613	0 %	20 %	0 %	80 %	55980113
3577	NC_006461	CCG	2	6	140615	140620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980113
3578	NC_006461	C	6	6	140659	140664	0 %	0 %	0 %	100 %	55980113
3579	NC_006461	GCCG	2	8	140686	140693	0 %	0 %	50 %	50 %	55980113
3580	NC_006461	AGG	2	6	140751	140756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3581	NC_006461	GAG	2	6	140759	140764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3582	NC_006461	GGA	2	6	140770	140775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3583	NC_006461	TCC	2	6	140874	140879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980113
3584	NC_006461	CGG	2	6	140895	140900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980113
3585	NC_006461	CCA	2	6	140926	140931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980113
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3587	NC_006461	GAG	2	6	140960	140965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3588	NC_006461	GGA	3	9	141010	141018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3589	NC_006461	G	6	6	141034	141039	0 %	0 %	100 %	0 %	55980113
3590	NC_006461	GAG	2	6	141056	141061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3591	NC_006461	CCT	2	6	141070	141075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980113
3592	NC_006461	AGG	2	6	141114	141119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3593	NC_006461	AGG	2	6	141123	141128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980113
3594	NC_006461	CGGG	2	8	141131	141138	0 %	0 %	75 %	25 %	55980113
3595	NC_006461	C	6	6	141183	141188	0 %	0 %	0 %	100 %	55980113
3596	NC_006461	GGT	2	6	141211	141216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980113
3597	NC_006461	AAG	2	6	141269	141274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980113
3598	NC_006461	CCG	3	9	141277	141285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980113
3599	NC_006461	ACC	2	6	141300	141305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980113
3600	NC_006461	CCT	2	6	141340	141345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980113
3601	NC_006461	AAGG	2	8	141349	141356	50 %	0 %	50 %	0 %	55980113
3602	NC_006461	CCT	2	6	141378	141383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980114
3603	NC_006461	G	6	6	141426	141431	0 %	0 %	100 %	0 %	55980114
3604	NC_006461	TCC	2	6	141440	141445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980114
3605	NC_006461	GGA	2	6	141465	141470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980114
3606	NC_006461	CCCGG	2	10	141549	141558	0 %	0 %	40 %	60 %	55980114
3607	NC_006461	GAG	2	6	141577	141582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980114
3608	NC_006461	CCG	2	6	141592	141597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980114
3609	NC_006461	GAGGGG	2	12	141601	141612	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	55980114
3610	NC_006461	TCCAGG	2	12	141641	141652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55980114
3611	NC_006461	AGG	3	9	141650	141658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980114
3612	NC_006461	CCCG	2	8	141686	141693	0 %	0 %	25 %	75 %	55980114
3613	NC_006461	CTC	2	6	141724	141729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980114
3614	NC_006461	GTC	2	6	141754	141759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980114
3615	NC_006461	CCCGG	2	10	141796	141805	0 %	0 %	40 %	60 %	55980114
3616	NC_006461	GGGA	2	8	141824	141831	25 %	0 %	75 %	0 %	55980114
3617	NC_006461	AGG	2	6	141860	141865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980114
3618	NC_006461	TCG	2	6	141878	141883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980114
3619	NC_006461	TCCAG	2	10	141891	141900	20 %	20 %	20 %	40 %	55980114
3620	NC_006461	AGG	2	6	141923	141928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980114
3621	NC_006461	CCT	2	6	141936	141941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980114
3622	NC_006461	GCC	2	6	141950	141955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980114
3623	NC_006461	GCCCC	2	10	141969	141978	0 %	0 %	20 %	80 %	55980114
3624	NC_006461	TCC	2	6	142019	142024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980114
3625	NC_006461	CCGC	2	8	142160	142167	0 %	0 %	25 %	75 %	55980115
3626	NC_006461	CCT	2	6	142193	142198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980115
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3629	NC_006461	C	6	6	142244	142249	0 %	0 %	0 %	100 %	55980115
3630	NC_006461	CGA	2	6	142286	142291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980115
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3633	NC_006461	TCC	2	6	142369	142374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980115
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3743	NC_006461	CGT	2	6	147303	147308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980121
3744	NC_006461	TGA	2	6	147366	147371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980121
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3746	NC_006461	ATG	2	6	147518	147523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980121
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3750	NC_006461	CCG	2	6	147692	147697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980121
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