MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_006461	CCT	2	6	1220336	1220341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981247
31502	NC_006461	CCA	2	6	1220342	1220347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981247
31503	NC_006461	GAG	2	6	1220367	1220372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981247
31504	NC_006461	GGA	2	6	1220387	1220392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981247
31505	NC_006461	GCG	2	6	1220422	1220427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981247
31506	NC_006461	CTC	3	9	1220469	1220477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981247
31507	NC_006461	GCC	2	6	1220542	1220547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981247
31508	NC_006461	CCG	2	6	1220618	1220623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981247
31509	NC_006461	CCGC	2	8	1220648	1220655	0 %	0 %	25 %	75 %	55981247
31510	NC_006461	ACC	2	6	1220713	1220718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981247
31511	NC_006461	CTG	2	6	1220724	1220729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981247
31512	NC_006461	GGCCC	2	10	1220751	1220760	0 %	0 %	40 %	60 %	55981247
31513	NC_006461	CCT	2	6	1220809	1220814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981248
31514	NC_006461	GGCCTC	2	12	1220873	1220884	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981248
31515	NC_006461	GAG	2	6	1220906	1220911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981248
31516	NC_006461	CCGC	2	8	1220923	1220930	0 %	0 %	25 %	75 %	55981248
31517	NC_006461	GGCCTT	2	12	1220957	1220968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981248
31518	NC_006461	GGCCTC	2	12	1220969	1220980	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981248
31519	NC_006461	GGCCTC	2	12	1220996	1221007	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981248
31520	NC_006461	CTC	2	6	1221023	1221028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981248
31521	NC_006461	CCT	2	6	1221031	1221036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981248
31522	NC_006461	GGC	2	6	1221041	1221046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981248
31523	NC_006461	GCT	2	6	1221064	1221069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981248
31524	NC_006461	CCG	2	6	1221150	1221155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981248
31525	NC_006461	GCGCG	2	10	1221240	1221249	0 %	0 %	60 %	40 %	55981249
31526	NC_006461	GCG	2	6	1221334	1221339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981249
31527	NC_006461	CCTCGC	2	12	1221343	1221354	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981249
31528	NC_006461	GGA	2	6	1221409	1221414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981249
31529	NC_006461	GGC	2	6	1221421	1221426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981249
31530	NC_006461	TCC	2	6	1221471	1221476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31531	NC_006461	GGC	2	6	1221491	1221496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981249
31532	NC_006461	CCT	2	6	1221523	1221528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31533	NC_006461	GTG	2	6	1221539	1221544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981249
31534	NC_006461	ACT	2	6	1221546	1221551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55981249
31535	NC_006461	CCT	2	6	1221598	1221603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31536	NC_006461	ACG	2	6	1221657	1221662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981249
31537	NC_006461	CTC	2	6	1221707	1221712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31538	NC_006461	TGG	2	6	1221762	1221767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981249
31539	NC_006461	AGA	2	6	1221783	1221788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981249
31540	NC_006461	G	7	7	1221874	1221880	0 %	0 %	100 %	0 %	55981249
31541	NC_006461	GGT	2	6	1221913	1221918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981249
31542	NC_006461	CTC	2	6	1221928	1221933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31543	NC_006461	GAG	2	6	1221956	1221961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981249
31544	NC_006461	CCT	2	6	1222018	1222023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31545	NC_006461	GCC	2	6	1222026	1222031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981249
31546	NC_006461	AGG	2	6	1222038	1222043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981249
31547	NC_006461	C	6	6	1222072	1222077	0 %	0 %	0 %	100 %	55981249
31548	NC_006461	AGG	2	6	1222128	1222133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981249
31549	NC_006461	CTC	2	6	1222154	1222159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31550	NC_006461	AGG	2	6	1222161	1222166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981249
31551	NC_006461	CCA	2	6	1222195	1222200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981249
31552	NC_006461	TGG	2	6	1222227	1222232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981249
31553	NC_006461	GCC	2	6	1222238	1222243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981249
31554	NC_006461	CCT	2	6	1222258	1222263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31555	NC_006461	GTG	2	6	1222268	1222273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981249
31556	NC_006461	ACC	2	6	1222296	1222301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981249
31557	NC_006461	TCC	2	6	1222305	1222310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981249
31558	NC_006461	ACC	2	6	1222314	1222319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981249
31559	NC_006461	CCT	2	6	1222384	1222389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981250
31560	NC_006461	GCA	2	6	1222402	1222407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981250
31561	NC_006461	TCTGG	2	10	1222408	1222417	0 %	40 %	40 %	20 %	55981250
31562	NC_006461	GGGCC	2	10	1222423	1222432	0 %	0 %	60 %	40 %	55981250
31563	NC_006461	GAGGAC	2	12	1222433	1222444	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55981250
31564	NC_006461	TGG	2	6	1222449	1222454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981250
31565	NC_006461	CTC	2	6	1222505	1222510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981250
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31567	NC_006461	CCGGGT	2	12	1222552	1222563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55981250
31568	NC_006461	GTGG	2	8	1222567	1222574	0 %	25 %	75 %	0 %	55981250
31569	NC_006461	CGC	2	6	1222710	1222715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981251
31570	NC_006461	C	6	6	1222756	1222761	0 %	0 %	0 %	100 %	55981251
31571	NC_006461	GCTGGA	2	12	1222797	1222808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55981251
31572	NC_006461	GCCTCC	2	12	1222814	1222825	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55981251
31573	NC_006461	C	6	6	1222824	1222829	0 %	0 %	0 %	100 %	55981251
31574	NC_006461	G	6	6	1222841	1222846	0 %	0 %	100 %	0 %	55981251
31575	NC_006461	GGA	2	6	1222893	1222898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981251
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31577	NC_006461	CGG	2	6	1222988	1222993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981252
31578	NC_006461	TCC	2	6	1222994	1222999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981252
31579	NC_006461	ACGG	2	8	1223002	1223009	25 %	0 %	50 %	25 %	55981252
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31581	NC_006461	CCCACG	2	12	1223102	1223113	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55981252
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31584	NC_006461	G	6	6	1223229	1223234	0 %	0 %	100 %	0 %	55981252
31585	NC_006461	GGCT	2	8	1223254	1223261	0 %	25 %	50 %	25 %	55981252
31586	NC_006461	GTG	3	9	1223329	1223337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981252
31587	NC_006461	CTC	2	6	1223428	1223433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981252
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31589	NC_006461	AAG	2	6	1223500	1223505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981252
31590	NC_006461	GTG	2	6	1223506	1223511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981252
31591	NC_006461	ACA	2	6	1223522	1223527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55981252
31592	NC_006461	C	7	7	1223532	1223538	0 %	0 %	0 %	100 %	55981252
31593	NC_006461	AGG	2	6	1223633	1223638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981252
31594	NC_006461	TGGGCC	2	12	1223661	1223672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55981253
31595	NC_006461	GAA	2	6	1223734	1223739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981253
31596	NC_006461	CTCC	2	8	1223800	1223807	0 %	25 %	0 %	75 %	55981253
31597	NC_006461	GGA	2	6	1223896	1223901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981253
31598	NC_006461	GAG	2	6	1223930	1223935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981253
31599	NC_006461	CTC	2	6	1223948	1223953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981253
31600	NC_006461	CTC	2	6	1223993	1223998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981253
31601	NC_006461	GAC	2	6	1224080	1224085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981253
31602	NC_006461	ACGCCT	2	12	1224165	1224176	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55981253
31603	NC_006461	GGC	2	6	1224210	1224215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981253
31604	NC_006461	GGC	2	6	1224226	1224231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981253
31605	NC_006461	CG	4	8	1224350	1224357	0 %	0 %	50 %	50 %	55981254
31606	NC_006461	GGA	2	6	1224434	1224439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981254
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31608	NC_006461	GTG	2	6	1224507	1224512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981254
31609	NC_006461	CTTCCC	2	12	1224521	1224532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981254
31610	NC_006461	CTT	2	6	1224536	1224541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981254
31611	NC_006461	G	6	6	1224545	1224550	0 %	0 %	100 %	0 %	55981254
31612	NC_006461	TGG	2	6	1224562	1224567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981254
31613	NC_006461	GCCT	2	8	1224570	1224577	0 %	25 %	25 %	50 %	55981254
31614	NC_006461	GCCC	2	8	1224596	1224603	0 %	0 %	25 %	75 %	55981254
31615	NC_006461	GGA	2	6	1224617	1224622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981254
31616	NC_006461	CCG	2	6	1224656	1224661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981254
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