MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30003	NC_006461	GGA	2	6	1164915	1164920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981196
30004	NC_006461	AGG	3	9	1164938	1164946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981196
30005	NC_006461	CCT	2	6	1164963	1164968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981196
30006	NC_006461	CATC	2	8	1165020	1165027	25 %	25 %	0 %	50 %	55981196
30007	NC_006461	CTT	2	6	1165042	1165047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981196
30008	NC_006461	GGT	2	6	1165092	1165097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981196
30009	NC_006461	CAC	2	6	1165114	1165119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981196
30010	NC_006461	CTC	2	6	1165147	1165152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981196
30011	NC_006461	CCA	2	6	1165164	1165169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981196
30012	NC_006461	AGGT	2	8	1165193	1165200	25 %	25 %	50 %	0 %	55981196
30013	NC_006461	GTC	2	6	1165255	1165260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981196
30014	NC_006461	TCT	2	6	1165275	1165280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981196
30015	NC_006461	CTC	2	6	1165291	1165296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981196
30016	NC_006461	AGG	2	6	1165304	1165309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981196
30017	NC_006461	G	6	6	1165368	1165373	0 %	0 %	100 %	0 %	55981196
30018	NC_006461	GGT	2	6	1165422	1165427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981196
30019	NC_006461	GCG	2	6	1165432	1165437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981196
30020	NC_006461	TGC	2	6	1165463	1165468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55981196
30021	NC_006461	TCC	2	6	1165475	1165480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981196
30022	NC_006461	CCG	2	6	1165518	1165523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55981196
30023	NC_006461	GAG	2	6	1165543	1165548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981196
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30025	NC_006461	TGCT	2	8	1165568	1165575	0 %	50 %	25 %	25 %	55981196
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30027	NC_006461	GGT	2	6	1165627	1165632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981196
30028	NC_006461	GGC	2	6	1165726	1165731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981196
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30032	NC_006461	CCCA	2	8	1166443	1166450	25 %	0 %	0 %	75 %	55981197
30033	NC_006461	CTT	2	6	1166535	1166540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55981197
30034	NC_006461	CCAC	2	8	1166642	1166649	25 %	0 %	0 %	75 %	55981197
30035	NC_006461	TCGGCA	2	12	1166672	1166683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55981197
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30042	NC_006461	CATGGA	2	12	1166877	1166888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55981197
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30052	NC_006461	GGA	2	6	1167168	1167173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981197
30053	NC_006461	GAG	3	9	1167181	1167189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981197
30054	NC_006461	GAG	2	6	1167202	1167207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981197
30055	NC_006461	GAA	2	6	1167345	1167350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55981197
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30057	NC_006461	GTGG	2	8	1167384	1167391	0 %	25 %	75 %	0 %	55981197
30058	NC_006461	GAG	3	9	1167403	1167411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981197
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30062	NC_006461	CGG	3	9	1167599	1167607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981197
30063	NC_006461	GGCG	2	8	1167651	1167658	0 %	0 %	75 %	25 %	55981197
30064	NC_006461	GAG	2	6	1167665	1167670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981197
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30067	NC_006461	ACG	2	6	1167813	1167818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981198
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30090	NC_006461	CCGAGG	2	12	1168721	1168732	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55981199
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30120	NC_006461	TGG	2	6	1169905	1169910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981201
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30474	NC_006461	GCA	2	6	1183752	1183757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55981218
30475	NC_006461	ACC	2	6	1183787	1183792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55981218
30476	NC_006461	AGG	2	6	1183811	1183816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981218
30477	NC_006461	CCT	2	6	1183824	1183829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981218
30478	NC_006461	CTC	2	6	1183842	1183847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981218
30479	NC_006461	CTC	2	6	1183858	1183863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981218
30480	NC_006461	GGA	2	6	1183875	1183880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981218
30481	NC_006461	GTG	2	6	1183888	1183893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55981218
30482	NC_006461	AGG	3	9	1183895	1183903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981218
30483	NC_006461	G	6	6	1183902	1183907	0 %	0 %	100 %	0 %	55981218
30484	NC_006461	CG	3	6	1183917	1183922	0 %	0 %	50 %	50 %	55981218
30485	NC_006461	GGA	2	6	1183956	1183961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981218
30486	NC_006461	GGA	2	6	1183968	1183973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981218
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30488	NC_006461	C	6	6	1184018	1184023	0 %	0 %	0 %	100 %	55981218
30489	NC_006461	GGC	2	6	1184048	1184053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55981218
30490	NC_006461	GCCCTG	2	12	1184101	1184112	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55981218
30491	NC_006461	CTC	2	6	1184122	1184127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55981218
30492	NC_006461	C	7	7	1184149	1184155	0 %	0 %	0 %	100 %	55981218
30493	NC_006461	GGA	3	9	1184199	1184207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981218
30494	NC_006461	GGA	2	6	1184247	1184252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55981218
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30498	NC_006461	C	7	7	1184435	1184441	0 %	0 %	0 %	100 %	55981218
30499	NC_006461	GCCC	2	8	1184442	1184449	0 %	0 %	25 %	75 %	55981218
30500	NC_006461	C	7	7	1184481	1184487	0 %	0 %	0 %	100 %	55981218

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