MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_006461	GCCAC	2	10	810436	810445	20 %	0 %	20 %	60 %	55980813
21002	NC_006461	GAG	2	6	810446	810451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980813
21003	NC_006461	GAA	2	6	810470	810475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980813
21004	NC_006461	CCT	2	6	810478	810483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980813
21005	NC_006461	GGC	3	9	810491	810499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980813
21006	NC_006461	GAGGGC	2	12	810500	810511	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980813
21007	NC_006461	GAG	2	6	810512	810517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980813
21008	NC_006461	GCCTCG	2	12	810573	810584	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980813
21009	NC_006461	AGG	2	6	810589	810594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980813
21010	NC_006461	GGC	2	6	810604	810609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980813
21011	NC_006461	GAG	3	9	810638	810646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980813
21012	NC_006461	CCCCG	2	10	810662	810671	0 %	0 %	20 %	80 %	55980813
21013	NC_006461	CCCGCC	2	12	810710	810721	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	55980813
21014	NC_006461	GAG	3	9	810725	810733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980813
21015	NC_006461	C	6	6	810734	810739	0 %	0 %	0 %	100 %	55980813
21016	NC_006461	GAG	2	6	810749	810754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980813
21017	NC_006461	GCC	2	6	810807	810812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980814
21018	NC_006461	AGG	2	6	810833	810838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980814
21019	NC_006461	TCCG	2	8	810842	810849	0 %	25 %	25 %	50 %	55980814
21020	NC_006461	CAC	2	6	810883	810888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980814
21021	NC_006461	GTC	2	6	810889	810894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980814
21022	NC_006461	CTC	2	6	810898	810903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980814
21023	NC_006461	CAT	2	6	811056	811061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980815
21024	NC_006461	AGGCG	2	10	811076	811085	20 %	0 %	60 %	20 %	55980815
21025	NC_006461	GAG	2	6	811104	811109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980815
21026	NC_006461	C	7	7	811124	811130	0 %	0 %	0 %	100 %	55980815
21027	NC_006461	CCT	2	6	811187	811192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980815
21028	NC_006461	G	6	6	811238	811243	0 %	0 %	100 %	0 %	55980815
21029	NC_006461	GGA	2	6	811313	811318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980815
21030	NC_006461	C	7	7	811376	811382	0 %	0 %	0 %	100 %	55980815
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21032	NC_006461	GAG	2	6	811446	811451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980815
21033	NC_006461	GCC	2	6	811474	811479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980815
21034	NC_006461	GCGGG	2	10	811489	811498	0 %	0 %	80 %	20 %	55980815
21035	NC_006461	GGC	2	6	811514	811519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980815
21036	NC_006461	GCG	2	6	811543	811548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980815
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21038	NC_006461	C	7	7	811601	811607	0 %	0 %	0 %	100 %	55980815
21039	NC_006461	CGTGGG	2	12	811619	811630	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980815
21040	NC_006461	GAG	2	6	811632	811637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980815
21041	NC_006461	GGC	2	6	811638	811643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980815
21042	NC_006461	GGGC	2	8	811657	811664	0 %	0 %	75 %	25 %	55980815
21043	NC_006461	G	6	6	811669	811674	0 %	0 %	100 %	0 %	55980815
21044	NC_006461	CCA	2	6	811682	811687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980815
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21049	NC_006461	GCG	2	6	811957	811962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980816
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21052	NC_006461	G	7	7	812001	812007	0 %	0 %	100 %	0 %	55980816
21053	NC_006461	CCA	3	9	812018	812026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980816
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21055	NC_006461	GCCACC	2	12	812146	812157	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55980816
21056	NC_006461	CCA	3	9	812162	812170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980816
21057	NC_006461	CGT	2	6	812174	812179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980816
21058	NC_006461	GGC	2	6	812208	812213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980816
21059	NC_006461	GGC	2	6	812219	812224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980816
21060	NC_006461	CCA	2	6	812235	812240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980816
21061	NC_006461	GAG	2	6	812259	812264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980816
21062	NC_006461	TCC	2	6	812270	812275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980816
21063	NC_006461	GGCG	2	8	812282	812289	0 %	0 %	75 %	25 %	55980816
21064	NC_006461	ACC	3	9	812350	812358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980816
21065	NC_006461	TCC	2	6	812362	812367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980816
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21088	NC_006461	GAG	4	12	813134	813145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980818
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21092	NC_006461	AGGGG	2	10	813232	813241	20 %	0 %	80 %	0 %	55980818
21093	NC_006461	CCTCAC	2	12	813253	813264	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980818
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21106	NC_006461	C	6	6	813956	813961	0 %	0 %	0 %	100 %	55980820
21107	NC_006461	TCC	2	6	813975	813980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980820
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21112	NC_006461	CTT	2	6	814174	814179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980820
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21115	NC_006461	GGCCC	2	10	814257	814266	0 %	0 %	40 %	60 %	55980820
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21123	NC_006461	AGG	2	6	814482	814487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980820
21124	NC_006461	CGGCG	2	10	814500	814509	0 %	0 %	60 %	40 %	55980820
21125	NC_006461	GAA	2	6	814570	814575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980820
21126	NC_006461	TCC	2	6	814578	814583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980820
21127	NC_006461	GCC	2	6	814670	814675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980820
21128	NC_006461	CTCCAG	2	12	814676	814687	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980820
21129	NC_006461	CGG	2	6	814698	814703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980820
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21132	NC_006461	GGA	3	9	814756	814764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980820
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21153	NC_006461	GGC	2	6	815676	815681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980821
21154	NC_006461	TGGG	2	8	815768	815775	0 %	25 %	75 %	0 %	55980822
21155	NC_006461	AGG	2	6	815789	815794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980822
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21162	NC_006461	AGG	2	6	815947	815952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980822
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21229	NC_006461	CCGC	2	8	818279	818286	0 %	0 %	25 %	75 %	55980825
21230	NC_006461	GATG	2	8	818396	818403	25 %	25 %	50 %	0 %	55980825
21231	NC_006461	TTG	2	6	818467	818472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980825
21232	NC_006461	C	6	6	818583	818588	0 %	0 %	0 %	100 %	55980825
21233	NC_006461	TCC	2	6	818617	818622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980825
21234	NC_006461	GAG	2	6	818634	818639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980825
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21238	NC_006461	CCG	2	6	818777	818782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980825
21239	NC_006461	GGC	2	6	818817	818822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980825
21240	NC_006461	CCT	2	6	818852	818857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980825
21241	NC_006461	TCC	2	6	818914	818919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980825
21242	NC_006461	GCC	2	6	818920	818925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980825
21243	NC_006461	CGG	2	6	818981	818986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980825
21244	NC_006461	CAC	2	6	818994	818999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980825
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21246	NC_006461	CTG	2	6	819033	819038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980825
21247	NC_006461	GAC	3	9	819063	819071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980825
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21249	NC_006461	AGG	2	6	819123	819128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980826
21250	NC_006461	GGA	2	6	819163	819168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980826
21251	NC_006461	GAG	3	9	819245	819253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980826
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21255	NC_006461	CCA	2	6	819454	819459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980826
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21264	NC_006461	GAG	4	12	819839	819850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980826
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21267	NC_006461	TCG	2	6	819999	820004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980827
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21271	NC_006461	CGG	2	6	820098	820103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980827
21272	NC_006461	CTC	2	6	820127	820132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980827
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21282	NC_006461	AGGT	2	8	820665	820672	25 %	25 %	50 %	0 %	55980828
21283	NC_006461	GTC	2	6	820712	820717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980828
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21293	NC_006461	GCCC	2	8	821060	821067	0 %	0 %	25 %	75 %	55980828
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21495	NC_006461	ACC	2	6	831204	831209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980841
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