MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_006461	CGG	2	6	659193	659198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980665
17003	NC_006461	GGC	2	6	659206	659211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980665
17004	NC_006461	ACC	2	6	659233	659238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980665
17005	NC_006461	CGG	2	6	659310	659315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980665
17006	NC_006461	CTC	3	9	659328	659336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980665
17007	NC_006461	CTC	2	6	659340	659345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980665
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17010	NC_006461	GGT	2	6	659426	659431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980665
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17012	NC_006461	TCC	2	6	659549	659554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980665
17013	NC_006461	ACC	2	6	659578	659583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980665
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17015	NC_006461	GGA	2	6	659615	659620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980665
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17017	NC_006461	CCT	2	6	659633	659638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980665
17018	NC_006461	GGC	2	6	659696	659701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980665
17019	NC_006461	GCC	2	6	659707	659712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980665
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17021	NC_006461	GGCGGA	2	12	659759	659770	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980665
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17123	NC_006461	CGC	2	6	663452	663457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980668
17124	NC_006461	CTC	2	6	663462	663467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
17125	NC_006461	TTG	2	6	663535	663540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980668
17126	NC_006461	CCT	2	6	663587	663592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
17127	NC_006461	ATG	2	6	663604	663609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980668
17128	NC_006461	CGT	2	6	663611	663616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980668
17129	NC_006461	CGG	2	6	663617	663622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980668
17130	NC_006461	CGATGA	2	12	663623	663634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	55980668
17131	NC_006461	TGG	2	6	663671	663676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980668
17132	NC_006461	C	6	6	663762	663767	0 %	0 %	0 %	100 %	55980668
17133	NC_006461	CCT	2	6	663770	663775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
17134	NC_006461	AGG	2	6	663808	663813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980668
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17138	NC_006461	G	7	7	663855	663861	0 %	0 %	100 %	0 %	55980668
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17142	NC_006461	TCC	2	6	663958	663963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980668
17143	NC_006461	CCT	2	6	664082	664087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980669
17144	NC_006461	C	6	6	664191	664196	0 %	0 %	0 %	100 %	55980669
17145	NC_006461	CTC	2	6	664234	664239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980669
17146	NC_006461	GCC	2	6	664272	664277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980669
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17148	NC_006461	CTC	2	6	664347	664352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
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17150	NC_006461	CCT	3	9	664379	664387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
17151	NC_006461	CGG	2	6	664388	664393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980670
17152	NC_006461	CGC	2	6	664396	664401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980670
17153	NC_006461	CCT	2	6	664430	664435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980670
17154	NC_006461	C	6	6	664485	664490	0 %	0 %	0 %	100 %	55980670
17155	NC_006461	CTT	2	6	664539	664544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980670
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17158	NC_006461	CGG	2	6	664753	664758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980670
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17198	NC_006461	TGG	3	9	666955	666963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980672
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17212	NC_006461	G	6	6	667365	667370	0 %	0 %	100 %	0 %	55980672
17213	NC_006461	CGC	2	6	667436	667441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980672
17214	NC_006461	G	9	9	667512	667520	0 %	0 %	100 %	0 %	55980672
17215	NC_006461	GCGG	2	8	667559	667566	0 %	0 %	75 %	25 %	55980672
17216	NC_006461	GTGG	2	8	667571	667578	0 %	25 %	75 %	0 %	55980672
17217	NC_006461	GGA	2	6	667811	667816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980673
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17219	NC_006461	GAG	2	6	667927	667932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980673
17220	NC_006461	GCGGTG	2	12	667939	667950	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980673
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17222	NC_006461	ATC	2	6	668020	668025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980673
17223	NC_006461	GGC	2	6	668037	668042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980673
17224	NC_006461	CGA	2	6	668154	668159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980673
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17233	NC_006461	CGC	2	6	668484	668489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980673
17234	NC_006461	ATG	2	6	668494	668499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980673
17235	NC_006461	CGGGCC	2	12	668563	668574	0 %	0 %	50 %	50 %	55980673
17236	NC_006461	TGG	2	6	668648	668653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980673
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17239	NC_006461	GAG	2	6	668774	668779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980674
17240	NC_006461	AGG	2	6	668790	668795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980674
17241	NC_006461	CTC	3	9	668801	668809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980674
17242	NC_006461	CTC	2	6	668843	668848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980674
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17490	NC_006461	CGGC	2	8	678616	678623	0 %	0 %	50 %	50 %	55980683
17491	NC_006461	CGGG	2	8	678640	678647	0 %	0 %	75 %	25 %	55980683
17492	NC_006461	TCGG	2	8	678669	678676	0 %	25 %	50 %	25 %	55980683
17493	NC_006461	G	6	6	678675	678680	0 %	0 %	100 %	0 %	55980683
17494	NC_006461	GGGCC	2	10	678703	678712	0 %	0 %	60 %	40 %	55980683
17495	NC_006461	CTC	2	6	678788	678793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980683
17496	NC_006461	ACC	2	6	678834	678839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980683
17497	NC_006461	GCCTG	2	10	678868	678877	0 %	20 %	40 %	40 %	55980683
17498	NC_006461	GAG	3	9	678890	678898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980683
17499	NC_006461	AGGCC	2	10	678934	678943	20 %	0 %	40 %	40 %	55980683
17500	NC_006461	G	6	6	678993	678998	0 %	0 %	100 %	0 %	55980684

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