MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_006461	GCG	2	6	545584	545589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980546
14002	NC_006461	CCG	2	6	545603	545608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980546
14003	NC_006461	GAG	2	6	545628	545633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
14004	NC_006461	ACGGGG	2	12	545722	545733	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980546
14005	NC_006461	CCT	2	6	545807	545812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980546
14006	NC_006461	GGC	2	6	545840	545845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980546
14007	NC_006461	TGGCCT	2	12	545888	545899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980546
14008	NC_006461	TTC	2	6	545907	545912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980546
14009	NC_006461	AGG	2	6	546004	546009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
14010	NC_006461	GAG	2	6	546012	546017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
14011	NC_006461	AGG	2	6	546097	546102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
14012	NC_006461	GCC	2	6	546184	546189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980546
14013	NC_006461	CCT	2	6	546215	546220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980546
14014	NC_006461	GCGAGG	2	12	546286	546297	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980546
14015	NC_006461	AGGG	2	8	546298	546305	25 %	0 %	75 %	0 %	55980546
14016	NC_006461	GAG	2	6	546306	546311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
14017	NC_006461	CGAGGA	2	12	546314	546325	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	55980546
14018	NC_006461	GGA	2	6	546332	546337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
14019	NC_006461	GGCG	2	8	546367	546374	0 %	0 %	75 %	25 %	55980547
14020	NC_006461	GCC	2	6	546416	546421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980547
14021	NC_006461	TGG	2	6	546451	546456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980547
14022	NC_006461	CCA	2	6	546505	546510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980547
14023	NC_006461	TCG	2	6	546570	546575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980547
14024	NC_006461	CAC	2	6	546656	546661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980547
14025	NC_006461	GGGC	2	8	546664	546671	0 %	0 %	75 %	25 %	55980547
14026	NC_006461	TTC	2	6	546682	546687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980547
14027	NC_006461	GGA	2	6	546745	546750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980547
14028	NC_006461	GGT	2	6	546796	546801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980547
14029	NC_006461	CTC	2	6	546821	546826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980547
14030	NC_006461	GTA	2	6	546851	546856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980547
14031	NC_006461	GAG	2	6	546869	546874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980547
14032	NC_006461	GGT	2	6	546917	546922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980547
14033	NC_006461	GC	3	6	546970	546975	0 %	0 %	50 %	50 %	55980547
14034	NC_006461	GCC	2	6	547046	547051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980548
14035	NC_006461	GAG	2	6	547120	547125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980548
14036	NC_006461	GAG	2	6	547177	547182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980548
14037	NC_006461	TCTCCG	2	12	547206	547217	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55980548
14038	NC_006461	CCA	2	6	547230	547235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980548
14039	NC_006461	GGA	2	6	547251	547256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980548
14040	NC_006461	TCC	2	6	547262	547267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980548
14041	NC_006461	TCG	2	6	547275	547280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980548
14042	NC_006461	CCT	2	6	547326	547331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980548
14043	NC_006461	CTG	2	6	547522	547527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980548
14044	NC_006461	TGG	2	6	547602	547607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980548
14045	NC_006461	GCCC	2	8	547724	547731	0 %	0 %	25 %	75 %	55980548
14046	NC_006461	GCCC	2	8	547752	547759	0 %	0 %	25 %	75 %	55980548
14047	NC_006461	GAG	2	6	547783	547788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980548
14048	NC_006461	GCGG	2	8	547807	547814	0 %	0 %	75 %	25 %	55980548
14049	NC_006461	CCT	2	6	547815	547820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980548
14050	NC_006461	CCG	2	6	547825	547830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980548
14051	NC_006461	G	7	7	547948	547954	0 %	0 %	100 %	0 %	55980548
14052	NC_006461	CGT	2	6	547956	547961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980548
14053	NC_006461	TCC	2	6	548003	548008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980548
14054	NC_006461	GTG	2	6	548030	548035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980548
14055	NC_006461	TCC	2	6	548081	548086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980548
14056	NC_006461	CCA	2	6	548112	548117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980548
14057	NC_006461	CTC	2	6	549140	549145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980551
14058	NC_006461	GGCCC	2	10	549190	549199	0 %	0 %	40 %	60 %	55980551
14059	NC_006461	CCA	2	6	549205	549210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980551
14060	NC_006461	GCC	2	6	549221	549226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980551
14061	NC_006461	GAGG	2	8	549259	549266	25 %	0 %	75 %	0 %	55980551
14062	NC_006461	GAA	2	6	549334	549339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980551
14063	NC_006461	C	6	6	549462	549467	0 %	0 %	0 %	100 %	55980551
14064	NC_006461	AGG	2	6	549486	549491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980551
14065	NC_006461	GCT	2	6	549502	549507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980551
14066	NC_006461	GAA	2	6	549577	549582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980551
14067	NC_006461	CCT	2	6	549619	549624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980551
14068	NC_006461	CGC	2	6	549661	549666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980551
14069	NC_006461	C	6	6	549697	549702	0 %	0 %	0 %	100 %	55980551
14070	NC_006461	CTA	2	6	549760	549765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980551
14071	NC_006461	AGG	2	6	549798	549803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980551
14072	NC_006461	TGGCGG	2	12	549840	549851	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980551
14073	NC_006461	GAG	2	6	549860	549865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980551
14074	NC_006461	GGA	2	6	549880	549885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980551
14075	NC_006461	CTC	2	6	549917	549922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980551
14076	NC_006461	GAG	2	6	549935	549940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980551
14077	NC_006461	G	6	6	549940	549945	0 %	0 %	100 %	0 %	55980551
14078	NC_006461	GCC	2	6	549983	549988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980551
14079	NC_006461	AGG	2	6	550026	550031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980551
14080	NC_006461	G	6	6	550044	550049	0 %	0 %	100 %	0 %	55980551
14081	NC_006461	G	6	6	550061	550066	0 %	0 %	100 %	0 %	55980551
14082	NC_006461	GAA	2	6	550166	550171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980551
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14085	NC_006461	TCC	2	6	550195	550200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980552
14086	NC_006461	GGC	2	6	550248	550253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980552
14087	NC_006461	GAG	2	6	550254	550259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980552
14088	NC_006461	C	6	6	550350	550355	0 %	0 %	0 %	100 %	55980552
14089	NC_006461	TGGGCC	2	12	550357	550368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980552
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14091	NC_006461	GCC	2	6	550411	550416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980552
14092	NC_006461	C	8	8	550427	550434	0 %	0 %	0 %	100 %	55980552
14093	NC_006461	TGGGG	2	10	550439	550448	0 %	20 %	80 %	0 %	55980552
14094	NC_006461	CCT	2	6	550460	550465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980552
14095	NC_006461	CCA	3	9	550496	550504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980552
14096	NC_006461	C	6	6	550547	550552	0 %	0 %	0 %	100 %	55980552
14097	NC_006461	AGG	2	6	550558	550563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980552
14098	NC_006461	GAG	2	6	550569	550574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980552
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14100	NC_006461	TGG	2	6	550643	550648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980552
14101	NC_006461	GAA	2	6	550694	550699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980552
14102	NC_006461	CG	3	6	550722	550727	0 %	0 %	50 %	50 %	55980552
14103	NC_006461	CTT	2	6	550902	550907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980553
14104	NC_006461	CGC	2	6	550914	550919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980553
14105	NC_006461	GAC	2	6	550942	550947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980553
14106	NC_006461	GC	3	6	550991	550996	0 %	0 %	50 %	50 %	55980553
14107	NC_006461	G	6	6	551006	551011	0 %	0 %	100 %	0 %	55980553
14108	NC_006461	GAG	2	6	551038	551043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980553
14109	NC_006461	G	6	6	551083	551088	0 %	0 %	100 %	0 %	55980553
14110	NC_006461	TCC	3	9	551156	551164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980553
14111	NC_006461	AGG	2	6	551168	551173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980553
14112	NC_006461	GAG	2	6	551179	551184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980553
14113	NC_006461	CGG	2	6	551213	551218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980553
14114	NC_006461	AGG	2	6	551222	551227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980553
14115	NC_006461	GGA	2	6	551298	551303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980553
14116	NC_006461	TCC	2	6	551315	551320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980553
14117	NC_006461	CAGG	2	8	551328	551335	25 %	0 %	50 %	25 %	55980553
14118	NC_006461	CTC	2	6	551347	551352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980553
14119	NC_006461	CTC	2	6	551404	551409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980553
14120	NC_006461	TAG	2	6	551443	551448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980553
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14122	NC_006461	CCA	2	6	551495	551500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980554
14123	NC_006461	AGG	2	6	551527	551532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980554
14124	NC_006461	GGC	2	6	551562	551567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980554
14125	NC_006461	GCG	2	6	551575	551580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980554
14126	NC_006461	GAG	2	6	551628	551633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980554
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14130	NC_006461	GAG	2	6	551808	551813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980554
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14233	NC_006461	C	8	8	555458	555465	0 %	0 %	0 %	100 %	55980557
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14237	NC_006461	G	6	6	555553	555558	0 %	0 %	100 %	0 %	55980557
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14239	NC_006461	GGTG	2	8	555668	555675	0 %	25 %	75 %	0 %	55980557
14240	NC_006461	GAG	2	6	555732	555737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980557
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14243	NC_006461	C	6	6	555848	555853	0 %	0 %	0 %	100 %	55980557
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14361	NC_006461	GCA	2	6	560328	560333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980563
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14373	NC_006461	G	6	6	560585	560590	0 %	0 %	100 %	0 %	55980563
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