MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_006461	CGGGA	2	10	527569	527578	20 %	0 %	60 %	20 %	55980535
13503	NC_006461	TGG	2	6	527597	527602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980535
13504	NC_006461	CGGAGG	2	12	527624	527635	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55980535
13505	NC_006461	G	6	6	527673	527678	0 %	0 %	100 %	0 %	55980535
13506	NC_006461	TGG	2	6	527732	527737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980535
13507	NC_006461	GGA	2	6	527751	527756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980535
13508	NC_006461	GGACC	2	10	527865	527874	20 %	0 %	40 %	40 %	55980535
13509	NC_006461	AGGCCC	2	12	527918	527929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980535
13510	NC_006461	CCT	2	6	527955	527960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980535
13511	NC_006461	GGGGAA	2	12	527973	527984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980535
13512	NC_006461	GCC	2	6	527993	527998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980535
13513	NC_006461	GCC	2	6	528056	528061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980535
13514	NC_006461	CCG	2	6	528111	528116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980535
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13517	NC_006461	TGG	2	6	528158	528163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980535
13518	NC_006461	GGT	2	6	528165	528170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980535
13519	NC_006461	ACC	2	6	528193	528198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980535
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13521	NC_006461	GAG	2	6	528226	528231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980535
13522	NC_006461	GGA	2	6	528234	528239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980535
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13524	NC_006461	CTC	2	6	528349	528354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980535
13525	NC_006461	GGA	2	6	528375	528380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980535
13526	NC_006461	GAGG	2	8	528384	528391	25 %	0 %	75 %	0 %	55980535
13527	NC_006461	GGA	2	6	528423	528428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980535
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13533	NC_006461	CTG	2	6	528631	528636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980535
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13536	NC_006461	C	6	6	528701	528706	0 %	0 %	0 %	100 %	55980536
13537	NC_006461	CTTG	2	8	528746	528753	0 %	50 %	25 %	25 %	55980536
13538	NC_006461	GGT	2	6	528755	528760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980536
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13544	NC_006461	CCCTT	2	10	528899	528908	0 %	40 %	0 %	60 %	55980536
13545	NC_006461	GGTGGG	2	12	528996	529007	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	55980537
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13593	NC_006461	GC	3	6	530662	530667	0 %	0 %	50 %	50 %	55980537
13594	NC_006461	GGCCCG	2	12	530674	530685	0 %	0 %	50 %	50 %	55980537
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13602	NC_006461	G	6	6	530950	530955	0 %	0 %	100 %	0 %	55980537
13603	NC_006461	GGAGGG	2	12	530986	530997	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	55980537
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13605	NC_006461	C	6	6	531037	531042	0 %	0 %	0 %	100 %	55980537
13606	NC_006461	CCTT	2	8	531144	531151	0 %	50 %	0 %	50 %	55980537
13607	NC_006461	G	6	6	531174	531179	0 %	0 %	100 %	0 %	55980537
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13612	NC_006461	CGGG	2	8	531383	531390	0 %	0 %	75 %	25 %	55980537
13613	NC_006461	CT	3	6	531404	531409	0 %	50 %	0 %	50 %	55980537
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13872	NC_006461	CT	3	6	541527	541532	0 %	50 %	0 %	50 %	55980542
13873	NC_006461	CTA	2	6	541538	541543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980542
13874	NC_006461	CTA	2	6	541550	541555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980542
13875	NC_006461	CCG	3	9	541574	541582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980542
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13880	NC_006461	GGA	2	6	541697	541702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980542
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13884	NC_006461	CTT	2	6	541821	541826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980542
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13989	NC_006461	GAG	2	6	545121	545126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
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13992	NC_006461	GCAA	2	8	545293	545300	50 %	0 %	25 %	25 %	55980546
13993	NC_006461	AGG	4	12	545338	545349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
13994	NC_006461	CCA	2	6	545354	545359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980546
13995	NC_006461	AAGCCC	2	12	545391	545402	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	55980546
13996	NC_006461	GGC	2	6	545421	545426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980546
13997	NC_006461	CTC	2	6	545496	545501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980546
13998	NC_006461	AGG	2	6	545515	545520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980546
13999	NC_006461	GGGGTA	2	12	545535	545546	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980546
14000	NC_006461	TGG	2	6	545566	545571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980546

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