MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_006461	GGA	2	6	508094	508099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980512
13002	NC_006461	GTG	2	6	508109	508114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980512
13003	NC_006461	GGA	2	6	508166	508171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980512
13004	NC_006461	AGG	2	6	508291	508296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980512
13005	NC_006461	CCG	2	6	508405	508410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980512
13006	NC_006461	G	6	6	508420	508425	0 %	0 %	100 %	0 %	55980512
13007	NC_006461	CTC	2	6	508434	508439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980512
13008	NC_006461	GAG	2	6	508458	508463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980512
13009	NC_006461	CTCAAG	2	12	508491	508502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	55980512
13010	NC_006461	GAA	2	6	508544	508549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980512
13011	NC_006461	CTC	2	6	508593	508598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980512
13012	NC_006461	CCG	2	6	508655	508660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980512
13013	NC_006461	ACG	2	6	508663	508668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980512
13014	NC_006461	CAC	2	6	508730	508735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980512
13015	NC_006461	CGGGAC	2	12	508761	508772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980512
13016	NC_006461	CTTC	2	8	508814	508821	0 %	50 %	0 %	50 %	55980512
13017	NC_006461	GGT	2	6	508834	508839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980512
13018	NC_006461	A	6	6	509027	509032	100 %	0 %	0 %	0 %	55980513
13019	NC_006461	AGG	2	6	509062	509067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980513
13020	NC_006461	GCGGGC	2	12	509117	509128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980513
13021	NC_006461	TGG	2	6	509200	509205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980513
13022	NC_006461	GGA	3	9	509243	509251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980513
13023	NC_006461	GTG	2	6	509267	509272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980514
13024	NC_006461	CCG	2	6	509367	509372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980514
13025	NC_006461	GAG	2	6	509396	509401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980514
13026	NC_006461	G	8	8	509462	509469	0 %	0 %	100 %	0 %	55980514
13027	NC_006461	TGG	3	9	509514	509522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980514
13028	NC_006461	TGG	2	6	509562	509567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980514
13029	NC_006461	ATC	2	6	509609	509614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980514
13030	NC_006461	CAC	2	6	509629	509634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980514
13031	NC_006461	GGC	2	6	509710	509715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980514
13032	NC_006461	CCGGGG	2	12	509718	509729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980514
13033	NC_006461	GGA	2	6	509740	509745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980514
13034	NC_006461	TCC	2	6	509769	509774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980514
13035	NC_006461	GAG	2	6	509870	509875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980514
13036	NC_006461	GGT	2	6	509881	509886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980514
13037	NC_006461	GAC	2	6	509912	509917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980514
13038	NC_006461	CGG	2	6	509937	509942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980514
13039	NC_006461	GCCC	2	8	509993	510000	0 %	0 %	25 %	75 %	55980514
13040	NC_006461	GGC	2	6	510013	510018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980514
13041	NC_006461	AGG	2	6	510033	510038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980514
13042	NC_006461	GGT	2	6	510052	510057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980514
13043	NC_006461	GGA	2	6	510126	510131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980514
13044	NC_006461	CTT	2	6	510166	510171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980514
13045	NC_006461	GTG	2	6	510173	510178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980514
13046	NC_006461	GCC	2	6	510200	510205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980514
13047	NC_006461	GAG	2	6	510227	510232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980514
13048	NC_006461	CCT	2	6	510275	510280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980515
13049	NC_006461	CGC	2	6	510364	510369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980515
13050	NC_006461	CCT	2	6	510374	510379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980515
13051	NC_006461	CAC	2	6	510384	510389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980515
13052	NC_006461	ACCAGG	2	12	510430	510441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980515
13053	NC_006461	GAG	2	6	510459	510464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980515
13054	NC_006461	GAG	3	9	510480	510488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980515
13055	NC_006461	GGA	2	6	510492	510497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980515
13056	NC_006461	CAC	2	6	510516	510521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980515
13057	NC_006461	TCC	2	6	510565	510570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980515
13058	NC_006461	CCA	2	6	510575	510580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980515
13059	NC_006461	C	6	6	510650	510655	0 %	0 %	0 %	100 %	55980515
13060	NC_006461	C	6	6	510678	510683	0 %	0 %	0 %	100 %	55980515
13061	NC_006461	GAG	2	6	510750	510755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980515
13062	NC_006461	C	6	6	510764	510769	0 %	0 %	0 %	100 %	55980515
13063	NC_006461	CTC	2	6	510783	510788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980515
13064	NC_006461	GGGC	2	8	510827	510834	0 %	0 %	75 %	25 %	55980515
13065	NC_006461	CAC	2	6	510840	510845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980515
13066	NC_006461	CCT	2	6	510869	510874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980515
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13069	NC_006461	GGAG	2	8	510997	511004	25 %	0 %	75 %	0 %	55980516
13070	NC_006461	TGG	3	9	511020	511028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980516
13071	NC_006461	CAC	2	6	511094	511099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980516
13072	NC_006461	AGG	2	6	511146	511151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980516
13073	NC_006461	TGG	2	6	511194	511199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980516
13074	NC_006461	AGG	2	6	511254	511259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980516
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13076	NC_006461	GGC	2	6	511280	511285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980517
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13079	NC_006461	CGGG	2	8	511397	511404	0 %	0 %	75 %	25 %	55980517
13080	NC_006461	G	7	7	511410	511416	0 %	0 %	100 %	0 %	55980517
13081	NC_006461	G	6	6	511433	511438	0 %	0 %	100 %	0 %	55980517
13082	NC_006461	CCT	3	9	511448	511456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980517
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13085	NC_006461	G	6	6	511558	511563	0 %	0 %	100 %	0 %	55980517
13086	NC_006461	TGCCCC	2	12	511585	511596	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980517
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13088	NC_006461	GGCCT	2	10	511662	511671	0 %	20 %	40 %	40 %	55980517
13089	NC_006461	TCA	2	6	511823	511828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980518
13090	NC_006461	CAC	2	6	511944	511949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980518
13091	NC_006461	C	8	8	511982	511989	0 %	0 %	0 %	100 %	55980518
13092	NC_006461	TCC	2	6	511990	511995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
13093	NC_006461	GGCG	2	8	512051	512058	0 %	0 %	75 %	25 %	55980518
13094	NC_006461	GAG	2	6	512139	512144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980518
13095	NC_006461	C	6	6	512155	512160	0 %	0 %	0 %	100 %	55980518
13096	NC_006461	CCA	2	6	512165	512170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980518
13097	NC_006461	G	6	6	512245	512250	0 %	0 %	100 %	0 %	55980518
13098	NC_006461	GAAGG	2	10	512292	512301	40 %	0 %	60 %	0 %	55980518
13099	NC_006461	CCT	2	6	512312	512317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
13100	NC_006461	CTC	2	6	512355	512360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
13101	NC_006461	ACC	2	6	512380	512385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980518
13102	NC_006461	CCA	2	6	512396	512401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980518
13103	NC_006461	GTC	2	6	512433	512438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980518
13104	NC_006461	CAC	2	6	512442	512447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980518
13105	NC_006461	CTC	2	6	512448	512453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
13106	NC_006461	C	6	6	512534	512539	0 %	0 %	0 %	100 %	55980518
13107	NC_006461	GTC	2	6	512574	512579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980518
13108	NC_006461	C	6	6	512595	512600	0 %	0 %	0 %	100 %	55980518
13109	NC_006461	CCA	2	6	512603	512608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980518
13110	NC_006461	TGA	2	6	512612	512617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980518
13111	NC_006461	TGG	2	6	512671	512676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980518
13112	NC_006461	GTT	2	6	512745	512750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980518
13113	NC_006461	TCC	2	6	512797	512802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
13114	NC_006461	G	6	6	512861	512866	0 %	0 %	100 %	0 %	55980518
13115	NC_006461	C	6	6	512963	512968	0 %	0 %	0 %	100 %	55980518
13116	NC_006461	TCC	2	6	512998	513003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
13117	NC_006461	CGCTC	2	10	513005	513014	0 %	20 %	20 %	60 %	55980518
13118	NC_006461	GGCTT	2	10	513023	513032	0 %	40 %	40 %	20 %	55980518
13119	NC_006461	GCTC	2	8	513047	513054	0 %	25 %	25 %	50 %	55980518
13120	NC_006461	TCC	3	9	513058	513066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
13121	NC_006461	GTC	2	6	513072	513077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980518
13122	NC_006461	CCT	2	6	513092	513097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
13123	NC_006461	AGT	2	6	513134	513139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980518
13124	NC_006461	CAGC	2	8	513174	513181	25 %	0 %	25 %	50 %	55980518
13125	NC_006461	TCC	2	6	513187	513192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980518
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13148	NC_006461	CCG	2	6	513891	513896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980519
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13240	NC_006461	G	7	7	517433	517439	0 %	0 %	100 %	0 %	55980524
13241	NC_006461	GCCT	2	8	517508	517515	0 %	25 %	25 %	50 %	55980524
13242	NC_006461	GGC	2	6	517534	517539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980524
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13368	NC_006461	CCGGG	2	10	521936	521945	0 %	0 %	60 %	40 %	55980529
13369	NC_006461	AGGG	2	8	522093	522100	25 %	0 %	75 %	0 %	55980530
13370	NC_006461	GAG	2	6	522101	522106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980530
13371	NC_006461	GTCCAG	2	12	522119	522130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55980530
13372	NC_006461	C	7	7	522160	522166	0 %	0 %	0 %	100 %	55980530
13373	NC_006461	G	6	6	522226	522231	0 %	0 %	100 %	0 %	55980530
13374	NC_006461	GAG	3	9	522311	522319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980530
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13381	NC_006461	GAGGCC	2	12	522500	522511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980530
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13386	NC_006461	G	6	6	522660	522665	0 %	0 %	100 %	0 %	55980530
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13488	NC_006461	GAG	2	6	527254	527259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980535
13489	NC_006461	GGC	2	6	527273	527278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980535
13490	NC_006461	CCT	2	6	527292	527297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980535
13491	NC_006461	CACC	2	8	527301	527308	25 %	0 %	0 %	75 %	55980535
13492	NC_006461	G	6	6	527317	527322	0 %	0 %	100 %	0 %	55980535
13493	NC_006461	GGC	2	6	527357	527362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980535
13494	NC_006461	GCC	2	6	527374	527379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980535
13495	NC_006461	TGGAGG	2	12	527381	527392	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980535
13496	NC_006461	CGC	2	6	527432	527437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980535
13497	NC_006461	GGA	3	9	527448	527456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980535
13498	NC_006461	GCC	2	6	527469	527474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980535
13499	NC_006461	CCA	2	6	527484	527489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980535
13500	NC_006461	ACCTGG	2	12	527492	527503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	55980535

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