MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_006461	CGG	2	6	490153	490158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980495
12502	NC_006461	TGGTCC	2	12	490160	490171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980495
12503	NC_006461	CCGCCA	2	12	490196	490207	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	55980495
12504	NC_006461	GCC	2	6	490300	490305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980495
12505	NC_006461	AGG	2	6	490376	490381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980495
12506	NC_006461	CTA	2	6	490395	490400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980495
12507	NC_006461	CAT	2	6	490422	490427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980495
12508	NC_006461	CGG	2	6	490503	490508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980495
12509	NC_006461	GGGC	2	8	490509	490516	0 %	0 %	75 %	25 %	55980495
12510	NC_006461	TGG	2	6	490574	490579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980495
12511	NC_006461	GAG	2	6	490588	490593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980495
12512	NC_006461	GGGCCT	2	12	490673	490684	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	55980495
12513	NC_006461	AAG	2	6	490714	490719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980495
12514	NC_006461	CTC	2	6	490762	490767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980495
12515	NC_006461	ACG	2	6	490793	490798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980495
12516	NC_006461	C	6	6	490828	490833	0 %	0 %	0 %	100 %	55980495
12517	NC_006461	C	7	7	490887	490893	0 %	0 %	0 %	100 %	55980495
12518	NC_006461	AGG	2	6	490919	490924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980495
12519	NC_006461	TGG	2	6	490931	490936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980495
12520	NC_006461	AAG	2	6	491002	491007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980495
12521	NC_006461	CCG	2	6	491049	491054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980495
12522	NC_006461	CAA	2	6	491073	491078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55980495
12523	NC_006461	GAGG	2	8	491224	491231	25 %	0 %	75 %	0 %	55980496
12524	NC_006461	TCC	2	6	491243	491248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980496
12525	NC_006461	CCT	2	6	491277	491282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980496
12526	NC_006461	TCC	2	6	491333	491338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980496
12527	NC_006461	C	8	8	491337	491344	0 %	0 %	0 %	100 %	55980496
12528	NC_006461	G	6	6	491422	491427	0 %	0 %	100 %	0 %	55980496
12529	NC_006461	AGCCG	2	10	491469	491478	20 %	0 %	40 %	40 %	55980496
12530	NC_006461	CCA	3	9	491499	491507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980496
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12532	NC_006461	CCT	2	6	491547	491552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980496
12533	NC_006461	C	7	7	491604	491610	0 %	0 %	0 %	100 %	55980496
12534	NC_006461	GAC	2	6	491626	491631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980496
12535	NC_006461	C	6	6	491666	491671	0 %	0 %	0 %	100 %	55980496
12536	NC_006461	TCC	2	6	491696	491701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980496
12537	NC_006461	TCC	2	6	491738	491743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980496
12538	NC_006461	AAG	2	6	491744	491749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980496
12539	NC_006461	G	6	6	491755	491760	0 %	0 %	100 %	0 %	55980496
12540	NC_006461	TCT	2	6	491761	491766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980496
12541	NC_006461	CTC	2	6	491773	491778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980496
12542	NC_006461	CCTC	2	8	491814	491821	0 %	25 %	0 %	75 %	55980496
12543	NC_006461	C	6	6	491862	491867	0 %	0 %	0 %	100 %	55980496
12544	NC_006461	TGG	2	6	491880	491885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980496
12545	NC_006461	G	7	7	491884	491890	0 %	0 %	100 %	0 %	55980496
12546	NC_006461	GAG	2	6	491905	491910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980496
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12550	NC_006461	GTA	2	6	492047	492052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980497
12551	NC_006461	C	6	6	492091	492096	0 %	0 %	0 %	100 %	55980497
12552	NC_006461	CT	3	6	492105	492110	0 %	50 %	0 %	50 %	55980497
12553	NC_006461	CCT	2	6	492115	492120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980497
12554	NC_006461	ACC	2	6	492135	492140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980497
12555	NC_006461	CCTCGT	2	12	492148	492159	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55980497
12556	NC_006461	CCT	2	6	492175	492180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980497
12557	NC_006461	TCT	2	6	492208	492213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980497
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12559	NC_006461	CTCC	2	8	492290	492297	0 %	25 %	0 %	75 %	55980497
12560	NC_006461	CGC	2	6	492299	492304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980497
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12563	NC_006461	G	6	6	492352	492357	0 %	0 %	100 %	0 %	55980497
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12579	NC_006461	CTT	2	6	493109	493114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980499
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12582	NC_006461	GCCCC	2	10	493191	493200	0 %	0 %	20 %	80 %	55980499
12583	NC_006461	CCCTGG	2	12	493240	493251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980499
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12593	NC_006461	AGG	2	6	493509	493514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980500
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12605	NC_006461	GAG	2	6	493759	493764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980500
12606	NC_006461	GC	3	6	493786	493791	0 %	0 %	50 %	50 %	55980500
12607	NC_006461	GAG	2	6	493825	493830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980500
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12623	NC_006461	CTC	2	6	494479	494484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980501
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12990	NC_006461	ACC	2	6	507622	507627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980512
12991	NC_006461	AGC	2	6	507637	507642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980512
12992	NC_006461	GGA	2	6	507644	507649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980512
12993	NC_006461	TGGAGG	2	12	507676	507687	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980512
12994	NC_006461	GAT	2	6	507716	507721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980512
12995	NC_006461	G	7	7	507741	507747	0 %	0 %	100 %	0 %	55980512
12996	NC_006461	CGG	2	6	507754	507759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980512
12997	NC_006461	CCCCG	2	10	507802	507811	0 %	0 %	20 %	80 %	55980512
12998	NC_006461	ATG	2	6	507822	507827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980512
12999	NC_006461	GGA	2	6	507851	507856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980512
13000	NC_006461	GGA	2	6	508064	508069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980512

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