MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_006461	TGG	2	6	451350	451355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980450
11503	NC_006461	CTA	2	6	451390	451395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980450
11504	NC_006461	CGC	2	6	451396	451401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980450
11505	NC_006461	GGC	2	6	451455	451460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980450
11506	NC_006461	CCT	2	6	451498	451503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980450
11507	NC_006461	CGCCT	2	10	451553	451562	0 %	20 %	20 %	60 %	55980450
11508	NC_006461	CTC	2	6	451601	451606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980450
11509	NC_006461	TAC	2	6	451634	451639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980450
11510	NC_006461	C	6	6	451672	451677	0 %	0 %	0 %	100 %	55980450
11511	NC_006461	G	6	6	451793	451798	0 %	0 %	100 %	0 %	55980450
11512	NC_006461	GCC	2	6	451856	451861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980450
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11514	NC_006461	GAGG	2	8	451963	451970	25 %	0 %	75 %	0 %	55980450
11515	NC_006461	G	6	6	451989	451994	0 %	0 %	100 %	0 %	55980450
11516	NC_006461	G	6	6	452054	452059	0 %	0 %	100 %	0 %	55980450
11517	NC_006461	GGT	2	6	452062	452067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980450
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11519	NC_006461	GGA	2	6	452089	452094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980450
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11521	NC_006461	CGA	2	6	452125	452130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980450
11522	NC_006461	GAG	3	9	452235	452243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980451
11523	NC_006461	C	6	6	452265	452270	0 %	0 %	0 %	100 %	55980451
11524	NC_006461	CCT	2	6	452279	452284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
11525	NC_006461	GAG	2	6	452378	452383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980451
11526	NC_006461	GCCCT	2	10	452424	452433	0 %	20 %	20 %	60 %	55980451
11527	NC_006461	TCC	2	6	452458	452463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
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11531	NC_006461	TCC	2	6	452524	452529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980451
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11533	NC_006461	TGG	2	6	452548	452553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980451
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11538	NC_006461	C	6	6	452721	452726	0 %	0 %	0 %	100 %	55980451
11539	NC_006461	GAG	2	6	452730	452735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980451
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11541	NC_006461	CCGCC	2	10	452765	452774	0 %	0 %	20 %	80 %	55980451
11542	NC_006461	CTC	2	6	452822	452827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980452
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11546	NC_006461	AGG	4	12	452925	452936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980452
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11554	NC_006461	TCG	2	6	453177	453182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980452
11555	NC_006461	GGGC	2	8	453254	453261	0 %	0 %	75 %	25 %	55980452
11556	NC_006461	GCCCT	2	10	453266	453275	0 %	20 %	20 %	60 %	55980452
11557	NC_006461	CTT	2	6	453301	453306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980452
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11562	NC_006461	CTT	2	6	453490	453495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980452
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11595	NC_006461	GCCC	2	8	454874	454881	0 %	0 %	25 %	75 %	55980453
11596	NC_006461	C	6	6	454899	454904	0 %	0 %	0 %	100 %	55980453
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11599	NC_006461	GAG	3	9	454970	454978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980453
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11604	NC_006461	TGG	2	6	455178	455183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980454
11605	NC_006461	CCCCA	2	10	455192	455201	20 %	0 %	0 %	80 %	55980454
11606	NC_006461	GGA	2	6	455224	455229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980454
11607	NC_006461	GCC	2	6	455237	455242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980454
11608	NC_006461	G	6	6	455399	455404	0 %	0 %	100 %	0 %	55980454
11609	NC_006461	CG	3	6	455470	455475	0 %	0 %	50 %	50 %	55980454
11610	NC_006461	CTTT	2	8	455484	455491	0 %	75 %	0 %	25 %	55980454
11611	NC_006461	CTC	2	6	455519	455524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980454
11612	NC_006461	GCG	2	6	455548	455553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980454
11613	NC_006461	CCTC	2	8	455716	455723	0 %	25 %	0 %	75 %	55980454
11614	NC_006461	AAG	2	6	455762	455767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980454
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11616	NC_006461	GGA	2	6	455800	455805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
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11619	NC_006461	TCC	2	6	455989	455994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980455
11620	NC_006461	GCCC	2	8	456000	456007	0 %	0 %	25 %	75 %	55980455
11621	NC_006461	GAA	2	6	456017	456022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980455
11622	NC_006461	AGG	2	6	456027	456032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
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11624	NC_006461	AGGG	2	8	456153	456160	25 %	0 %	75 %	0 %	55980455
11625	NC_006461	G	7	7	456158	456164	0 %	0 %	100 %	0 %	55980455
11626	NC_006461	GAG	2	6	456230	456235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
11627	NC_006461	G	6	6	456295	456300	0 %	0 %	100 %	0 %	55980455
11628	NC_006461	CCTCCA	2	12	456304	456315	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	55980455
11629	NC_006461	G	6	6	456316	456321	0 %	0 %	100 %	0 %	55980455
11630	NC_006461	GAG	2	6	456323	456328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980455
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11632	NC_006461	GCG	2	6	456408	456413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980455
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11637	NC_006461	CGGGGT	2	12	456583	456594	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	55980455
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11726	NC_006461	GACG	2	8	459857	459864	25 %	0 %	50 %	25 %	55980460
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11732	NC_006461	GCCC	2	8	460070	460077	0 %	0 %	25 %	75 %	55980460
11733	NC_006461	GGCCGC	2	12	460091	460102	0 %	0 %	50 %	50 %	55980460
11734	NC_006461	GC	3	6	460136	460141	0 %	0 %	50 %	50 %	55980461
11735	NC_006461	CTA	2	6	460175	460180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980461
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11738	NC_006461	CCT	2	6	460316	460321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980461
11739	NC_006461	TCT	2	6	460330	460335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980461
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11742	NC_006461	CTCC	2	8	460468	460475	0 %	25 %	0 %	75 %	55980462
11743	NC_006461	CCTCGC	2	12	460528	460539	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980462
11744	NC_006461	G	7	7	460556	460562	0 %	0 %	100 %	0 %	55980462
11745	NC_006461	CGG	2	6	460563	460568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980462
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11991	NC_006461	CAC	2	6	470193	470198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980474
11992	NC_006461	CCA	2	6	470207	470212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980474
11993	NC_006461	CAC	2	6	470271	470276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980474
11994	NC_006461	GGGA	2	8	470290	470297	25 %	0 %	75 %	0 %	55980474
11995	NC_006461	TGG	2	6	470350	470355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980474
11996	NC_006461	CAC	2	6	470364	470369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980474
11997	NC_006461	CCT	3	9	470378	470386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980474
11998	NC_006461	CCTC	2	8	470465	470472	0 %	25 %	0 %	75 %	55980474
11999	NC_006461	CCGG	2	8	470481	470488	0 %	0 %	50 %	50 %	55980474
12000	NC_006461	TCC	2	6	470506	470511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980474

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