MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_006461	TAC	2	6	432852	432857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980432
11002	NC_006461	GAG	2	6	432966	432971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980432
11003	NC_006461	GGA	2	6	433010	433015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980432
11004	NC_006461	GCGG	2	8	433022	433029	0 %	0 %	75 %	25 %	55980432
11005	NC_006461	C	6	6	433077	433082	0 %	0 %	0 %	100 %	55980432
11006	NC_006461	TGGA	2	8	433098	433105	25 %	25 %	50 %	0 %	55980432
11007	NC_006461	CGG	2	6	433133	433138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980433
11008	NC_006461	GAG	2	6	433181	433186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11009	NC_006461	GCG	2	6	433187	433192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980433
11010	NC_006461	AGG	2	6	433233	433238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11011	NC_006461	GAA	2	6	433244	433249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980433
11012	NC_006461	GTC	2	6	433262	433267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980433
11013	NC_006461	CAGG	2	8	433308	433315	25 %	0 %	50 %	25 %	55980433
11014	NC_006461	GTA	2	6	433322	433327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980433
11015	NC_006461	TCC	2	6	433356	433361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980433
11016	NC_006461	GGGA	2	8	433365	433372	25 %	0 %	75 %	0 %	55980433
11017	NC_006461	GAG	2	6	433373	433378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11018	NC_006461	GGC	2	6	433399	433404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980433
11019	NC_006461	AGG	2	6	433416	433421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11020	NC_006461	GCTTCG	2	12	433452	433463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980433
11021	NC_006461	GC	3	6	433511	433516	0 %	0 %	50 %	50 %	55980433
11022	NC_006461	TCC	2	6	433533	433538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980433
11023	NC_006461	C	6	6	433621	433626	0 %	0 %	0 %	100 %	55980433
11024	NC_006461	TGC	2	6	433656	433661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980433
11025	NC_006461	GGC	2	6	433676	433681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980433
11026	NC_006461	G	7	7	433691	433697	0 %	0 %	100 %	0 %	55980433
11027	NC_006461	G	6	6	433753	433758	0 %	0 %	100 %	0 %	55980433
11028	NC_006461	AGG	2	6	433815	433820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11029	NC_006461	TCC	2	6	433845	433850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980433
11030	NC_006461	GTTG	2	8	433882	433889	0 %	50 %	50 %	0 %	55980433
11031	NC_006461	GAG	2	6	433904	433909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11032	NC_006461	GCC	2	6	433926	433931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980433
11033	NC_006461	AGG	2	6	433944	433949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11034	NC_006461	TTG	2	6	433962	433967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55980433
11035	NC_006461	CCA	2	6	433981	433986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980433
11036	NC_006461	GAG	2	6	434015	434020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11037	NC_006461	GAGG	2	8	434037	434044	25 %	0 %	75 %	0 %	55980433
11038	NC_006461	G	6	6	434043	434048	0 %	0 %	100 %	0 %	55980433
11039	NC_006461	GAG	2	6	434072	434077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980433
11040	NC_006461	GCG	2	6	434082	434087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980433
11041	NC_006461	CGG	2	6	434122	434127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980433
11042	NC_006461	GGC	2	6	434163	434168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980434
11043	NC_006461	GAG	2	6	434176	434181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980434
11044	NC_006461	GGC	3	9	434217	434225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980434
11045	NC_006461	GGC	2	6	434232	434237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980434
11046	NC_006461	GGC	2	6	434241	434246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980434
11047	NC_006461	TGG	2	6	434327	434332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980434
11048	NC_006461	TGG	2	6	434336	434341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980434
11049	NC_006461	TTC	2	6	434359	434364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980434
11050	NC_006461	CTC	2	6	434451	434456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980434
11051	NC_006461	ACC	2	6	434476	434481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980434
11052	NC_006461	CTC	2	6	434550	434555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980434
11053	NC_006461	GCG	2	6	434607	434612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980434
11054	NC_006461	C	7	7	434675	434681	0 %	0 %	0 %	100 %	55980434
11055	NC_006461	GTA	2	6	434733	434738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980434
11056	NC_006461	CCCCT	2	10	434743	434752	0 %	20 %	0 %	80 %	55980434
11057	NC_006461	CGG	2	6	434807	434812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980434
11058	NC_006461	GAT	2	6	434814	434819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980434
11059	NC_006461	GGT	2	6	434853	434858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980434
11060	NC_006461	CCA	2	6	434942	434947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980434
11061	NC_006461	CGT	2	6	434993	434998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980434
11062	NC_006461	C	6	6	435033	435038	0 %	0 %	0 %	100 %	55980434
11063	NC_006461	GCCCC	2	10	435116	435125	0 %	0 %	20 %	80 %	55980434
11064	NC_006461	CCG	2	6	435149	435154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980434
11065	NC_006461	GGA	2	6	435202	435207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980435
11066	NC_006461	CTC	2	6	435230	435235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980435
11067	NC_006461	CCG	3	9	435253	435261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980435
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11069	NC_006461	CTC	2	6	435305	435310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980435
11070	NC_006461	GGC	2	6	435334	435339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980435
11071	NC_006461	TGG	2	6	435352	435357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980435
11072	NC_006461	AGA	2	6	435382	435387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980435
11073	NC_006461	GAG	2	6	435420	435425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980435
11074	NC_006461	GGCGAT	2	12	435431	435442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	55980435
11075	NC_006461	CCA	2	6	435502	435507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980435
11076	NC_006461	C	6	6	435525	435530	0 %	0 %	0 %	100 %	55980435
11077	NC_006461	GGC	2	6	435535	435540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980435
11078	NC_006461	GGGT	2	8	435561	435568	0 %	25 %	75 %	0 %	55980435
11079	NC_006461	TCG	2	6	435582	435587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980435
11080	NC_006461	CGG	2	6	435606	435611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980435
11081	NC_006461	TCC	2	6	435618	435623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980435
11082	NC_006461	CCG	2	6	435628	435633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980435
11083	NC_006461	GGC	2	6	435674	435679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980435
11084	NC_006461	CGG	2	6	435697	435702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980435
11085	NC_006461	CGT	2	6	435715	435720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980435
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11088	NC_006461	CTC	2	6	435794	435799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980435
11089	NC_006461	AAAGG	2	10	435800	435809	60 %	0 %	40 %	0 %	55980435
11090	NC_006461	CTTGGG	2	12	435812	435823	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	55980435
11091	NC_006461	GTGCC	2	10	435864	435873	0 %	20 %	40 %	40 %	55980435
11092	NC_006461	TCC	2	6	435912	435917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980435
11093	NC_006461	CCGC	2	8	435938	435945	0 %	0 %	25 %	75 %	55980435
11094	NC_006461	TGA	2	6	435961	435966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980435
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11096	NC_006461	CGC	2	6	436021	436026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980435
11097	NC_006461	TCCG	2	8	436028	436035	0 %	25 %	25 %	50 %	55980435
11098	NC_006461	GGGGGA	2	12	436048	436059	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	55980435
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11102	NC_006461	ACC	2	6	436209	436214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980435
11103	NC_006461	GC	3	6	436215	436220	0 %	0 %	50 %	50 %	55980435
11104	NC_006461	GA	3	6	436329	436334	50 %	0 %	50 %	0 %	543165179
11105	NC_006461	C	6	6	436412	436417	0 %	0 %	0 %	100 %	543165179
11106	NC_006461	C	6	6	436436	436441	0 %	0 %	0 %	100 %	543165179
11107	NC_006461	CCA	2	6	436453	436458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543165179
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11109	NC_006461	CGCCCC	2	12	436528	436539	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	543165179
11110	NC_006461	C	6	6	436579	436584	0 %	0 %	0 %	100 %	543165179
11111	NC_006461	CCT	2	6	436588	436593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543165179
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11113	NC_006461	C	7	7	436657	436663	0 %	0 %	0 %	100 %	543165179
11114	NC_006461	CAC	2	6	436694	436699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543165179
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11117	NC_006461	CGC	2	6	436776	436781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543165179
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11123	NC_006461	AGG	2	6	436966	436971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543165179
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11140	NC_006461	CCG	2	6	437723	437728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980438
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11231	NC_006461	GGC	2	6	441183	441188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980440
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11237	NC_006461	G	7	7	441381	441387	0 %	0 %	100 %	0 %	55980440
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11239	NC_006461	CAT	2	6	441447	441452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980440
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11241	NC_006461	CTT	2	6	441631	441636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980441
11242	NC_006461	CGA	2	6	441640	441645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980441
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11489	NC_006461	C	7	7	450967	450973	0 %	0 %	0 %	100 %	55980450
11490	NC_006461	AAC	2	6	450974	450979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55980450
11491	NC_006461	CTT	2	6	450988	450993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980450
11492	NC_006461	CGG	2	6	450994	450999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980450
11493	NC_006461	TAC	2	6	451034	451039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55980450
11494	NC_006461	TCC	2	6	451050	451055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980450
11495	NC_006461	AGC	2	6	451059	451064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980450
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11498	NC_006461	G	6	6	451134	451139	0 %	0 %	100 %	0 %	55980450
11499	NC_006461	GGC	2	6	451218	451223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980450
11500	NC_006461	CCTACG	2	12	451281	451292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980450

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