MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006461	GGGC	2	8	22744	22751	0 %	0 %	75 %	25 %	55979991
502	NC_006461	GAG	2	6	22754	22759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979991
503	NC_006461	TCC	2	6	22770	22775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979991
504	NC_006461	GTT	2	6	22877	22882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55979991
505	NC_006461	ATG	2	6	22896	22901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55979991
506	NC_006461	GCCC	2	8	23127	23134	0 %	0 %	25 %	75 %	55979992
507	NC_006461	C	6	6	23132	23137	0 %	0 %	0 %	100 %	55979992
508	NC_006461	TCT	2	6	23138	23143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55979992
509	NC_006461	GAGC	2	8	23152	23159	25 %	0 %	50 %	25 %	55979992
510	NC_006461	GCC	2	6	23176	23181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979992
511	NC_006461	TCC	2	6	23183	23188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
512	NC_006461	TGG	2	6	23207	23212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
513	NC_006461	GC	3	6	23232	23237	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
514	NC_006461	CTC	2	6	23242	23247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
515	NC_006461	GGGCC	2	10	23259	23268	0 %	0 %	60 %	40 %	55979992
516	NC_006461	GAG	2	6	23305	23310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
517	NC_006461	CTC	3	9	23320	23328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
518	NC_006461	AGGGC	2	10	23339	23348	20 %	0 %	60 %	20 %	55979992
519	NC_006461	TGG	2	6	23351	23356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
520	NC_006461	GAA	2	6	23424	23429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55979992
521	NC_006461	TGG	2	6	23432	23437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
522	NC_006461	GAGG	2	8	23451	23458	25 %	0 %	75 %	0 %	55979992
523	NC_006461	GGA	3	9	23517	23525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
524	NC_006461	G	6	6	23527	23532	0 %	0 %	100 %	0 %	55979992
525	NC_006461	C	6	6	23559	23564	0 %	0 %	0 %	100 %	55979992
526	NC_006461	GGA	2	6	23583	23588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
527	NC_006461	GGC	2	6	23637	23642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979992
528	NC_006461	CCT	2	6	23667	23672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
529	NC_006461	GC	3	6	23698	23703	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
530	NC_006461	GCC	2	6	23713	23718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979992
531	NC_006461	CTC	2	6	23746	23751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
532	NC_006461	GGA	3	9	23766	23774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
533	NC_006461	CTC	2	6	23791	23796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
534	NC_006461	CCT	2	6	23802	23807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
535	NC_006461	G	6	6	23815	23820	0 %	0 %	100 %	0 %	55979992
536	NC_006461	GGT	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
537	NC_006461	ACCCC	2	10	23843	23852	20 %	0 %	0 %	80 %	55979992
538	NC_006461	CAC	2	6	23901	23906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55979992
539	NC_006461	CCT	2	6	23916	23921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
540	NC_006461	G	8	8	23949	23956	0 %	0 %	100 %	0 %	55979992
541	NC_006461	C	6	6	24086	24091	0 %	0 %	0 %	100 %	55979992
542	NC_006461	TGG	2	6	24110	24115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
543	NC_006461	CCG	2	6	24118	24123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979992
544	NC_006461	GGA	3	9	24141	24149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
545	NC_006461	GAG	2	6	24151	24156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
546	NC_006461	CCT	2	6	24261	24266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
547	NC_006461	CGC	2	6	24279	24284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979992
548	NC_006461	CGA	2	6	24291	24296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979992
549	NC_006461	CCT	2	6	24348	24353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
550	NC_006461	GCC	2	6	24370	24375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979992
551	NC_006461	GGA	2	6	24429	24434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
552	NC_006461	GGA	2	6	24474	24479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
553	NC_006461	GTG	2	6	24484	24489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
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555	NC_006461	CCGG	2	8	24596	24603	0 %	0 %	50 %	50 %	55979992
556	NC_006461	G	6	6	24640	24645	0 %	0 %	100 %	0 %	55979992
557	NC_006461	CGG	2	6	24773	24778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979992
558	NC_006461	CTT	2	6	24912	24917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55979992
559	NC_006461	TCC	2	6	24962	24967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
560	NC_006461	GGT	2	6	25005	25010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979992
561	NC_006461	GGA	2	6	25020	25025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
562	NC_006461	GGA	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979992
563	NC_006461	CTC	2	6	25075	25080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979992
564	NC_006461	ACGGGG	2	12	25151	25162	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	55979992
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567	NC_006461	CGC	2	6	25334	25339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979993
568	NC_006461	GCC	2	6	25340	25345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979993
569	NC_006461	AGGAG	2	10	25349	25358	40 %	0 %	60 %	0 %	55979993
570	NC_006461	G	6	6	25559	25564	0 %	0 %	100 %	0 %	55979993
571	NC_006461	GC	3	6	25590	25595	0 %	0 %	50 %	50 %	55979993
572	NC_006461	C	6	6	25607	25612	0 %	0 %	0 %	100 %	55979993
573	NC_006461	CCT	2	6	25631	25636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
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576	NC_006461	CCT	2	6	25727	25732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
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579	NC_006461	GTCCC	2	10	25858	25867	0 %	20 %	20 %	60 %	55979993
580	NC_006461	G	6	6	25910	25915	0 %	0 %	100 %	0 %	55979993
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583	NC_006461	TCC	2	6	25987	25992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
584	NC_006461	GAG	3	9	26013	26021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979993
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586	NC_006461	CTC	2	6	26151	26156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
587	NC_006461	CCAG	2	8	26171	26178	25 %	0 %	25 %	50 %	55979993
588	NC_006461	CGGCAC	2	12	26196	26207	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55979993
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591	NC_006461	CCCG	2	8	26347	26354	0 %	0 %	25 %	75 %	55979993
592	NC_006461	TCC	2	6	26386	26391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
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596	NC_006461	C	6	6	26503	26508	0 %	0 %	0 %	100 %	55979993
597	NC_006461	CCT	2	6	26522	26527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
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599	NC_006461	CTTC	2	8	26572	26579	0 %	50 %	0 %	50 %	55979993
600	NC_006461	CCT	2	6	26582	26587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
601	NC_006461	AGG	2	6	26590	26595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979993
602	NC_006461	TCC	2	6	26602	26607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
603	NC_006461	C	6	6	26630	26635	0 %	0 %	0 %	100 %	55979993
604	NC_006461	GAC	2	6	26661	26666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55979993
605	NC_006461	GTG	3	9	26791	26799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979993
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608	NC_006461	GCGGG	2	10	26841	26850	0 %	0 %	80 %	20 %	55979993
609	NC_006461	GGA	2	6	26858	26863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979993
610	NC_006461	TGG	2	6	26921	26926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55979993
611	NC_006461	C	6	6	26978	26983	0 %	0 %	0 %	100 %	55979993
612	NC_006461	GAG	2	6	26988	26993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979993
613	NC_006461	CTC	3	9	27009	27017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
614	NC_006461	TCA	2	6	27041	27046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55979993
615	NC_006461	GAG	2	6	27099	27104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979993
616	NC_006461	G	6	6	27114	27119	0 %	0 %	100 %	0 %	55979993
617	NC_006461	AAG	2	6	27139	27144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55979993
618	NC_006461	CGG	2	6	27155	27160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55979993
619	NC_006461	CCT	2	6	27176	27181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979993
620	NC_006461	GCC	2	6	27208	27213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979993
621	NC_006461	GCC	2	6	27217	27222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55979993
622	NC_006461	GGA	2	6	27242	27247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55979993
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630	NC_006461	CCT	2	6	27610	27615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55979994
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