MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB8 chromosome

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_006461	GGTC	2	8	177568	177575	0 %	25 %	50 %	25 %	55980149
4502	NC_006461	GTC	2	6	177600	177605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980149
4503	NC_006461	GAG	2	6	177620	177625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4504	NC_006461	CGC	2	6	177638	177643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980149
4505	NC_006461	AGG	2	6	177651	177656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980149
4506	NC_006461	TGG	2	6	177672	177677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980149
4507	NC_006461	ATG	2	6	177761	177766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980150
4508	NC_006461	GGA	2	6	177832	177837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980150
4509	NC_006461	GTG	2	6	177851	177856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980150
4510	NC_006461	GGGGC	2	10	177859	177868	0 %	0 %	80 %	20 %	55980150
4511	NC_006461	CGCC	2	8	177904	177911	0 %	0 %	25 %	75 %	55980150
4512	NC_006461	AGG	2	6	177924	177929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980150
4513	NC_006461	CTC	2	6	177944	177949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980150
4514	NC_006461	C	7	7	177993	177999	0 %	0 %	0 %	100 %	55980150
4515	NC_006461	GAG	2	6	178001	178006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980150
4516	NC_006461	GAGG	2	8	178021	178028	25 %	0 %	75 %	0 %	55980150
4517	NC_006461	GTG	2	6	178047	178052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980150
4518	NC_006461	TCC	3	9	178066	178074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980151
4519	NC_006461	GGC	2	6	178085	178090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980151
4520	NC_006461	CGC	2	6	178151	178156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980151
4521	NC_006461	GGCCGA	2	12	178226	178237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980151
4522	NC_006461	GCC	2	6	178338	178343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980151
4523	NC_006461	ACG	2	6	178345	178350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55980151
4524	NC_006461	CCTGGC	2	12	178358	178369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980151
4525	NC_006461	CCG	2	6	178396	178401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980151
4526	NC_006461	C	7	7	178553	178559	0 %	0 %	0 %	100 %	55980152
4527	NC_006461	CCA	2	6	178564	178569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980152
4528	NC_006461	GGC	2	6	178594	178599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980152
4529	NC_006461	CTC	2	6	178607	178612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980152
4530	NC_006461	GAG	2	6	178682	178687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980152
4531	NC_006461	CTC	3	9	178709	178717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980152
4532	NC_006461	GGA	2	6	178822	178827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980152
4533	NC_006461	GAG	2	6	178871	178876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980152
4534	NC_006461	G	6	6	178876	178881	0 %	0 %	100 %	0 %	55980152
4535	NC_006461	TGGG	2	8	178883	178890	0 %	25 %	75 %	0 %	55980152
4536	NC_006461	CCT	2	6	179026	179031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980152
4537	NC_006461	GGCTA	2	10	179034	179043	20 %	20 %	40 %	20 %	55980152
4538	NC_006461	TCC	2	6	179061	179066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980153
4539	NC_006461	GGC	2	6	179083	179088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980153
4540	NC_006461	GCGG	2	8	179093	179100	0 %	0 %	75 %	25 %	55980153
4541	NC_006461	GGT	2	6	179122	179127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980153
4542	NC_006461	CCT	2	6	179170	179175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980153
4543	NC_006461	GCC	2	6	179264	179269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980153
4544	NC_006461	C	7	7	179273	179279	0 %	0 %	0 %	100 %	55980153
4545	NC_006461	CTC	2	6	179363	179368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980153
4546	NC_006461	AGGGCC	2	12	179532	179543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980153
4547	NC_006461	GAG	2	6	179546	179551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980153
4548	NC_006461	GGTGAG	2	12	179558	179569	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	55980153
4549	NC_006461	CTT	2	6	179591	179596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980153
4550	NC_006461	GCC	2	6	179775	179780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980153
4551	NC_006461	GCC	2	6	179787	179792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980153
4552	NC_006461	GCC	2	6	179796	179801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980153
4553	NC_006461	CGC	2	6	179813	179818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980153
4554	NC_006461	TCC	2	6	179829	179834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980153
4555	NC_006461	GCC	2	6	179902	179907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980153
4556	NC_006461	GCC	2	6	179919	179924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980153
4557	NC_006461	GGC	2	6	179932	179937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980153
4558	NC_006461	CCT	2	6	179950	179955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980153
4559	NC_006461	G	6	6	179956	179961	0 %	0 %	100 %	0 %	55980153
4560	NC_006461	CCT	2	6	179995	180000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980153
4561	NC_006461	GGGC	2	8	180010	180017	0 %	0 %	75 %	25 %	55980153
4562	NC_006461	TCC	2	6	180030	180035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980153
4563	NC_006461	CCGCC	2	10	180055	180064	0 %	0 %	20 %	80 %	55980153
4564	NC_006461	CTCGGC	2	12	180065	180076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	55980153
4565	NC_006461	CAC	2	6	180137	180142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980153
4566	NC_006461	GCC	2	6	180143	180148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980153
4567	NC_006461	CCA	2	6	180166	180171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980153
4568	NC_006461	CTTC	2	8	180226	180233	0 %	50 %	0 %	50 %	55980153
4569	NC_006461	CAC	2	6	180245	180250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980153
4570	NC_006461	CCG	2	6	180311	180316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980154
4571	NC_006461	CCT	2	6	180328	180333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4572	NC_006461	TCCT	2	8	180351	180358	0 %	50 %	0 %	50 %	55980154
4573	NC_006461	CAGGGC	2	12	180404	180415	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	55980154
4574	NC_006461	AAG	2	6	180447	180452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980154
4575	NC_006461	CCGT	2	8	180489	180496	0 %	25 %	25 %	50 %	55980154
4576	NC_006461	GGC	2	6	180566	180571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4577	NC_006461	CCT	2	6	180601	180606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4578	NC_006461	TGG	2	6	180688	180693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980154
4579	NC_006461	CCA	2	6	180709	180714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980154
4580	NC_006461	TCCCC	2	10	180799	180808	0 %	20 %	0 %	80 %	55980154
4581	NC_006461	CCT	2	6	180841	180846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4582	NC_006461	G	7	7	180872	180878	0 %	0 %	100 %	0 %	55980154
4583	NC_006461	GTTCTC	2	12	180887	180898	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	55980154
4584	NC_006461	GTA	2	6	180908	180913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980154
4585	NC_006461	TCC	2	6	180921	180926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4586	NC_006461	C	6	6	180925	180930	0 %	0 %	0 %	100 %	55980154
4587	NC_006461	GCG	2	6	180941	180946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4588	NC_006461	TCC	2	6	180954	180959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4589	NC_006461	GAG	2	6	181001	181006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980154
4590	NC_006461	GGC	2	6	181013	181018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4591	NC_006461	GGT	2	6	181073	181078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980154
4592	NC_006461	CCG	2	6	181084	181089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980154
4593	NC_006461	GAA	2	6	181100	181105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980154
4594	NC_006461	GC	3	6	181113	181118	0 %	0 %	50 %	50 %	55980154
4595	NC_006461	CGG	3	9	181123	181131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4596	NC_006461	TGA	2	6	181177	181182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980154
4597	NC_006461	TGG	2	6	181192	181197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980154
4598	NC_006461	CGG	2	6	181225	181230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4599	NC_006461	CTC	2	6	181268	181273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4600	NC_006461	G	6	6	181348	181353	0 %	0 %	100 %	0 %	55980154
4601	NC_006461	TCG	2	6	181404	181409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980154
4602	NC_006461	GGA	2	6	181450	181455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980154
4603	NC_006461	TGG	3	9	181483	181491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980154
4604	NC_006461	C	6	6	181502	181507	0 %	0 %	0 %	100 %	55980154
4605	NC_006461	GAA	2	6	181529	181534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980154
4606	NC_006461	CTC	3	9	181535	181543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4607	NC_006461	C	6	6	181557	181562	0 %	0 %	0 %	100 %	55980154
4608	NC_006461	CCT	2	6	181574	181579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4609	NC_006461	GCC	2	6	181592	181597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980154
4610	NC_006461	TCC	2	6	181606	181611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4611	NC_006461	AGG	2	6	181617	181622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980154
4612	NC_006461	GTA	2	6	181655	181660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980154
4613	NC_006461	GCCTC	2	10	181708	181717	0 %	20 %	20 %	60 %	55980154
4614	NC_006461	TCC	2	6	181725	181730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4615	NC_006461	CTT	2	6	181739	181744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980154
4616	NC_006461	TGG	2	6	181749	181754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55980154
4617	NC_006461	GGC	2	6	181856	181861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4618	NC_006461	GCC	2	6	181883	181888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980154
4619	NC_006461	CTC	2	6	181913	181918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4620	NC_006461	CTT	2	6	181940	181945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980154
4621	NC_006461	GAA	2	6	181961	181966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980154
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4623	NC_006461	CCA	2	6	182020	182025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980154
4624	NC_006461	GCG	2	6	182036	182041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4625	NC_006461	GAG	2	6	182042	182047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980154
4626	NC_006461	CCT	2	6	182053	182058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980154
4627	NC_006461	GAG	2	6	182069	182074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980154
4628	NC_006461	ACC	2	6	182097	182102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980154
4629	NC_006461	CAC	2	6	182204	182209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980154
4630	NC_006461	GCG	2	6	182238	182243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4631	NC_006461	TCG	2	6	182271	182276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980154
4632	NC_006461	TCCCCG	2	12	182280	182291	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980154
4633	NC_006461	GC	3	6	182357	182362	0 %	0 %	50 %	50 %	55980154
4634	NC_006461	C	6	6	182463	182468	0 %	0 %	0 %	100 %	55980154
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4642	NC_006461	CTT	2	6	182693	182698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55980154
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4645	NC_006461	GCG	2	6	182750	182755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980154
4646	NC_006461	CTCCAG	2	12	182756	182767	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55980154
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4650	NC_006461	TCCTGG	2	12	183157	183168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980155
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4653	NC_006461	CGG	2	6	183301	183306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980155
4654	NC_006461	CCG	2	6	183317	183322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980155
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4726	NC_006461	GTCCCC	2	12	185650	185661	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	55980158
4727	NC_006461	AGGCG	2	10	185697	185706	20 %	0 %	60 %	20 %	55980158
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4731	NC_006461	G	6	6	185862	185867	0 %	0 %	100 %	0 %	55980158
4732	NC_006461	GTA	3	9	185872	185880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55980158
4733	NC_006461	GAA	2	6	185886	185891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55980158
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4735	NC_006461	AACC	2	8	185962	185969	50 %	0 %	0 %	50 %	55980158
4736	NC_006461	GGACCC	2	12	186259	186270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55980159
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4738	NC_006461	GCG	2	6	186347	186352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980159
4739	NC_006461	CCT	2	6	186364	186369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980159
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4741	NC_006461	CGG	2	6	186385	186390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980159
4742	NC_006461	TCC	2	6	186405	186410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980159
4743	NC_006461	CCA	2	6	186454	186459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55980159
4744	NC_006461	GCC	2	6	186475	186480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980159
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4746	NC_006461	CGT	2	6	186587	186592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55980160
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4748	NC_006461	GGC	2	6	186636	186641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980160
4749	NC_006461	TCC	2	6	186670	186675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55980160
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4752	NC_006461	GGA	2	6	186761	186766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980160
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4997	NC_006461	CGC	2	6	196173	196178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55980169
4998	NC_006461	GGC	2	6	196245	196250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55980169
4999	NC_006461	GGA	2	6	196260	196265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55980169
5000	NC_006461	GAAG	2	8	196272	196279	50 %	0 %	50 %	0 %	55980169

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