MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005838	CTC	3	9	167636	167644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255238
4002	NC_005838	GCCC	2	8	167652	167659	0 %	0 %	25 %	75 %	46255238
4003	NC_005838	C	7	7	167657	167663	0 %	0 %	0 %	100 %	46255238
4004	NC_005838	TCC	2	6	167700	167705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255238
4005	NC_005838	GAA	2	6	167708	167713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255238
4006	NC_005838	CGAA	2	8	167751	167758	50 %	0 %	25 %	25 %	46255238
4007	NC_005838	G	6	6	167818	167823	0 %	0 %	100 %	0 %	46255238
4008	NC_005838	TGG	2	6	167844	167849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255238
4009	NC_005838	ACC	2	6	167859	167864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255238
4010	NC_005838	CCA	2	6	167893	167898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255238
4011	NC_005838	GGA	3	9	167908	167916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255238
4012	NC_005838	AGG	2	6	167973	167978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255238
4013	NC_005838	GCG	2	6	167981	167986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255238
4014	NC_005838	CCT	2	6	168015	168020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255239
4015	NC_005838	TCC	2	6	168045	168050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255239
4016	NC_005838	CCGT	2	8	168119	168126	0 %	25 %	25 %	50 %	46255239
4017	NC_005838	GTA	2	6	168163	168168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255239
4018	NC_005838	CAG	2	6	168196	168201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255239
4019	NC_005838	GGTGCG	2	12	168205	168216	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46255239
4020	NC_005838	GTC	2	6	168235	168240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255239
4021	NC_005838	AGG	2	6	168251	168256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255239
4022	NC_005838	G	7	7	168262	168268	0 %	0 %	100 %	0 %	46255239
4023	NC_005838	AGG	2	6	168290	168295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255239
4024	NC_005838	G	6	6	168303	168308	0 %	0 %	100 %	0 %	46255239
4025	NC_005838	CAC	2	6	168322	168327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255239
4026	NC_005838	AGG	2	6	168357	168362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255239
4027	NC_005838	CGG	2	6	168380	168385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255239
4028	NC_005838	GAA	2	6	168412	168417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255239
4029	NC_005838	GAG	2	6	168421	168426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255239
4030	NC_005838	G	6	6	168490	168495	0 %	0 %	100 %	0 %	46255239
4031	NC_005838	GGGC	2	8	168516	168523	0 %	0 %	75 %	25 %	46255239
4032	NC_005838	GC	3	6	168630	168635	0 %	0 %	50 %	50 %	46255239
4033	NC_005838	CTC	2	6	168664	168669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255239
4034	NC_005838	GCCG	2	8	168687	168694	0 %	0 %	50 %	50 %	46255239
4035	NC_005838	TCC	2	6	168710	168715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255239
4036	NC_005838	G	7	7	168745	168751	0 %	0 %	100 %	0 %	46255239
4037	NC_005838	G	6	6	168755	168760	0 %	0 %	100 %	0 %	46255239
4038	NC_005838	CCT	2	6	168777	168782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255239
4039	NC_005838	GGC	2	6	168789	168794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255239
4040	NC_005838	G	7	7	168798	168804	0 %	0 %	100 %	0 %	46255239
4041	NC_005838	G	6	6	168811	168816	0 %	0 %	100 %	0 %	46255239
4042	NC_005838	AGG	2	6	168840	168845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255239
4043	NC_005838	CCT	2	6	168897	168902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255239
4044	NC_005838	C	6	6	168930	168935	0 %	0 %	0 %	100 %	46255239
4045	NC_005838	CCCA	2	8	169006	169013	25 %	0 %	0 %	75 %	46255239
4046	NC_005838	GGC	2	6	169015	169020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255239
4047	NC_005838	GCCG	2	8	169080	169087	0 %	0 %	50 %	50 %	46255239
4048	NC_005838	GGCG	2	8	169098	169105	0 %	0 %	75 %	25 %	46255239
4049	NC_005838	AGGAG	2	10	169110	169119	40 %	0 %	60 %	0 %	46255239
4050	NC_005838	ACCCC	2	10	169207	169216	20 %	0 %	0 %	80 %	46255239
4051	NC_005838	CCG	2	6	169219	169224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255239
4052	NC_005838	AGG	2	6	169260	169265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255239
4053	NC_005838	GC	3	6	169286	169291	0 %	0 %	50 %	50 %	46255239
4054	NC_005838	CCT	2	6	169348	169353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255239
4055	NC_005838	GGC	2	6	169366	169371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255239
4056	NC_005838	G	6	6	169376	169381	0 %	0 %	100 %	0 %	46255239
4057	NC_005838	CGG	2	6	169416	169421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255240
4058	NC_005838	GGC	2	6	169429	169434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255240
4059	NC_005838	CGG	2	6	169459	169464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255240
4060	NC_005838	AGG	3	9	169509	169517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255240
4061	NC_005838	TCC	2	6	169602	169607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255240
4062	NC_005838	GGA	2	6	169648	169653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255240
4063	NC_005838	GCC	2	6	169715	169720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255240
4064	NC_005838	GGC	2	6	169741	169746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255240
4065	NC_005838	TCC	2	6	169776	169781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255240
4066	NC_005838	GGA	2	6	169849	169854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255240
4067	NC_005838	GGGGGC	2	12	170070	170081	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	46255241
4068	NC_005838	GGGCG	2	10	170088	170097	0 %	0 %	80 %	20 %	46255241
4069	NC_005838	CAC	3	9	170109	170117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255241
4070	NC_005838	GGC	2	6	170196	170201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255241
4071	NC_005838	CCGG	2	8	170204	170211	0 %	0 %	50 %	50 %	46255241
4072	NC_005838	G	6	6	170232	170237	0 %	0 %	100 %	0 %	46255241
4073	NC_005838	CCT	2	6	170304	170309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255241
4074	NC_005838	CGA	2	6	170319	170324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255241
4075	NC_005838	CGA	3	9	170331	170339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255241
4076	NC_005838	TCC	2	6	170357	170362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255241
4077	NC_005838	CTT	2	6	170466	170471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255241
4078	NC_005838	TCA	2	6	170531	170536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255241
4079	NC_005838	GCG	2	6	170563	170568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255241
4080	NC_005838	CCG	2	6	170607	170612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255241
4081	NC_005838	AGC	2	6	170666	170671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255241
4082	NC_005838	GGC	3	9	170710	170718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255241
4083	NC_005838	CAA	2	6	170748	170753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46255241
4084	NC_005838	CAC	2	6	170790	170795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255241
4085	NC_005838	AGC	2	6	170834	170839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255241
4086	NC_005838	CGG	2	6	170841	170846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255241
4087	NC_005838	CTT	2	6	170847	170852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255241
4088	NC_005838	GGA	2	6	170958	170963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255242
4089	NC_005838	GAT	2	6	171090	171095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255242
4090	NC_005838	GTG	2	6	171100	171105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255242
4091	NC_005838	GGCG	2	8	171113	171120	0 %	0 %	75 %	25 %	46255242
4092	NC_005838	C	6	6	171179	171184	0 %	0 %	0 %	100 %	46255242
4093	NC_005838	G	6	6	171203	171208	0 %	0 %	100 %	0 %	46255242
4094	NC_005838	CCTC	2	8	171222	171229	0 %	25 %	0 %	75 %	46255242
4095	NC_005838	GCC	2	6	171238	171243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255242
4096	NC_005838	CTC	2	6	171244	171249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255242
4097	NC_005838	GGC	2	6	171264	171269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255242
4098	NC_005838	AGG	2	6	171338	171343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255242
4099	NC_005838	GACC	2	8	171384	171391	25 %	0 %	25 %	50 %	46255242
4100	NC_005838	GGCCC	2	10	171420	171429	0 %	0 %	40 %	60 %	46255242
4101	NC_005838	CCT	2	6	171498	171503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255243
4102	NC_005838	TCC	2	6	171515	171520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255243
4103	NC_005838	CGG	2	6	171533	171538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255243
4104	NC_005838	C	6	6	171550	171555	0 %	0 %	0 %	100 %	46255243
4105	NC_005838	G	6	6	171584	171589	0 %	0 %	100 %	0 %	46255243
4106	NC_005838	GAG	2	6	171634	171639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255243
4107	NC_005838	CGGG	2	8	171654	171661	0 %	0 %	75 %	25 %	46255243
4108	NC_005838	C	7	7	171712	171718	0 %	0 %	0 %	100 %	46255243
4109	NC_005838	CTT	2	6	171732	171737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255243
4110	NC_005838	ACC	2	6	171740	171745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255243
4111	NC_005838	GGA	2	6	171762	171767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255243
4112	NC_005838	GCC	2	6	171778	171783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255243
4113	NC_005838	CCT	2	6	171798	171803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255243
4114	NC_005838	GGC	2	6	171804	171809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255243
4115	NC_005838	GAG	2	6	171832	171837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255243
4116	NC_005838	CCG	2	6	171882	171887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255243
4117	NC_005838	CCTGGA	2	12	171942	171953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46255243
4118	NC_005838	CTC	2	6	172003	172008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255243
4119	NC_005838	G	6	6	172051	172056	0 %	0 %	100 %	0 %	46255243
4120	NC_005838	G	8	8	172072	172079	0 %	0 %	100 %	0 %	46255243
4121	NC_005838	CCT	2	6	172192	172197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255243
4122	NC_005838	CTC	2	6	172259	172264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255243
4123	NC_005838	CGC	2	6	172351	172356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255243
4124	NC_005838	CGG	2	6	172396	172401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255243
4125	NC_005838	GGA	2	6	172720	172725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255244
4126	NC_005838	CCT	2	6	172771	172776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4127	NC_005838	CCG	2	6	172785	172790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255244
4128	NC_005838	CCT	2	6	172804	172809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4129	NC_005838	GCCC	2	8	172821	172828	0 %	0 %	25 %	75 %	46255244
4130	NC_005838	GGA	3	9	172960	172968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255244
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4132	NC_005838	G	6	6	173071	173076	0 %	0 %	100 %	0 %	46255244
4133	NC_005838	CTC	3	9	173120	173128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4134	NC_005838	GCCC	2	8	173139	173146	0 %	0 %	25 %	75 %	46255244
4135	NC_005838	CTC	2	6	173147	173152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
4136	NC_005838	TCC	2	6	173181	173186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
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4139	NC_005838	CCCGTC	2	12	173285	173296	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46255244
4140	NC_005838	TCT	2	6	173310	173315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255244
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4142	NC_005838	CGGG	2	8	173368	173375	0 %	0 %	75 %	25 %	46255244
4143	NC_005838	TCC	2	6	173487	173492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255244
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4147	NC_005838	TGG	2	6	173673	173678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255244
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4152	NC_005838	GAG	2	6	173840	173845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255244
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4156	NC_005838	TCC	2	6	173945	173950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255245
4157	NC_005838	GC	3	6	173993	173998	0 %	0 %	50 %	50 %	46255245
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4167	NC_005838	TCCAGG	2	12	174287	174298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46255245
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4230	NC_005838	GGT	2	6	176645	176650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255248
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4235	NC_005838	AGG	2	6	176854	176859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255248
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4238	NC_005838	C	7	7	177031	177037	0 %	0 %	0 %	100 %	46255249
4239	NC_005838	AGG	2	6	177038	177043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255249
4240	NC_005838	ACC	2	6	177050	177055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255249
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4242	NC_005838	GCC	2	6	177077	177082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255249
4243	NC_005838	GAG	2	6	177094	177099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255249
4244	NC_005838	CTCC	2	8	177119	177126	0 %	25 %	0 %	75 %	46255249
4245	NC_005838	CAG	2	6	177127	177132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255249
4246	NC_005838	GAG	2	6	177145	177150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255249
4247	NC_005838	GGT	2	6	177156	177161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255249
4248	NC_005838	G	6	6	177189	177194	0 %	0 %	100 %	0 %	46255249
4249	NC_005838	CCA	2	6	177195	177200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255249
4250	NC_005838	ACCCC	2	10	177210	177219	20 %	0 %	0 %	80 %	46255249
4251	NC_005838	GGCCAC	2	12	177229	177240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46255249
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4364	NC_005838	GTGG	2	8	184264	184271	0 %	25 %	75 %	0 %	46255258
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4367	NC_005838	G	6	6	184449	184454	0 %	0 %	100 %	0 %	46255258
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