MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005838	AGG	3	9	120357	120365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3002	NC_005838	CCT	2	6	120373	120378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3003	NC_005838	GCCC	2	8	120389	120396	0 %	0 %	25 %	75 %	46255199
3004	NC_005838	CTG	2	6	120404	120409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3005	NC_005838	CTC	2	6	120416	120421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3006	NC_005838	GGGC	2	8	120431	120438	0 %	0 %	75 %	25 %	46255199
3007	NC_005838	ACC	2	6	120447	120452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3008	NC_005838	GGT	2	6	120491	120496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255199
3009	NC_005838	CCA	3	9	120499	120507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3010	NC_005838	CAGGC	2	10	120618	120627	20 %	0 %	40 %	40 %	46255199
3011	NC_005838	C	6	6	120669	120674	0 %	0 %	0 %	100 %	46255199
3012	NC_005838	AGG	2	6	120690	120695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3013	NC_005838	CGAAG	2	10	120748	120757	40 %	0 %	40 %	20 %	46255199
3014	NC_005838	GCA	2	6	120781	120786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3015	NC_005838	GAA	2	6	120857	120862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255199
3016	NC_005838	ACC	2	6	120963	120968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3017	NC_005838	GCCC	2	8	121067	121074	0 %	0 %	25 %	75 %	46255199
3018	NC_005838	GAGGGC	2	12	121124	121135	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	46255199
3019	NC_005838	TCA	2	6	121174	121179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255199
3020	NC_005838	CCA	2	6	121183	121188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3021	NC_005838	G	6	6	121189	121194	0 %	0 %	100 %	0 %	46255199
3022	NC_005838	GAG	2	6	121268	121273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3023	NC_005838	GAG	2	6	121277	121282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3024	NC_005838	GGC	2	6	121285	121290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3025	NC_005838	GCC	2	6	121299	121304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255199
3026	NC_005838	GCT	2	6	121318	121323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3027	NC_005838	CCT	2	6	121360	121365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3028	NC_005838	GGC	2	6	121372	121377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3029	NC_005838	CCT	2	6	121438	121443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3030	NC_005838	TCC	3	9	121452	121460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3031	NC_005838	TCC	2	6	121488	121493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3032	NC_005838	AGA	2	6	121561	121566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255199
3033	NC_005838	GGA	2	6	121585	121590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3034	NC_005838	CTT	2	6	121592	121597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255199
3035	NC_005838	GTC	2	6	121637	121642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3036	NC_005838	GGC	2	6	121651	121656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3037	NC_005838	GTA	2	6	121694	121699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255199
3038	NC_005838	CTCG	2	8	121720	121727	0 %	25 %	25 %	50 %	46255199
3039	NC_005838	AGGCCA	2	12	121729	121740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3040	NC_005838	GAG	2	6	121751	121756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3041	NC_005838	G	6	6	121756	121761	0 %	0 %	100 %	0 %	46255199
3042	NC_005838	AGGGGA	2	12	121768	121779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3043	NC_005838	CAC	2	6	121793	121798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255199
3044	NC_005838	GCG	2	6	121848	121853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3045	NC_005838	TGC	2	6	121870	121875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3046	NC_005838	TCC	2	6	121893	121898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3047	NC_005838	CTCC	2	8	121901	121908	0 %	25 %	0 %	75 %	46255199
3048	NC_005838	G	6	6	121915	121920	0 %	0 %	100 %	0 %	46255199
3049	NC_005838	CTT	2	6	121949	121954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255199
3050	NC_005838	GGC	2	6	121955	121960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3051	NC_005838	GGC	2	6	121966	121971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3052	NC_005838	GAG	2	6	122096	122101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3053	NC_005838	GGT	2	6	122110	122115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255199
3054	NC_005838	GGAG	2	8	122127	122134	25 %	0 %	75 %	0 %	46255199
3055	NC_005838	GGA	2	6	122154	122159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3056	NC_005838	GC	3	6	122169	122174	0 %	0 %	50 %	50 %	46255199
3057	NC_005838	GGA	2	6	122176	122181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3058	NC_005838	CGC	2	6	122242	122247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255199
3059	NC_005838	TCC	2	6	122268	122273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3060	NC_005838	CGG	2	6	122278	122283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3061	NC_005838	CCG	2	6	122384	122389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255199
3062	NC_005838	GAA	2	6	122422	122427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255199
3063	NC_005838	AGG	2	6	122445	122450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3064	NC_005838	G	6	6	122459	122464	0 %	0 %	100 %	0 %	46255199
3065	NC_005838	CTC	2	6	122531	122536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3066	NC_005838	AGG	2	6	122544	122549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3067	NC_005838	CTC	2	6	122555	122560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3068	NC_005838	AGG	2	6	122572	122577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3069	NC_005838	CGC	2	6	122617	122622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255199
3070	NC_005838	GTC	2	6	122723	122728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3071	NC_005838	AGG	2	6	122760	122765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3072	NC_005838	GAG	2	6	122798	122803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3073	NC_005838	TCC	2	6	122856	122861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3074	NC_005838	GGT	2	6	122863	122868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255199
3075	NC_005838	GGGCG	2	10	122887	122896	0 %	0 %	80 %	20 %	46255199
3076	NC_005838	CTCC	2	8	123023	123030	0 %	25 %	0 %	75 %	46255199
3077	NC_005838	AAG	2	6	123084	123089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255199
3078	NC_005838	GGC	2	6	123131	123136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3079	NC_005838	GGA	3	9	123142	123150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3080	NC_005838	CGC	2	6	123158	123163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255199
3081	NC_005838	TCC	2	6	123171	123176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3082	NC_005838	GGA	2	6	123202	123207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3083	NC_005838	AGA	2	6	123216	123221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255199
3084	NC_005838	G	6	6	123244	123249	0 %	0 %	100 %	0 %	46255199
3085	NC_005838	GGC	2	6	123260	123265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255199
3086	NC_005838	TCC	2	6	123303	123308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3087	NC_005838	GTGG	2	8	123335	123342	0 %	25 %	75 %	0 %	46255199
3088	NC_005838	TGG	2	6	123363	123368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255199
3089	NC_005838	TCCCGG	2	12	123397	123408	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46255199
3090	NC_005838	AGG	3	9	123420	123428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3091	NC_005838	GGGCG	2	10	123478	123487	0 %	0 %	80 %	20 %	46255199
3092	NC_005838	GAG	2	6	123497	123502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3093	NC_005838	CCT	2	6	123541	123546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3094	NC_005838	GAA	2	6	123554	123559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255199
3095	NC_005838	GAG	2	6	123584	123589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3096	NC_005838	GC	3	6	123684	123689	0 %	0 %	50 %	50 %	46255199
3097	NC_005838	CGT	2	6	123736	123741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46255199
3098	NC_005838	GAG	2	6	123776	123781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3099	NC_005838	C	6	6	123819	123824	0 %	0 %	0 %	100 %	46255199
3100	NC_005838	AGG	2	6	123840	123845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3101	NC_005838	CCT	2	6	123898	123903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3102	NC_005838	GGA	2	6	123937	123942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3103	NC_005838	GAG	2	6	123953	123958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255199
3104	NC_005838	GCCT	2	8	123961	123968	0 %	25 %	25 %	50 %	46255199
3105	NC_005838	AAG	2	6	123972	123977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255199
3106	NC_005838	CTC	2	6	123986	123991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3107	NC_005838	CCT	2	6	123997	124002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255199
3108	NC_005838	G	6	6	124070	124075	0 %	0 %	100 %	0 %	46255199
3109	NC_005838	CCG	2	6	124129	124134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255199
3110	NC_005838	CTCG	2	8	124154	124161	0 %	25 %	25 %	50 %	46255199
3111	NC_005838	GGGTGC	2	12	124570	124581	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46255200
3112	NC_005838	GAC	2	6	124602	124607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255200
3113	NC_005838	CTC	2	6	124611	124616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255200
3114	NC_005838	AGG	2	6	124729	124734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255200
3115	NC_005838	CCT	2	6	124748	124753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255200
3116	NC_005838	TCC	2	6	124975	124980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255200
3117	NC_005838	GGC	2	6	125039	125044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255200
3118	NC_005838	GGTGCG	2	12	125072	125083	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46255200
3119	NC_005838	G	6	6	125107	125112	0 %	0 %	100 %	0 %	46255200
3120	NC_005838	ACG	2	6	125170	125175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255200
3121	NC_005838	GGT	2	6	125195	125200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255200
3122	NC_005838	AGG	2	6	125233	125238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255200
3123	NC_005838	GGT	2	6	125279	125284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255200
3124	NC_005838	C	8	8	125309	125316	0 %	0 %	0 %	100 %	46255200
3125	NC_005838	ACC	2	6	125433	125438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255200
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3131	NC_005838	GGA	2	6	125627	125632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255200
3132	NC_005838	GGT	2	6	125749	125754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255201
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3245	NC_005838	GGGGA	2	10	130358	130367	20 %	0 %	80 %	0 %	46255201
3246	NC_005838	C	6	6	130392	130397	0 %	0 %	0 %	100 %	46255201
3247	NC_005838	G	6	6	130457	130462	0 %	0 %	100 %	0 %	46255201
3248	NC_005838	TGG	2	6	130512	130517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255201
3249	NC_005838	CGGGG	2	10	130562	130571	0 %	0 %	80 %	20 %	46255201
3250	NC_005838	CGG	2	6	130572	130577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255201
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3252	NC_005838	CTCC	2	8	130684	130691	0 %	25 %	0 %	75 %	46255201
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3354	NC_005838	CTTT	2	8	136520	136527	0 %	75 %	0 %	25 %	46255205
3355	NC_005838	GGA	2	6	136567	136572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255205
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3362	NC_005838	TGG	2	6	136767	136772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255205
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3369	NC_005838	AAG	2	6	137012	137017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255205
3370	NC_005838	GC	3	6	137025	137030	0 %	0 %	50 %	50 %	46255205
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3372	NC_005838	ATG	2	6	137041	137046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255205
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