MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_005838	TCC	2	6	98647	98652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255178
2502	NC_005838	GCC	2	6	98817	98822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255178
2503	NC_005838	CTT	3	9	98828	98836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255178
2504	NC_005838	GGT	2	6	98861	98866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255178
2505	NC_005838	CCG	2	6	98900	98905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255178
2506	NC_005838	CGGG	2	8	98910	98917	0 %	0 %	75 %	25 %	46255178
2507	NC_005838	TCC	2	6	98935	98940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255178
2508	NC_005838	GGC	3	9	99017	99025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255178
2509	NC_005838	TGG	2	6	99040	99045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255178
2510	NC_005838	GGA	2	6	99046	99051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255178
2511	NC_005838	CTC	2	6	99081	99086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255178
2512	NC_005838	GGA	2	6	99142	99147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255178
2513	NC_005838	GGAG	2	8	99202	99209	25 %	0 %	75 %	0 %	46255178
2514	NC_005838	CTC	2	6	99231	99236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255178
2515	NC_005838	AGG	2	6	99280	99285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255178
2516	NC_005838	AGG	2	6	99325	99330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255178
2517	NC_005838	GCC	2	6	99342	99347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255178
2518	NC_005838	CTC	2	6	99384	99389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255178
2519	NC_005838	GGA	2	6	99446	99451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255178
2520	NC_005838	CTT	2	6	99483	99488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255178
2521	NC_005838	GAG	2	6	99501	99506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255178
2522	NC_005838	CCT	2	6	99539	99544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255178
2523	NC_005838	TCC	2	6	99550	99555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255178
2524	NC_005838	GCC	2	6	99580	99585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255178
2525	NC_005838	GGA	2	6	99628	99633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255178
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2527	NC_005838	CGCC	2	8	99692	99699	0 %	0 %	25 %	75 %	46255178
2528	NC_005838	GCC	2	6	99782	99787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255178
2529	NC_005838	CGAGCC	2	12	99888	99899	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46255179
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2531	NC_005838	CTC	2	6	99982	99987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255179
2532	NC_005838	GGCCAG	2	12	99988	99999	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255179
2533	NC_005838	CCT	3	9	100010	100018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255179
2534	NC_005838	GAG	2	6	100023	100028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255179
2535	NC_005838	GGA	2	6	100043	100048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255179
2536	NC_005838	TCC	2	6	100096	100101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255179
2537	NC_005838	ACG	2	6	100122	100127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255179
2538	NC_005838	AAGTA	2	10	100159	100168	60 %	20 %	20 %	0 %	46255179
2539	NC_005838	TTTTC	2	10	100300	100309	0 %	80 %	0 %	20 %	46255179
2540	NC_005838	CTT	2	6	101125	101130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255180
2541	NC_005838	CG	3	6	101178	101183	0 %	0 %	50 %	50 %	46255180
2542	NC_005838	GAG	2	6	101318	101323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255180
2543	NC_005838	CCG	2	6	101324	101329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255180
2544	NC_005838	GAT	2	6	101336	101341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255180
2545	NC_005838	CTT	2	6	101392	101397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255180
2546	NC_005838	GC	3	6	101557	101562	0 %	0 %	50 %	50 %	46255180
2547	NC_005838	CG	3	6	101563	101568	0 %	0 %	50 %	50 %	46255180
2548	NC_005838	CCCGGC	2	12	101695	101706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255181
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2550	NC_005838	TCT	2	6	101760	101765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255181
2551	NC_005838	GAG	2	6	101786	101791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255181
2552	NC_005838	CTT	2	6	101812	101817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255181
2553	NC_005838	CCT	2	6	101821	101826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255181
2554	NC_005838	GAA	2	6	101876	101881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255181
2555	NC_005838	GGC	3	9	101955	101963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255181
2556	NC_005838	GAG	3	9	102038	102046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255181
2557	NC_005838	GAGGCC	2	12	102056	102067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255181
2558	NC_005838	GGA	2	6	102076	102081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255181
2559	NC_005838	CCCG	2	8	102133	102140	0 %	0 %	25 %	75 %	46255181
2560	NC_005838	C	6	6	102148	102153	0 %	0 %	0 %	100 %	46255181
2561	NC_005838	GGC	2	6	102163	102168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255181
2562	NC_005838	CCGG	2	8	102177	102184	0 %	0 %	50 %	50 %	46255181
2563	NC_005838	TACTGG	2	12	102221	102232	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46255181
2564	NC_005838	G	6	6	102247	102252	0 %	0 %	100 %	0 %	46255181
2565	NC_005838	G	6	6	102313	102318	0 %	0 %	100 %	0 %	46255181
2566	NC_005838	CTGC	2	8	102325	102332	0 %	25 %	25 %	50 %	46255181
2567	NC_005838	TGG	2	6	102438	102443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255181
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2572	NC_005838	AGG	2	6	102522	102527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255181
2573	NC_005838	CCT	2	6	102610	102615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255181
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2582	NC_005838	G	7	7	102893	102899	0 %	0 %	100 %	0 %	46255181
2583	NC_005838	GAG	2	6	102917	102922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255181
2584	NC_005838	GCCCG	2	10	102983	102992	0 %	0 %	40 %	60 %	46255181
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2591	NC_005838	GGGC	2	8	103222	103229	0 %	0 %	75 %	25 %	46255181
2592	NC_005838	G	6	6	103243	103248	0 %	0 %	100 %	0 %	46255181
2593	NC_005838	C	6	6	103263	103268	0 %	0 %	0 %	100 %	46255181
2594	NC_005838	TCT	2	6	103290	103295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255181
2595	NC_005838	TGG	2	6	103416	103421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255181
2596	NC_005838	GAG	2	6	103517	103522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255181
2597	NC_005838	CCT	2	6	103586	103591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255182
2598	NC_005838	G	6	6	103620	103625	0 %	0 %	100 %	0 %	46255182
2599	NC_005838	CTC	2	6	103628	103633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255182
2600	NC_005838	G	6	6	103684	103689	0 %	0 %	100 %	0 %	46255182
2601	NC_005838	CTC	2	6	103733	103738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255182
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2604	NC_005838	GTCCC	2	10	103790	103799	0 %	20 %	20 %	60 %	46255182
2605	NC_005838	AGG	2	6	103813	103818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255182
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2607	NC_005838	GGGCC	2	10	103885	103894	0 %	0 %	60 %	40 %	46255182
2608	NC_005838	GAA	2	6	103910	103915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255182
2609	NC_005838	CCG	2	6	103921	103926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255182
2610	NC_005838	TCC	2	6	103956	103961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255182
2611	NC_005838	CTC	2	6	103988	103993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255182
2612	NC_005838	GAG	2	6	103997	104002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255182
2613	NC_005838	GTG	2	6	104089	104094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255183
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2616	NC_005838	GCGTTG	2	12	104170	104181	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	46255183
2617	NC_005838	CCG	2	6	104192	104197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255183
2618	NC_005838	CCT	2	6	104216	104221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255183
2619	NC_005838	GGA	2	6	104264	104269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255183
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2621	NC_005838	GAT	2	6	104409	104414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46255183
2622	NC_005838	CGG	3	9	104435	104443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255183
2623	NC_005838	CCT	2	6	104477	104482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255183
2624	NC_005838	CTC	2	6	104572	104577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255183
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