MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 5427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005838	TGG	2	6	217421	217426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5002	NC_005838	GGT	2	6	217428	217433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255288
5003	NC_005838	TCC	2	6	217448	217453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255288
5004	NC_005838	ACC	2	6	217519	217524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255289
5005	NC_005838	CGAGGC	2	12	217589	217600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255289
5006	NC_005838	CGG	2	6	217604	217609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5007	NC_005838	C	7	7	217643	217649	0 %	0 %	0 %	100 %	46255289
5008	NC_005838	TGGG	2	8	217680	217687	0 %	25 %	75 %	0 %	46255289
5009	NC_005838	CGG	2	6	217734	217739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5010	NC_005838	TCC	2	6	217744	217749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5011	NC_005838	G	7	7	217814	217820	0 %	0 %	100 %	0 %	46255289
5012	NC_005838	GAC	2	6	217890	217895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255289
5013	NC_005838	C	6	6	217912	217917	0 %	0 %	0 %	100 %	46255289
5014	NC_005838	TCT	2	6	217951	217956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255289
5015	NC_005838	CAC	2	6	217964	217969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255289
5016	NC_005838	CTGG	2	8	217988	217995	0 %	25 %	50 %	25 %	46255289
5017	NC_005838	CGC	2	6	218018	218023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255289
5018	NC_005838	C	6	6	218134	218139	0 %	0 %	0 %	100 %	46255289
5019	NC_005838	CTGG	2	8	218153	218160	0 %	25 %	50 %	25 %	46255289
5020	NC_005838	CTC	2	6	218175	218180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5021	NC_005838	CCT	2	6	218234	218239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5022	NC_005838	GGC	2	6	218242	218247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5023	NC_005838	GCCTCC	2	12	218275	218286	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46255289
5024	NC_005838	G	6	6	218325	218330	0 %	0 %	100 %	0 %	46255289
5025	NC_005838	GCC	2	6	218343	218348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255289
5026	NC_005838	TCC	2	6	218362	218367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5027	NC_005838	CGC	2	6	218447	218452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255289
5028	NC_005838	CGG	2	6	218457	218462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5029	NC_005838	GGA	2	6	218519	218524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255289
5030	NC_005838	CCT	2	6	218558	218563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5031	NC_005838	CTT	2	6	218585	218590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255289
5032	NC_005838	GGC	2	6	218606	218611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255289
5033	NC_005838	ACC	2	6	218659	218664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255289
5034	NC_005838	TGG	2	6	218671	218676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255289
5035	NC_005838	TCC	2	6	218737	218742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5036	NC_005838	TCC	2	6	218752	218757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5037	NC_005838	CCT	2	6	218783	218788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5038	NC_005838	ACG	2	6	218797	218802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46255289
5039	NC_005838	CCT	2	6	218828	218833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5040	NC_005838	GCC	2	6	218908	218913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255289
5041	NC_005838	TCC	2	6	218933	218938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5042	NC_005838	CCGGGC	2	12	218988	218999	0 %	0 %	50 %	50 %	46255289
5043	NC_005838	GAG	2	6	219024	219029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255289
5044	NC_005838	GCC	2	6	219076	219081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255289
5045	NC_005838	AGG	2	6	219121	219126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255289
5046	NC_005838	CCT	2	6	219134	219139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255289
5047	NC_005838	C	6	6	219165	219170	0 %	0 %	0 %	100 %	46255289
5048	NC_005838	GCGAG	2	10	219199	219208	20 %	0 %	60 %	20 %	46255289
5049	NC_005838	GAA	2	6	219265	219270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46255290
5050	NC_005838	GCG	2	6	219281	219286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5051	NC_005838	GGC	2	6	219292	219297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5052	NC_005838	CCT	2	6	219298	219303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5053	NC_005838	TCC	3	9	219315	219323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5054	NC_005838	C	6	6	219377	219382	0 %	0 %	0 %	100 %	46255290
5055	NC_005838	CGG	2	6	219424	219429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5056	NC_005838	GCCGAG	2	12	219446	219457	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46255290
5057	NC_005838	CCT	2	6	219484	219489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5058	NC_005838	GCC	2	6	219520	219525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5059	NC_005838	GAG	2	6	219539	219544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5060	NC_005838	C	6	6	219549	219554	0 %	0 %	0 %	100 %	46255290
5061	NC_005838	TCC	2	6	219594	219599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5062	NC_005838	CGC	2	6	219605	219610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5063	NC_005838	CTCGCC	2	12	219611	219622	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46255290
5064	NC_005838	GAG	2	6	219629	219634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5065	NC_005838	AGG	2	6	219675	219680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5066	NC_005838	GCGG	2	8	219691	219698	0 %	0 %	75 %	25 %	46255290
5067	NC_005838	GGC	2	6	219708	219713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5068	NC_005838	CCG	2	6	219778	219783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5069	NC_005838	G	6	6	219817	219822	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5070	NC_005838	GGA	2	6	219838	219843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5071	NC_005838	CTCC	2	8	219874	219881	0 %	25 %	0 %	75 %	46255290
5072	NC_005838	G	6	6	219890	219895	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5073	NC_005838	CCG	2	6	219918	219923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5074	NC_005838	G	6	6	219942	219947	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5075	NC_005838	AGG	2	6	219948	219953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5076	NC_005838	TGGG	2	8	219956	219963	0 %	25 %	75 %	0 %	46255290
5077	NC_005838	G	7	7	219971	219977	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5078	NC_005838	CTA	2	6	219985	219990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255290
5079	NC_005838	GGC	2	6	220012	220017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5080	NC_005838	C	6	6	220049	220054	0 %	0 %	0 %	100 %	46255290
5081	NC_005838	C	7	7	220058	220064	0 %	0 %	0 %	100 %	46255290
5082	NC_005838	GAG	2	6	220112	220117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5083	NC_005838	GGA	2	6	220120	220125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5084	NC_005838	GCGG	2	8	220162	220169	0 %	0 %	75 %	25 %	46255290
5085	NC_005838	C	6	6	220324	220329	0 %	0 %	0 %	100 %	46255290
5086	NC_005838	GAG	2	6	220334	220339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5087	NC_005838	GAGG	2	8	220345	220352	25 %	0 %	75 %	0 %	46255290
5088	NC_005838	GCC	2	6	220362	220367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5089	NC_005838	GGT	2	6	220381	220386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255290
5090	NC_005838	CGC	2	6	220411	220416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5091	NC_005838	TGG	2	6	220451	220456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255290
5092	NC_005838	G	6	6	220455	220460	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5093	NC_005838	CTGG	2	8	220501	220508	0 %	25 %	50 %	25 %	46255290
5094	NC_005838	GCCC	2	8	220519	220526	0 %	0 %	25 %	75 %	46255290
5095	NC_005838	CGC	2	6	220531	220536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5096	NC_005838	G	6	6	220539	220544	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5097	NC_005838	G	7	7	220589	220595	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5098	NC_005838	ACC	2	6	220596	220601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255290
5099	NC_005838	CCT	2	6	220624	220629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5100	NC_005838	CGC	2	6	220676	220681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5101	NC_005838	TCC	2	6	220686	220691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5102	NC_005838	GCCTGG	2	12	220727	220738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46255290
5103	NC_005838	ACC	2	6	220775	220780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255290
5104	NC_005838	CCT	2	6	220789	220794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5105	NC_005838	GGC	2	6	220891	220896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5106	NC_005838	CTT	2	6	220906	220911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255290
5107	NC_005838	CGC	2	6	220921	220926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5108	NC_005838	GAG	2	6	220964	220969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5109	NC_005838	GCG	2	6	220984	220989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5110	NC_005838	CCT	2	6	221011	221016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5111	NC_005838	CTC	2	6	221066	221071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5112	NC_005838	G	7	7	221089	221095	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5113	NC_005838	GGA	2	6	221104	221109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5114	NC_005838	TCC	2	6	221115	221120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5115	NC_005838	TGG	2	6	221136	221141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255290
5116	NC_005838	GGA	2	6	221152	221157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5117	NC_005838	AGG	2	6	221172	221177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5118	NC_005838	GGC	2	6	221192	221197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5119	NC_005838	G	6	6	221208	221213	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5120	NC_005838	C	6	6	221256	221261	0 %	0 %	0 %	100 %	46255290
5121	NC_005838	CCT	2	6	221275	221280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5122	NC_005838	GGA	2	6	221311	221316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5123	NC_005838	GGC	2	6	221318	221323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255290
5124	NC_005838	GCC	2	6	221364	221369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5125	NC_005838	GAGGGG	2	12	221381	221392	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	46255290
5126	NC_005838	CCT	2	6	221422	221427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5127	NC_005838	G	6	6	221437	221442	0 %	0 %	100 %	0 %	46255290
5128	NC_005838	CCT	2	6	221449	221454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5129	NC_005838	CTC	2	6	221522	221527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5130	NC_005838	CGC	2	6	221554	221559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255290
5131	NC_005838	GAG	2	6	221561	221566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255290
5132	NC_005838	TCC	3	9	221574	221582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255290
5133	NC_005838	C	6	6	221581	221586	0 %	0 %	0 %	100 %	46255290
5134	NC_005838	TGGAGG	2	12	221604	221615	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46255290
5135	NC_005838	G	6	6	221679	221684	0 %	0 %	100 %	0 %	46255291
5136	NC_005838	CCA	2	6	221706	221711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255291
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5138	NC_005838	ACT	2	6	221804	221809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46255291
5139	NC_005838	AGG	2	6	221813	221818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255291
5140	NC_005838	CTGG	2	8	221820	221827	0 %	25 %	50 %	25 %	46255291
5141	NC_005838	ACCT	2	8	221833	221840	25 %	25 %	0 %	50 %	46255291
5142	NC_005838	CTT	2	6	221859	221864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255291
5143	NC_005838	GCC	2	6	221990	221995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255291
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5145	NC_005838	G	6	6	222034	222039	0 %	0 %	100 %	0 %	46255291
5146	NC_005838	GAG	2	6	222070	222075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255291
5147	NC_005838	CTC	2	6	222082	222087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255291
5148	NC_005838	CACC	2	8	222093	222100	25 %	0 %	0 %	75 %	46255291
5149	NC_005838	G	6	6	222118	222123	0 %	0 %	100 %	0 %	46255291
5150	NC_005838	GGC	2	6	222125	222130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255291
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5152	NC_005838	TGG	2	6	222146	222151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255291
5153	NC_005838	GC	3	6	222178	222183	0 %	0 %	50 %	50 %	46255291
5154	NC_005838	GGCGG	2	10	222249	222258	0 %	0 %	80 %	20 %	46255291
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5157	NC_005838	CTT	2	6	222418	222423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255291
5158	NC_005838	CCCA	2	8	222466	222473	25 %	0 %	0 %	75 %	46255291
5159	NC_005838	GGA	2	6	222492	222497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255291
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5164	NC_005838	CCCA	2	8	222751	222758	25 %	0 %	0 %	75 %	46255291
5165	NC_005838	CCT	2	6	222780	222785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255291
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5185	NC_005838	C	7	7	223548	223554	0 %	0 %	0 %	100 %	46255291
5186	NC_005838	TGG	2	6	223568	223573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255291
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5193	NC_005838	CTC	2	6	223914	223919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255292
5194	NC_005838	CTC	2	6	223998	224003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255292
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5202	NC_005838	TCC	2	6	224218	224223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255292
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5230	NC_005838	GGC	2	6	225265	225270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255293
5231	NC_005838	GGA	2	6	225291	225296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255294
5232	NC_005838	CTC	2	6	225331	225336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
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5234	NC_005838	GGGCCC	2	12	225372	225383	0 %	0 %	50 %	50 %	46255294
5235	NC_005838	CCA	2	6	225408	225413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46255294
5236	NC_005838	GAG	2	6	225418	225423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255294
5237	NC_005838	CCT	2	6	225426	225431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
5238	NC_005838	AGG	2	6	225452	225457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255294
5239	NC_005838	CTT	2	6	225481	225486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46255294
5240	NC_005838	CCT	2	6	225516	225521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
5241	NC_005838	AGG	2	6	225536	225541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255294
5242	NC_005838	GGT	2	6	225543	225548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255294
5243	NC_005838	GGC	2	6	225586	225591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255294
5244	NC_005838	TCC	2	6	225599	225604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
5245	NC_005838	CCT	2	6	225615	225620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
5246	NC_005838	CTC	2	6	225658	225663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
5247	NC_005838	AGGT	2	8	225668	225675	25 %	25 %	50 %	0 %	46255294
5248	NC_005838	GTT	2	6	225730	225735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46255294
5249	NC_005838	CCT	2	6	225744	225749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
5250	NC_005838	CCT	2	6	225780	225785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
5251	NC_005838	AGG	3	9	225800	225808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255294
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5253	NC_005838	CCT	2	6	225930	225935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255294
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5360	NC_005838	CCTCTT	2	12	229844	229855	0 %	50 %	0 %	50 %	46255297
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5363	NC_005838	G	6	6	229967	229972	0 %	0 %	100 %	0 %	46255297
5364	NC_005838	GAAG	2	8	230037	230044	50 %	0 %	50 %	0 %	46255297
5365	NC_005838	C	6	6	230088	230093	0 %	0 %	0 %	100 %	46255297
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5367	NC_005838	GAG	2	6	230241	230246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255297
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5369	NC_005838	GGC	2	6	230328	230333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255298
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5373	NC_005838	CCG	2	6	230446	230451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46255298
5374	NC_005838	G	6	6	230514	230519	0 %	0 %	100 %	0 %	46255298
5375	NC_005838	CCT	2	6	230545	230550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255298
5376	NC_005838	CTTCCC	2	12	230585	230596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255298
5377	NC_005838	GGA	2	6	230665	230670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255298
5378	NC_005838	CCT	2	6	230674	230679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255298
5379	NC_005838	CTGGT	2	10	230693	230702	0 %	40 %	40 %	20 %	46255298
5380	NC_005838	CGG	2	6	230780	230785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46255298
5381	NC_005838	GCCCTG	2	12	230795	230806	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46255298
5382	NC_005838	GCGGGG	2	12	230807	230818	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	46255298
5383	NC_005838	CTC	3	9	230819	230827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255298
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5385	NC_005838	CTTCT	2	10	230885	230894	0 %	60 %	0 %	40 %	46255298
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5390	NC_005838	TGG	2	6	231050	231055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46255299
5391	NC_005838	CCT	2	6	231057	231062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255299
5392	NC_005838	CCT	2	6	231120	231125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255299
5393	NC_005838	GGA	2	6	231204	231209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46255299
5394	NC_005838	G	6	6	231226	231231	0 %	0 %	100 %	0 %	46255299
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5402	NC_005838	CCT	2	6	231561	231566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46255299
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