MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_005835	CCAC	2	8	1839329	1839336	25 %	0 %	0 %	75 %	46200232
48002	NC_005835	CGC	2	6	1839392	1839397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200232
48003	NC_005835	GGA	2	6	1839425	1839430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200232
48004	NC_005835	GC	3	6	1839462	1839467	0 %	0 %	50 %	50 %	46200232
48005	NC_005835	GCG	2	6	1839487	1839492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200232
48006	NC_005835	C	7	7	1839501	1839507	0 %	0 %	0 %	100 %	46200232
48007	NC_005835	GTC	2	6	1839510	1839515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200232
48008	NC_005835	ACC	2	6	1839610	1839615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200232
48009	NC_005835	TCC	2	6	1839640	1839645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200232
48010	NC_005835	GGGC	2	8	1839666	1839673	0 %	0 %	75 %	25 %	46200232
48011	NC_005835	TCC	2	6	1839694	1839699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200232
48012	NC_005835	CCG	2	6	1839713	1839718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200232
48013	NC_005835	CCG	2	6	1839744	1839749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200232
48014	NC_005835	CTT	2	6	1839825	1839830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200232
48015	NC_005835	ATG	2	6	1839841	1839846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200232
48016	NC_005835	G	7	7	1839861	1839867	0 %	0 %	100 %	0 %	46200232
48017	NC_005835	GAG	2	6	1839897	1839902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200232
48018	NC_005835	GCCC	2	8	1839918	1839925	0 %	0 %	25 %	75 %	46200232
48019	NC_005835	C	6	6	1839939	1839944	0 %	0 %	0 %	100 %	46200232
48020	NC_005835	GAA	2	6	1839975	1839980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200232
48021	NC_005835	CTC	3	9	1839981	1839989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200232
48022	NC_005835	CTC	3	9	1840002	1840010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200232
48023	NC_005835	CGG	2	6	1840042	1840047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200232
48024	NC_005835	GTCCCC	2	12	1840062	1840073	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46200232
48025	NC_005835	CG	3	6	1840351	1840356	0 %	0 %	50 %	50 %	46200233
48026	NC_005835	AGCC	2	8	1840357	1840364	25 %	0 %	25 %	50 %	46200233
48027	NC_005835	TGG	4	12	1840382	1840393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200233
48028	NC_005835	GTG	2	6	1840468	1840473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200233
48029	NC_005835	GAA	2	6	1840536	1840541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200233
48030	NC_005835	AAG	2	6	1840546	1840551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200233
48031	NC_005835	GTG	2	6	1840555	1840560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200233
48032	NC_005835	GAG	2	6	1840561	1840566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
48033	NC_005835	GCGG	2	8	1840572	1840579	0 %	0 %	75 %	25 %	46200233
48034	NC_005835	CCGACC	2	12	1840607	1840618	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46200233
48035	NC_005835	GGGA	2	8	1840619	1840626	25 %	0 %	75 %	0 %	46200233
48036	NC_005835	CCT	2	6	1840653	1840658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200233
48037	NC_005835	GGT	2	6	1840713	1840718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200233
48038	NC_005835	TGG	2	6	1840760	1840765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200233
48039	NC_005835	CAG	2	6	1840771	1840776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46200233
48040	NC_005835	CCT	2	6	1840797	1840802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200233
48041	NC_005835	C	6	6	1840817	1840822	0 %	0 %	0 %	100 %	46200233
48042	NC_005835	CGGC	2	8	1840856	1840863	0 %	0 %	50 %	50 %	46200233
48043	NC_005835	GTG	2	6	1840891	1840896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200233
48044	NC_005835	GAG	2	6	1840903	1840908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
48045	NC_005835	GAG	2	6	1840930	1840935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
48046	NC_005835	TCC	2	6	1840943	1840948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200233
48047	NC_005835	C	6	6	1840979	1840984	0 %	0 %	0 %	100 %	46200233
48048	NC_005835	TGG	2	6	1840985	1840990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200233
48049	NC_005835	AGG	2	6	1841042	1841047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
48050	NC_005835	CCTCG	2	10	1841058	1841067	0 %	20 %	20 %	60 %	46200233
48051	NC_005835	GAGGCC	2	12	1841068	1841079	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46200233
48052	NC_005835	GCG	2	6	1841142	1841147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200233
48053	NC_005835	C	7	7	1841153	1841159	0 %	0 %	0 %	100 %	46200233
48054	NC_005835	C	6	6	1841161	1841166	0 %	0 %	0 %	100 %	46200233
48055	NC_005835	CAC	2	6	1841169	1841174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200233
48056	NC_005835	CAG	2	6	1841185	1841190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46200233
48057	NC_005835	GCC	2	6	1841191	1841196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200233
48058	NC_005835	CCG	2	6	1841216	1841221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200233
48059	NC_005835	TCA	2	6	1841288	1841293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200233
48060	NC_005835	GGC	3	9	1841337	1841345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200233
48061	NC_005835	GAG	3	9	1841500	1841508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
48062	NC_005835	CGG	2	6	1841579	1841584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200233
48063	NC_005835	GAG	5	15	1841680	1841694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
48064	NC_005835	C	6	6	1841695	1841700	0 %	0 %	0 %	100 %	46200233
48065	NC_005835	CCCG	2	8	1841725	1841732	0 %	0 %	25 %	75 %	46200233
48066	NC_005835	GAG	2	6	1841737	1841742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
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48069	NC_005835	CCCCG	2	10	1841771	1841780	0 %	0 %	20 %	80 %	46200233
48070	NC_005835	GGA	2	6	1841811	1841816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
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48073	NC_005835	GCC	2	6	1841921	1841926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200233
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48082	NC_005835	GAC	2	6	1842325	1842330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46200233
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48086	NC_005835	GGA	2	6	1842459	1842464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
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48091	NC_005835	C	7	7	1842617	1842623	0 %	0 %	0 %	100 %	46200233
48092	NC_005835	GAG	2	6	1842634	1842639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200233
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48101	NC_005835	CCT	3	9	1842929	1842937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200234
48102	NC_005835	GTG	2	6	1842951	1842956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200234
48103	NC_005835	ACCTGC	2	12	1842976	1842987	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46200234
48104	NC_005835	G	6	6	1842991	1842996	0 %	0 %	100 %	0 %	46200234
48105	NC_005835	GGC	2	6	1842998	1843003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200234
48106	NC_005835	CTT	2	6	1843026	1843031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200234
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48108	NC_005835	CCA	2	6	1843071	1843076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200235
48109	NC_005835	C	6	6	1843086	1843091	0 %	0 %	0 %	100 %	46200235
48110	NC_005835	CAC	2	6	1843108	1843113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200235
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48116	NC_005835	GAGG	2	8	1843242	1843249	25 %	0 %	75 %	0 %	46200235
48117	NC_005835	G	7	7	1843248	1843254	0 %	0 %	100 %	0 %	46200235
48118	NC_005835	TGA	2	6	1843266	1843271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200235
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48120	NC_005835	CGG	2	6	1843410	1843415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200235
48121	NC_005835	G	6	6	1843426	1843431	0 %	0 %	100 %	0 %	46200235
48122	NC_005835	GTA	2	6	1843435	1843440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200235
48123	NC_005835	GGCGT	2	10	1843459	1843468	0 %	20 %	60 %	20 %	46200235
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48165	NC_005835	CGG	2	6	1844766	1844771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200236
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48215	NC_005835	CAG	2	6	1846318	1846323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46200238
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48230	NC_005835	CGGG	2	8	1846766	1846773	0 %	0 %	75 %	25 %	46200240
48231	NC_005835	CTC	2	6	1846787	1846792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200240
48232	NC_005835	GGCCCT	2	12	1846808	1846819	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46200240
48233	NC_005835	GGA	3	9	1846856	1846864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200240
48234	NC_005835	ACG	2	6	1846888	1846893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46200240
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48236	NC_005835	GCGG	2	8	1846997	1847004	0 %	0 %	75 %	25 %	46200240
48237	NC_005835	C	6	6	1847032	1847037	0 %	0 %	0 %	100 %	46200240
48238	NC_005835	CAC	2	6	1847040	1847045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200240
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48480	NC_005835	TGC	2	6	1854945	1854950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200249
48481	NC_005835	CGGG	2	8	1855114	1855121	0 %	0 %	75 %	25 %	46200250
48482	NC_005835	GAG	2	6	1855124	1855129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200250
48483	NC_005835	CGC	2	6	1855135	1855140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200250
48484	NC_005835	TCC	2	6	1855278	1855283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200250
48485	NC_005835	CCT	2	6	1855330	1855335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200250
48486	NC_005835	CGG	2	6	1855341	1855346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200250
48487	NC_005835	CCT	2	6	1855351	1855356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200250
48488	NC_005835	GGA	2	6	1855360	1855365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200250
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48490	NC_005835	C	7	7	1855394	1855400	0 %	0 %	0 %	100 %	46200250
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48492	NC_005835	GGA	2	6	1855453	1855458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200250
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