MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_005835	CAGGGC	2	12	1818459	1818470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46200211
47502	NC_005835	C	6	6	1818517	1818522	0 %	0 %	0 %	100 %	46200211
47503	NC_005835	C	6	6	1818544	1818549	0 %	0 %	0 %	100 %	46200211
47504	NC_005835	AGG	2	6	1818583	1818588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47505	NC_005835	GAA	2	6	1818594	1818599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200211
47506	NC_005835	GCC	2	6	1818649	1818654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200211
47507	NC_005835	GCTG	2	8	1818671	1818678	0 %	25 %	50 %	25 %	46200211
47508	NC_005835	TGG	2	6	1818680	1818685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200211
47509	NC_005835	CGA	2	6	1818692	1818697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46200211
47510	NC_005835	GAG	2	6	1818750	1818755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47511	NC_005835	GGA	2	6	1818788	1818793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47512	NC_005835	AGGA	2	8	1818802	1818809	50 %	0 %	50 %	0 %	46200211
47513	NC_005835	TGG	2	6	1818845	1818850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200211
47514	NC_005835	GGCC	2	8	1818881	1818888	0 %	0 %	50 %	50 %	46200211
47515	NC_005835	GAG	2	6	1818972	1818977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47516	NC_005835	TTC	2	6	1818985	1818990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200211
47517	NC_005835	CCT	2	6	1819007	1819012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200211
47518	NC_005835	GAG	2	6	1819155	1819160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47519	NC_005835	CAT	2	6	1819233	1819238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200211
47520	NC_005835	GAA	2	6	1819263	1819268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200211
47521	NC_005835	C	8	8	1819286	1819293	0 %	0 %	0 %	100 %	46200211
47522	NC_005835	GAG	2	6	1819344	1819349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47523	NC_005835	AGG	2	6	1819375	1819380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47524	NC_005835	GAG	2	6	1819431	1819436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47525	NC_005835	GCCCC	2	10	1819439	1819448	0 %	0 %	20 %	80 %	46200211
47526	NC_005835	AGG	2	6	1819450	1819455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47527	NC_005835	AGG	2	6	1819457	1819462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47528	NC_005835	GAG	2	6	1819527	1819532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200211
47529	NC_005835	CAA	2	6	1819542	1819547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46200211
47530	NC_005835	GTC	2	6	1819601	1819606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200212
47531	NC_005835	GAGGCC	2	12	1819646	1819657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46200212
47532	NC_005835	CGG	3	9	1819669	1819677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200212
47533	NC_005835	GGC	2	6	1819697	1819702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200212
47534	NC_005835	CCA	2	6	1819738	1819743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200212
47535	NC_005835	GGC	2	6	1819754	1819759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200212
47536	NC_005835	AGG	2	6	1819839	1819844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200212
47537	NC_005835	AGG	2	6	1819854	1819859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200212
47538	NC_005835	CAC	2	6	1819870	1819875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200213
47539	NC_005835	TCC	2	6	1819883	1819888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200213
47540	NC_005835	CTC	2	6	1819894	1819899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200213
47541	NC_005835	GCCACC	2	12	1819940	1819951	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	46200213
47542	NC_005835	GCC	2	6	1819958	1819963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200213
47543	NC_005835	GAG	2	6	1819966	1819971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200213
47544	NC_005835	AGG	2	6	1820012	1820017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200213
47545	NC_005835	GCCC	2	8	1820037	1820044	0 %	0 %	25 %	75 %	46200213
47546	NC_005835	GCG	2	6	1820123	1820128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200213
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47548	NC_005835	ATG	2	6	1820189	1820194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200213
47549	NC_005835	GAAGAG	2	12	1820197	1820208	50 %	0 %	50 %	0 %	46200213
47550	NC_005835	CAGGGC	2	12	1820308	1820319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46200213
47551	NC_005835	CAC	2	6	1820344	1820349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200213
47552	NC_005835	AGG	4	12	1820363	1820374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200213
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47554	NC_005835	C	6	6	1820409	1820414	0 %	0 %	0 %	100 %	46200214
47555	NC_005835	CAC	2	6	1820460	1820465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200214
47556	NC_005835	CAC	2	6	1820526	1820531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200214
47557	NC_005835	CCA	2	6	1820534	1820539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200214
47558	NC_005835	TCC	2	6	1820545	1820550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200214
47559	NC_005835	CCT	2	6	1820630	1820635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200214
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47571	NC_005835	GAA	2	6	1821185	1821190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200215
47572	NC_005835	GCC	2	6	1821245	1821250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200215
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47577	NC_005835	GAG	2	6	1821515	1821520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200215
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47589	NC_005835	GAAGGC	2	12	1821953	1821964	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46200215
47590	NC_005835	GAG	2	6	1821968	1821973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200215
47591	NC_005835	CAC	3	9	1821977	1821985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200215
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47599	NC_005835	AG	3	6	1822360	1822365	50 %	0 %	50 %	0 %	46200216
47600	NC_005835	G	6	6	1822432	1822437	0 %	0 %	100 %	0 %	46200216
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47602	NC_005835	GGGGC	2	10	1822508	1822517	0 %	0 %	80 %	20 %	46200216
47603	NC_005835	GGA	2	6	1822524	1822529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200216
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47618	NC_005835	G	6	6	1823019	1823024	0 %	0 %	100 %	0 %	46200216
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