MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_005835	TCT	2	6	1659565	1659570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200050
43502	NC_005835	CCT	2	6	1659593	1659598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200050
43503	NC_005835	TCC	2	6	1659601	1659606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200050
43504	NC_005835	GCG	2	6	1659719	1659724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200051
43505	NC_005835	AGG	2	6	1659775	1659780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200051
43506	NC_005835	CAC	2	6	1659848	1659853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200051
43507	NC_005835	AGGG	2	8	1659897	1659904	25 %	0 %	75 %	0 %	46200051
43508	NC_005835	ACCT	2	8	1659984	1659991	25 %	25 %	0 %	50 %	46200051
43509	NC_005835	G	7	7	1660052	1660058	0 %	0 %	100 %	0 %	46200051
43510	NC_005835	GAG	2	6	1660062	1660067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200051
43511	NC_005835	AAG	2	6	1660104	1660109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200051
43512	NC_005835	GGGGC	2	10	1660131	1660140	0 %	0 %	80 %	20 %	46200051
43513	NC_005835	CAA	2	6	1660157	1660162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46200051
43514	NC_005835	CTC	2	6	1660167	1660172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200051
43515	NC_005835	GCG	2	6	1660188	1660193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200051
43516	NC_005835	TCA	2	6	1660252	1660257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200051
43517	NC_005835	CCT	2	6	1660261	1660266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200051
43518	NC_005835	CTC	2	6	1660410	1660415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200051
43519	NC_005835	CAGG	2	8	1660607	1660614	25 %	0 %	50 %	25 %	46200052
43520	NC_005835	GAG	2	6	1660675	1660680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200052
43521	NC_005835	CCT	2	6	1660689	1660694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200052
43522	NC_005835	CCT	2	6	1660757	1660762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200052
43523	NC_005835	G	6	6	1660791	1660796	0 %	0 %	100 %	0 %	46200052
43524	NC_005835	ACCT	2	8	1660870	1660877	25 %	25 %	0 %	50 %	46200052
43525	NC_005835	CTC	2	6	1660945	1660950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200052
43526	NC_005835	AGA	2	6	1660962	1660967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200052
43527	NC_005835	CCT	3	9	1660995	1661003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200052
43528	NC_005835	C	6	6	1661057	1661062	0 %	0 %	0 %	100 %	46200052
43529	NC_005835	CG	3	6	1661076	1661081	0 %	0 %	50 %	50 %	46200052
43530	NC_005835	CTC	2	6	1661155	1661160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200052
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43532	NC_005835	GGA	2	6	1661400	1661405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200052
43533	NC_005835	GCCA	2	8	1661434	1661441	25 %	0 %	25 %	50 %	46200052
43534	NC_005835	CTT	2	6	1661460	1661465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200052
43535	NC_005835	TGGCGG	2	12	1661504	1661515	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	46200052
43536	NC_005835	CAC	2	6	1661535	1661540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200052
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43538	NC_005835	CAC	2	6	1661572	1661577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200052
43539	NC_005835	GGA	2	6	1661604	1661609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200052
43540	NC_005835	GAG	2	6	1661680	1661685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200052
43541	NC_005835	T	6	6	1661802	1661807	0 %	100 %	0 %	0 %	46200052
43542	NC_005835	CAC	3	9	1661842	1661850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200052
43543	NC_005835	GTTT	2	8	1661852	1661859	0 %	75 %	25 %	0 %	46200052
43544	NC_005835	CACC	2	8	1661892	1661899	25 %	0 %	0 %	75 %	46200052
43545	NC_005835	TCC	2	6	1661903	1661908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200052
43546	NC_005835	GAG	2	6	1661910	1661915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200052
43547	NC_005835	CGTGGC	2	12	1661972	1661983	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46200053
43548	NC_005835	CT	3	6	1662038	1662043	0 %	50 %	0 %	50 %	46200053
43549	NC_005835	GCCA	2	8	1662060	1662067	25 %	0 %	25 %	50 %	46200053
43550	NC_005835	TGG	2	6	1662076	1662081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200053
43551	NC_005835	TTG	2	6	1662108	1662113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46200053
43552	NC_005835	CTT	2	6	1662203	1662208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200053
43553	NC_005835	TCC	2	6	1662415	1662420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200053
43554	NC_005835	GAA	2	6	1662437	1662442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200053
43555	NC_005835	CTG	2	6	1662453	1662458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200053
43556	NC_005835	GCGG	2	8	1662459	1662466	0 %	0 %	75 %	25 %	46200053
43557	NC_005835	CCT	2	6	1662485	1662490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200053
43558	NC_005835	AGG	2	6	1662558	1662563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200053
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43560	NC_005835	TCC	2	6	1662609	1662614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200054
43561	NC_005835	GGCG	2	8	1662627	1662634	0 %	0 %	75 %	25 %	46200054
43562	NC_005835	GGGC	2	8	1662648	1662655	0 %	0 %	75 %	25 %	46200054
43563	NC_005835	TGG	3	9	1662672	1662680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200054
43564	NC_005835	GCCC	2	8	1662705	1662712	0 %	0 %	25 %	75 %	46200054
43565	NC_005835	C	6	6	1662710	1662715	0 %	0 %	0 %	100 %	46200054
43566	NC_005835	GGGGC	2	10	1662806	1662815	0 %	0 %	80 %	20 %	46200054
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43570	NC_005835	GATG	2	8	1662918	1662925	25 %	25 %	50 %	0 %	46200055
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43572	NC_005835	GAG	3	9	1663021	1663029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200055
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43576	NC_005835	GCTTC	2	10	1663143	1663152	0 %	40 %	20 %	40 %	46200055
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43591	NC_005835	GC	3	6	1663577	1663582	0 %	0 %	50 %	50 %	46200055
43592	NC_005835	AGG	2	6	1663586	1663591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200055
43593	NC_005835	GCG	2	6	1663592	1663597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200055
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43601	NC_005835	GAG	2	6	1663900	1663905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200055
43602	NC_005835	GAG	2	6	1663924	1663929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200055
43603	NC_005835	CAC	2	6	1663957	1663962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200055
43604	NC_005835	GCC	2	6	1663975	1663980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200055
43605	NC_005835	GGT	2	6	1664040	1664045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200055
43606	NC_005835	CGG	2	6	1664055	1664060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200055
43607	NC_005835	GGA	2	6	1664064	1664069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200055
43608	NC_005835	TGG	2	6	1664076	1664081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200055
43609	NC_005835	C	8	8	1664106	1664113	0 %	0 %	0 %	100 %	46200055
43610	NC_005835	CTCG	2	8	1664116	1664123	0 %	25 %	25 %	50 %	46200055
43611	NC_005835	GGC	2	6	1664155	1664160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200055
43612	NC_005835	GGC	2	6	1664167	1664172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200055
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43614	NC_005835	TGA	2	6	1664275	1664280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200056
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43618	NC_005835	GGAGAG	2	12	1664333	1664344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200056
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43620	NC_005835	GAT	2	6	1664441	1664446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200056
43621	NC_005835	TGGTGA	2	12	1664482	1664493	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	46200056
43622	NC_005835	CCT	2	6	1664509	1664514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200056
43623	NC_005835	GGC	2	6	1664524	1664529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200056
43624	NC_005835	CAC	2	6	1664603	1664608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200056
43625	NC_005835	GTA	2	6	1664654	1664659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200056
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43627	NC_005835	CAC	2	6	1664732	1664737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200056
43628	NC_005835	AGGT	2	8	1664757	1664764	25 %	25 %	50 %	0 %	46200056
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43631	NC_005835	GGGCG	2	10	1664951	1664960	0 %	0 %	80 %	20 %	46200056
43632	NC_005835	GGGCGG	2	12	1664966	1664977	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	46200056
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43634	NC_005835	TCC	2	6	1665031	1665036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200056
43635	NC_005835	TCC	2	6	1665057	1665062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200056
43636	NC_005835	CCT	2	6	1665097	1665102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200056
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43640	NC_005835	TCC	2	6	1665261	1665266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200056
43641	NC_005835	CTC	2	6	1665299	1665304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200056
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43649	NC_005835	CCT	2	6	1665856	1665861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200057
43650	NC_005835	GAT	2	6	1665881	1665886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200057
43651	NC_005835	ATC	2	6	1665930	1665935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200057
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43653	NC_005835	TC	3	6	1665955	1665960	0 %	50 %	0 %	50 %	46200057
43654	NC_005835	CTT	2	6	1666006	1666011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46200057
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43736	NC_005835	GAG	2	6	1668718	1668723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200061
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43854	NC_005835	TCC	2	6	1673016	1673021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200066
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