MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_005835	GTC	2	6	1637656	1637661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200023
43003	NC_005835	CCA	2	6	1637673	1637678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200023
43004	NC_005835	CGCTCC	2	12	1637690	1637701	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46200023
43005	NC_005835	TCC	2	6	1637750	1637755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200023
43006	NC_005835	CCT	2	6	1637769	1637774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200023
43007	NC_005835	GGC	2	6	1637776	1637781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200023
43008	NC_005835	GCG	2	6	1637786	1637791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200023
43009	NC_005835	GGA	2	6	1637823	1637828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200023
43010	NC_005835	C	7	7	1637898	1637904	0 %	0 %	0 %	100 %	46200023
43011	NC_005835	GAG	2	6	1637911	1637916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200023
43012	NC_005835	AGG	2	6	1637954	1637959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200023
43013	NC_005835	GCG	2	6	1637960	1637965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200023
43014	NC_005835	GCG	2	6	1637968	1637973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200023
43015	NC_005835	CGC	2	6	1638008	1638013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200023
43016	NC_005835	TCC	2	6	1638014	1638019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200023
43017	NC_005835	GAG	2	6	1638112	1638117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200023
43018	NC_005835	C	6	6	1638127	1638132	0 %	0 %	0 %	100 %	46200023
43019	NC_005835	CCT	3	9	1638198	1638206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200023
43020	NC_005835	C	7	7	1638246	1638252	0 %	0 %	0 %	100 %	46200023
43021	NC_005835	AGG	3	9	1638272	1638280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200023
43022	NC_005835	CCA	2	6	1638306	1638311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200023
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43025	NC_005835	CGG	2	6	1638408	1638413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200024
43026	NC_005835	GAAG	2	8	1638424	1638431	50 %	0 %	50 %	0 %	46200024
43027	NC_005835	AGG	2	6	1638432	1638437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43028	NC_005835	GAG	4	12	1638440	1638451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
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43030	NC_005835	CCA	2	6	1638559	1638564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200024
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43032	NC_005835	GCCCC	2	10	1638631	1638640	0 %	0 %	20 %	80 %	46200024
43033	NC_005835	CAGGGC	2	12	1638656	1638667	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	46200024
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43035	NC_005835	AGGC	2	8	1638716	1638723	25 %	0 %	50 %	25 %	46200024
43036	NC_005835	GAG	2	6	1638731	1638736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43037	NC_005835	GAG	2	6	1638848	1638853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43038	NC_005835	GAG	4	12	1638923	1638934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43039	NC_005835	GGA	2	6	1639003	1639008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43040	NC_005835	AGG	2	6	1639032	1639037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43041	NC_005835	GAA	2	6	1639052	1639057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200024
43042	NC_005835	GAG	2	6	1639067	1639072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43043	NC_005835	GCCCC	2	10	1639090	1639099	0 %	0 %	20 %	80 %	46200024
43044	NC_005835	GGGC	2	8	1639102	1639109	0 %	0 %	75 %	25 %	46200024
43045	NC_005835	GCC	2	6	1639134	1639139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200024
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43052	NC_005835	CGC	2	6	1639334	1639339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200024
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43054	NC_005835	AGG	2	6	1639410	1639415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43055	NC_005835	AGG	2	6	1639548	1639553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200024
43056	NC_005835	GCTTGG	2	12	1639618	1639629	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	46200025
43057	NC_005835	TCC	2	6	1639653	1639658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200025
43058	NC_005835	TGT	2	6	1639717	1639722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46200025
43059	NC_005835	TGACGA	2	12	1639726	1639737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46200025
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43062	NC_005835	CTG	3	9	1639871	1639879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46200025
43063	NC_005835	GCC	2	6	1639880	1639885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200025
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43101	NC_005835	CGG	2	6	1641793	1641798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200027
43102	NC_005835	GCG	2	6	1641837	1641842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200027
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43113	NC_005835	ACC	2	6	1642107	1642112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46200027
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43116	NC_005835	G	6	6	1642297	1642302	0 %	0 %	100 %	0 %	46200027
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43122	NC_005835	AGG	2	6	1642422	1642427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200027
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43225	NC_005835	TGA	2	6	1646498	1646503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200031
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43228	NC_005835	GCGGA	2	10	1646566	1646575	20 %	0 %	60 %	20 %	46200031
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43232	NC_005835	G	6	6	1646660	1646665	0 %	0 %	100 %	0 %	46200031
43233	NC_005835	GGC	2	6	1646679	1646684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200031
43234	NC_005835	CGG	2	6	1646787	1646792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200031
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43343	NC_005835	GGC	2	6	1652358	1652363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200040
43344	NC_005835	CCGG	2	8	1652390	1652397	0 %	0 %	50 %	50 %	46200040
43345	NC_005835	AGA	2	6	1652447	1652452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200040
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43352	NC_005835	GCC	2	6	1652630	1652635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200041
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43355	NC_005835	GAG	2	6	1652816	1652821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200041
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43460	NC_005835	TCCT	2	8	1657485	1657492	0 %	50 %	0 %	50 %	46200047
43461	NC_005835	TGG	2	6	1657687	1657692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200048
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43464	NC_005835	CTC	3	9	1657782	1657790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200048
43465	NC_005835	TCA	2	6	1657807	1657812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46200048
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43468	NC_005835	GAG	2	6	1657995	1658000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200048
43469	NC_005835	ACCCC	2	10	1658041	1658050	20 %	0 %	0 %	80 %	46200048
43470	NC_005835	TGGG	2	8	1658067	1658074	0 %	25 %	75 %	0 %	46200048
43471	NC_005835	GGA	2	6	1658075	1658080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200048
43472	NC_005835	AGG	2	6	1658110	1658115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200048
43473	NC_005835	GGA	2	6	1658246	1658251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200048
43474	NC_005835	GTG	2	6	1658265	1658270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200048
43475	NC_005835	CTC	2	6	1658347	1658352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46200049
43476	NC_005835	GGT	2	6	1658382	1658387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46200049
43477	NC_005835	GGCCC	2	10	1658406	1658415	0 %	0 %	40 %	60 %	46200049
43478	NC_005835	AGG	2	6	1658528	1658533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200049
43479	NC_005835	TGA	2	6	1658582	1658587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46200049
43480	NC_005835	GGA	2	6	1658664	1658669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200049
43481	NC_005835	AGG	2	6	1658674	1658679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46200049
43482	NC_005835	GGC	2	6	1658755	1658760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46200049
43483	NC_005835	CGC	2	6	1658772	1658777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200049
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43485	NC_005835	CGC	2	6	1658874	1658879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200049
43486	NC_005835	GCC	2	6	1658918	1658923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46200049
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43488	NC_005835	AAG	2	6	1658989	1658994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46200049
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