MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_005835	TGGCCA	2	12	810826	810837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46199134
21502	NC_005835	GGA	2	6	810884	810889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199134
21503	NC_005835	CTC	2	6	810924	810929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199134
21504	NC_005835	GGA	2	6	810995	811000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199134
21505	NC_005835	ACC	2	6	811020	811025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199134
21506	NC_005835	CGG	2	6	811052	811057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199134
21507	NC_005835	GCG	2	6	811064	811069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199134
21508	NC_005835	TAC	2	6	811140	811145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46199134
21509	NC_005835	CCT	2	6	811253	811258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199134
21510	NC_005835	CCA	2	6	811381	811386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199134
21511	NC_005835	GCCC	2	8	811406	811413	0 %	0 %	25 %	75 %	46199134
21512	NC_005835	TCC	2	6	811489	811494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199134
21513	NC_005835	CCGC	2	8	811528	811535	0 %	0 %	25 %	75 %	46199134
21514	NC_005835	G	6	6	811565	811570	0 %	0 %	100 %	0 %	46199134
21515	NC_005835	CCG	2	6	811582	811587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199134
21516	NC_005835	TCG	2	6	811669	811674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46199134
21517	NC_005835	TGG	2	6	811675	811680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199134
21518	NC_005835	T	6	6	811683	811688	0 %	100 %	0 %	0 %	46199134
21519	NC_005835	CGG	2	6	811694	811699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199134
21520	NC_005835	GCC	2	6	811743	811748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199134
21521	NC_005835	TGGAGG	2	12	811871	811882	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46199135
21522	NC_005835	CTC	2	6	811918	811923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199135
21523	NC_005835	C	6	6	811950	811955	0 %	0 %	0 %	100 %	46199135
21524	NC_005835	GTG	2	6	811966	811971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199135
21525	NC_005835	TGG	2	6	811982	811987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199135
21526	NC_005835	CCGGG	2	10	812001	812010	0 %	0 %	60 %	40 %	46199135
21527	NC_005835	GTC	2	6	812038	812043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46199135
21528	NC_005835	GGT	2	6	812070	812075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199135
21529	NC_005835	GGCG	2	8	812076	812083	0 %	0 %	75 %	25 %	46199135
21530	NC_005835	GTG	2	6	812095	812100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199135
21531	NC_005835	GCC	2	6	812102	812107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199135
21532	NC_005835	TGGGCC	2	12	812111	812122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46199135
21533	NC_005835	GAG	2	6	812144	812149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199135
21534	NC_005835	GGA	2	6	812218	812223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199136
21535	NC_005835	GGT	2	6	812248	812253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199136
21536	NC_005835	GTG	2	6	812276	812281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199136
21537	NC_005835	GGA	2	6	812292	812297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199136
21538	NC_005835	GGGGT	2	10	812423	812432	0 %	20 %	80 %	0 %	46199137
21539	NC_005835	TCCC	2	8	812443	812450	0 %	25 %	0 %	75 %	46199137
21540	NC_005835	C	6	6	812560	812565	0 %	0 %	0 %	100 %	46199137
21541	NC_005835	GC	3	6	812571	812576	0 %	0 %	50 %	50 %	46199137
21542	NC_005835	GCG	2	6	812610	812615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199137
21543	NC_005835	AGG	2	6	812616	812621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199137
21544	NC_005835	AGG	3	9	812634	812642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199137
21545	NC_005835	TAG	2	6	812643	812648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46199137
21546	NC_005835	C	6	6	812650	812655	0 %	0 %	0 %	100 %	46199137
21547	NC_005835	C	6	6	812669	812674	0 %	0 %	0 %	100 %	46199137
21548	NC_005835	AGA	2	6	812713	812718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46199137
21549	NC_005835	GGC	2	6	812729	812734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199137
21550	NC_005835	GGT	2	6	812761	812766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199137
21551	NC_005835	CCG	2	6	812783	812788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199137
21552	NC_005835	CAC	3	9	812804	812812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199137
21553	NC_005835	AGC	2	6	812856	812861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46199137
21554	NC_005835	TCC	2	6	812873	812878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199138
21555	NC_005835	CCT	2	6	812904	812909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199138
21556	NC_005835	CAC	2	6	812965	812970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199138
21557	NC_005835	TCCCGC	2	12	813008	813019	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46199138
21558	NC_005835	G	6	6	813023	813028	0 %	0 %	100 %	0 %	46199138
21559	NC_005835	G	6	6	813082	813087	0 %	0 %	100 %	0 %	46199138
21560	NC_005835	ACC	2	6	813153	813158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199139
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21562	NC_005835	CAC	2	6	813296	813301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199139
21563	NC_005835	TCC	2	6	813321	813326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199139
21564	NC_005835	CCCG	2	8	813328	813335	0 %	0 %	25 %	75 %	46199139
21565	NC_005835	C	6	6	813350	813355	0 %	0 %	0 %	100 %	46199139
21566	NC_005835	CGC	2	6	813420	813425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199139
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21571	NC_005835	CCCG	2	8	813550	813557	0 %	0 %	25 %	75 %	46199139
21572	NC_005835	CGGA	2	8	813564	813571	25 %	0 %	50 %	25 %	46199139
21573	NC_005835	ACC	2	6	813573	813578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199139
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21576	NC_005835	CGGGC	2	10	813679	813688	0 %	0 %	60 %	40 %	46199139
21577	NC_005835	GAG	2	6	813698	813703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199139
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21580	NC_005835	TTG	2	6	813838	813843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46199140
21581	NC_005835	TCT	3	9	813904	813912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46199140
21582	NC_005835	CG	3	6	813914	813919	0 %	0 %	50 %	50 %	46199140
21583	NC_005835	AAGC	2	8	813922	813929	50 %	0 %	25 %	25 %	46199140
21584	NC_005835	AGT	3	9	813935	813943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46199140
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21588	NC_005835	CAGGCC	2	12	814131	814142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46199140
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21590	NC_005835	GTA	2	6	814228	814233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46199140
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21592	NC_005835	ACCCC	2	10	814280	814289	20 %	0 %	0 %	80 %	46199140
21593	NC_005835	CCA	2	6	814331	814336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199140
21594	NC_005835	GCC	2	6	814356	814361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199140
21595	NC_005835	GCC	2	6	814429	814434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199140
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21599	NC_005835	TGGCC	2	10	814640	814649	0 %	20 %	40 %	40 %	46199141
21600	NC_005835	CCT	2	6	814652	814657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199141
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21602	NC_005835	GGC	2	6	814755	814760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199141
21603	NC_005835	TCC	2	6	814766	814771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199141
21604	NC_005835	CGC	2	6	814833	814838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199141
21605	NC_005835	CCG	2	6	814839	814844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199141
21606	NC_005835	TCC	2	6	814852	814857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199141
21607	NC_005835	GCC	2	6	814861	814866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199141
21608	NC_005835	CAC	2	6	814869	814874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199141
21609	NC_005835	CAC	2	6	814878	814883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199141
21610	NC_005835	TGG	2	6	814892	814897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199141
21611	NC_005835	AAG	2	6	814960	814965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46199141
21612	NC_005835	GAG	2	6	815004	815009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199141
21613	NC_005835	TGG	2	6	815021	815026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199141
21614	NC_005835	CCA	2	6	815066	815071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199141
21615	NC_005835	CGC	2	6	815074	815079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199141
21616	NC_005835	CCT	2	6	815096	815101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199141
21617	NC_005835	TGG	2	6	815138	815143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199141
21618	NC_005835	CCTCGG	2	12	815204	815215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	46199141
21619	NC_005835	GTG	2	6	815236	815241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199141
21620	NC_005835	CCT	2	6	815357	815362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199141
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21622	NC_005835	GTC	2	6	815409	815414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46199141
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21991	NC_005835	CCT	2	6	829802	829807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199156
21992	NC_005835	CCA	2	6	829856	829861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199156
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