MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 49462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_005835	TC	3	6	680496	680501	0 %	50 %	0 %	50 %	46199004
18002	NC_005835	GCC	2	6	680540	680545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199004
18003	NC_005835	CTC	2	6	680575	680580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199004
18004	NC_005835	GAA	2	6	680605	680610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46199004
18005	NC_005835	AGG	2	6	680636	680641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199004
18006	NC_005835	C	7	7	680645	680651	0 %	0 %	0 %	100 %	46199004
18007	NC_005835	GGA	2	6	680655	680660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199004
18008	NC_005835	ACC	2	6	680717	680722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199004
18009	NC_005835	CTC	2	6	680752	680757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199004
18010	NC_005835	GCGG	2	8	680785	680792	0 %	0 %	75 %	25 %	46199004
18011	NC_005835	CAC	2	6	680809	680814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199004
18012	NC_005835	CGG	2	6	680829	680834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199004
18013	NC_005835	CCACCT	2	12	680838	680849	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	46199004
18014	NC_005835	CCG	2	6	680850	680855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199004
18015	NC_005835	CCG	2	6	680892	680897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199004
18016	NC_005835	TCC	2	6	680934	680939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199004
18017	NC_005835	C	7	7	680967	680973	0 %	0 %	0 %	100 %	46199004
18018	NC_005835	CAC	2	6	681022	681027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199004
18019	NC_005835	CCCCAC	2	12	681028	681039	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	46199004
18020	NC_005835	G	6	6	681065	681070	0 %	0 %	100 %	0 %	46199004
18021	NC_005835	CCT	2	6	681195	681200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199004
18022	NC_005835	GTCC	2	8	681217	681224	0 %	25 %	25 %	50 %	46199004
18023	NC_005835	GGC	2	6	681268	681273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199004
18024	NC_005835	AGG	2	6	681362	681367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199004
18025	NC_005835	ACC	2	6	681371	681376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199004
18026	NC_005835	GAG	3	9	681412	681420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199004
18027	NC_005835	AGG	2	6	681425	681430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199004
18028	NC_005835	ATCC	2	8	681505	681512	25 %	25 %	0 %	50 %	46199005
18029	NC_005835	CTT	2	6	681529	681534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46199005
18030	NC_005835	GTT	2	6	681637	681642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46199005
18031	NC_005835	GAG	2	6	681646	681651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199005
18032	NC_005835	GGT	2	6	681771	681776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199005
18033	NC_005835	CCT	2	6	681813	681818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199005
18034	NC_005835	CTC	2	6	681847	681852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199005
18035	NC_005835	CTC	2	6	681958	681963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199005
18036	NC_005835	GGC	2	6	681988	681993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199005
18037	NC_005835	CTC	2	6	681997	682002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199005
18038	NC_005835	GCCTCC	2	12	682064	682075	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	46199005
18039	NC_005835	CGC	2	6	682076	682081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199005
18040	NC_005835	CCT	2	6	682150	682155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199005
18041	NC_005835	TCC	2	6	682196	682201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199005
18042	NC_005835	CGGCG	2	10	682278	682287	0 %	0 %	60 %	40 %	46199005
18043	NC_005835	C	7	7	682293	682299	0 %	0 %	0 %	100 %	46199005
18044	NC_005835	CCA	2	6	682308	682313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199005
18045	NC_005835	GCG	2	6	682333	682338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199005
18046	NC_005835	GAG	2	6	682369	682374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199005
18047	NC_005835	TGG	2	6	682380	682385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199005
18048	NC_005835	CCGC	2	8	682386	682393	0 %	0 %	25 %	75 %	46199005
18049	NC_005835	GTC	2	6	682415	682420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46199005
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18053	NC_005835	CCG	2	6	682587	682592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199005
18054	NC_005835	TCG	2	6	682625	682630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46199005
18055	NC_005835	CCA	2	6	682632	682637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199005
18056	NC_005835	CTC	2	6	682663	682668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199005
18057	NC_005835	G	7	7	682917	682923	0 %	0 %	100 %	0 %	46199006
18058	NC_005835	C	6	6	683007	683012	0 %	0 %	0 %	100 %	46199006
18059	NC_005835	C	7	7	683118	683124	0 %	0 %	0 %	100 %	46199006
18060	NC_005835	TCC	2	6	683125	683130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199006
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18063	NC_005835	CCACGG	2	12	683159	683170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	46199006
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18065	NC_005835	GCGG	2	8	683202	683209	0 %	0 %	75 %	25 %	46199006
18066	NC_005835	GGA	2	6	683222	683227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199006
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18069	NC_005835	AAGGCG	2	12	683343	683354	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	46199007
18070	NC_005835	CTCCC	2	10	683401	683410	0 %	20 %	0 %	80 %	46199007
18071	NC_005835	G	6	6	683420	683425	0 %	0 %	100 %	0 %	46199007
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18074	NC_005835	CTC	2	6	683517	683522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199007
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18080	NC_005835	CGGG	2	8	683656	683663	0 %	0 %	75 %	25 %	46199007
18081	NC_005835	G	6	6	683700	683705	0 %	0 %	100 %	0 %	46199007
18082	NC_005835	CCTCG	2	10	683709	683718	0 %	20 %	20 %	60 %	46199007
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18093	NC_005835	GAA	2	6	684000	684005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46199007
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18095	NC_005835	C	8	8	684059	684066	0 %	0 %	0 %	100 %	46199007
18096	NC_005835	C	7	7	684084	684090	0 %	0 %	0 %	100 %	46199007
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18102	NC_005835	CCCG	2	8	684274	684281	0 %	0 %	25 %	75 %	46199007
18103	NC_005835	CCA	2	6	684332	684337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199007
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18110	NC_005835	GGC	2	6	684850	684855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199008
18111	NC_005835	CTC	2	6	684893	684898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199008
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18124	NC_005835	GGT	2	6	685340	685345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46199008
18125	NC_005835	GAG	2	6	685403	685408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199008
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18127	NC_005835	G	6	6	685474	685479	0 %	0 %	100 %	0 %	46199008
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18236	NC_005835	CGC	3	9	689699	689707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161611245
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18239	NC_005835	GGA	2	6	689771	689776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161611245
18240	NC_005835	TCC	2	6	689779	689784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161611245
18241	NC_005835	CGAGGC	2	12	689786	689797	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	161611245
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18244	NC_005835	GCA	2	6	689909	689914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161611245
18245	NC_005835	GAG	2	6	690021	690026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161611245
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18351	NC_005835	CCG	2	6	693750	693755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199014
18352	NC_005835	GCC	2	6	693768	693773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199014
18353	NC_005835	GCCC	2	8	693922	693929	0 %	0 %	25 %	75 %	46199014
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18362	NC_005835	CCT	2	6	694165	694170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199015
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18487	NC_005835	CGC	2	6	699116	699121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199022
18488	NC_005835	CAC	2	6	699134	699139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199022
18489	NC_005835	GGC	2	6	699145	699150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46199022
18490	NC_005835	G	6	6	699175	699180	0 %	0 %	100 %	0 %	46199022
18491	NC_005835	TGGAGG	2	12	699220	699231	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46199022
18492	NC_005835	CCT	2	6	699245	699250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46199022
18493	NC_005835	CCG	2	6	699269	699274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46199022
18494	NC_005835	G	6	6	699302	699307	0 %	0 %	100 %	0 %	46199022
18495	NC_005835	ACC	3	9	699321	699329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46199022
18496	NC_005835	AGG	2	6	699331	699336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46199022
18497	NC_005835	GGGCCT	2	12	699347	699358	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	46199022
18498	NC_005835	C	7	7	699364	699370	0 %	0 %	0 %	100 %	46199022
18499	NC_005835	CCGCC	2	10	699385	699394	0 %	0 %	20 %	80 %	46199022
18500	NC_005835	CTT	2	6	699404	699409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46199022

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